Antimikrobielle Peptide als Teil des angeborenen Immunsystems werden in die Atemwegssekrete der Lunge sezerniert. Hauptvertreter sind LL-37 und hBD-2. Im Fall einer ambulant erworbenen Pneumonie werden diese in signifikant höherem Ausmaß produziert. Zusätzlich bestehen signifikante Korrelationen mit klinischen, mikrobiologischen und labor-chemischen Parametern