En el ámbito de la metodología de la ciencia, tanto como en el de la filosofía moderna, existe un importante debate respecto al programa metodológico de Locke. Algunas interpretaciones consideran a este autor como un inductivista estricto dispuesto a admitir sólo leyes con contenido empírico, en tanto que otras defienden que Locke abogó por el uso de hipótesis sobre inobservables, a pesar de que no recomendó método alguno para su construcción