Otra er overvåket siden 1980. Hovedformålet med overvåkingen er å registrere eventuelle endringer i forurensningssituasjonen, spesielt i den nedre delen av elva. Industriutslippene fra Vennesla-området er kraftig redusert i de senere år, og i juni 1995 ble det etablert en avskjærende industriavløpsledning som fjernet alle sure utslipp og det meste av KOF-utslippene til Otra. Det ble i 1996 registrert en ytterligere økning i gjennomsnitts-pH nedstrøms Vennesla, samt reduserte konsentrasjoner av organisk stoff og fosfor sammenlignet med tidligere år. Den kontinuerlige pH-overvåkingen ved Vigeland dokumenterte imidlertid korte episoder med svært surt vann i elva (pH>5,0) og episoder med svakt basisk vann (pH>8,0). Seks av ti stasjoner i nedre del av Otra hadde i 1996 god badevannskvalitet, tre hadde mindre god-, og en hadde ikke akseptabel vannkvalitet for bading. Nedstrøms Vennesla har den tidligere meget markerte soppveksten av Fusarium aqueductum forsvunnet. Begroingssamfunnet er i ferd med å normalisere og vanlige begroingsorganismer er under etablering. Bunndyrsamfunnets oppbygning på stasjonen nedstrøms Vennesla bærer imidlertid fortsatt preg av overgjødsling og forsurin
