Živé bakterie, sinice, houby, prvoci, řasy, drobní živoč ichové a rostliny, popř. jejich vývojová stadia, jsou špatně pozorovatelní ve světelném mikroskopu z důvodu slabého vlastního zabarvení nebo blízkosti indexu lomu světla jejich těla indexu lomu prostředí (voda, fyziologický roztok, kultivační medium atd.)