Caracterização genética de isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense e desenvolvimento de um marcador SCAR para identificação de suscetibilidade ao mal-do-panamá da bananeira
Tese (doutorado) - Universidade Federal de Santa Catarina, Centro de Ciências Agrárias, Programa de Pós-Graduação em Recursos Genéticos Vegetais, Florianópolis, 2014.O mal-do-panamá, causado por Fusarium oxysporum f. sp. cubense (Foc), é uma doença endêmica em todas as regiões produtoras de banana, sendo citado como uma das seis doenças mais importantes de plantas cultivadas e responsável por grandes perdas econômicas. O cultivo da bananeira em Santa Catarina sofre com essa doença e uma das estratégias usadas no seu controle é a substituição das cultivares do subgrupo Prata, consideradas suscetíveis ao fungo, pelas cultivares do subgrupo Cavendish, devido a sua maior resistência. Nos últimos anos, no entanto, essa estratégia vem sendo questionada em função da ocorrência de focos de Foc nos bananais de cultivares do subgrupo Cavendish. Tendo em vista a importância da bananicultura no Sul do Brasil, região subtropical, a constatação do avanço da doença e o aumento de focos do mal-do-panamá em bananais de cultivares do subgrupo Cavendish nessa região, este trabalho teve como objetivo caracterizar isolados de Fusarium oxysporum f. sp. cubense coletados de cultivares de bananeira dos subgrupos Prata e Cavendish e desenvolver um marcador SCAR associado à suscetibilidade ao mal-do-panamá. Avaliou-se uma população de 152 isolados de Foc coletados em 13 regiões produtoras de banana do Estado de Santa Catarina por meio de características morfológicas, níveis de agressividade, utilização de marcadores moleculares microssatélites e intermicrossatélites (SSR, ISSR) e também pelo sequenciamento do fator de alongação TEF 1a. A patogenicidade foi confirmada para todos os isolados, e os critérios morfológicos confirmaram a identidade do fungo. Em relação aos níveis de agressividade, foi possível classificar os isolados em três grupos distintos, considerados como pouco agressivo moderadamente agressivo e agressivo. Quando utilizamos as técnicas moleculares, observou-se que os resultados de ISSR, SSR e sequenciamento TEF 1a revelaram uma menor variação entre os isolados analisados, sendo que, a maioria apresentou 100% de similaridade interna. Entre esses marcadores, ISSR + SSR foi o mais polimórfico, sendo capaz de diferenciar mais indivíduos e com uma maior percentagem de dissimilaridade. Na segunda etapa desse trabalho, aplicando-se 78 iniciadores arbitrários em DNA genômico de genótipos resistentes e suscetíveis, uma banda de RAPD associada à susceptibilidade foi selecionada e usada para gerar o iniciador SCAR SuscPD-F/SuscPD-R. Este marcador foi validado em 28 cultivares de bananeira e os resultados indicaram um elevado grau de especificidade do marcador, o qual foi capaz de discriminar entre os dois grupos de contraste resistentes ou suscetíveis com um poder12discriminatório de 93%. Os resultados obtidos poderão apoiar os trabalhos de melhoramento genético da cultura, acelerando a seleção e o desenvolvimento de cultivares com maior nível intrínseco de resistência às infecções e melhorias nas técnicas de controle à doença. Esse trabalho representa uma contribuição na caracterização de Foc e no estudo de resistência da bananeira em áreas subtropicais, onde há até o momento uma carência de resultados e ferramentas nesta área
