Het Top Institute Food and Nutrition (TIFN) is een samenwerkingsverband tussen publieke en private partners dat zich bezighoudt met wetenschappelijke doorbraken in voeding en gezondheid. Het in opdracht van TIFN ontwikkelde Tiffany is een research management systeem dat ontworpen is om elk stadium van wetenschappelijk onderzoek in detail te kunnen documenteren en ontsluiten. Uitleg wordt gegeven van de mogelijkheden, de voordelen en de architectuur van Tiffan

Brakel, R.P., van

Broekstra, J.

Polet, I.

Timmer, M.J.

Top, J.L.

Dutch

van Brakel, R.P.

NARCIS 

Tiffany : research management in voedingsonderzoek

Wageningen Yield 

december 2008 @gro-Informatica 3
Introductie
Een van de grote uitdagingen waar onderzoeker en producen-
ten van voedsel en voeding zich mee geconfronteerd weten is 
de ‘gezonde keuze’ ook de ‘makkelijke keuze’ te maken. Om 
deze uitdaging aan te gaan is het van belang dat industrie en 
onderzoeksorganisaties kennis en capaciteit voor multidisci-
plinair onderzoek delen. Het Top Institute Food and Nutrition 
(TIFN) is een samenwerkingsverband tussen publieke en pri-
vate partners dat zich bezighoudt met wetenschappelijke 
doorbraken in voeding en gezondheid.
Een belangrijke missie van TIFN is kennisoverdracht tussen 
onderzoekers en tussen de verschillende partners van het 
instituut. Kennisoverdracht en kennisborging zullen gefaci-
liteerd moeten worden via systemen die voor onderzoekers 
op locatie toegankelijk zijn.
Tiffany is een research management systeem (RMS), ont-
wikkeld in opdracht van TIFN door A&F (onderdeel van 
Wageningen UR).
research Management met tiffany
Het principe achter Tiffany is dat wetenschappelijk onder-
zoek een proces is dat in meerdere fasen, activiteiten en pro-
ducten opgedeeld kan worden. Het procesmodel van Tiffany 
reflecteert deze filosofie (zie Figuur ).
Centraal in het procesmodel van Tiffany staat de onderzoeks-
vraag. De onderzoeksvraag is vaak een natuurlijk gevolg van 
een probleem, en het doel van wetenschappelijk onderzoek 
is een antwoord te geven op de onderzoeksvraag dan wel een 
conclusie over een oplossing voor het originele probleem.
Het proces dat uiteindelijk leidt tot een conclusie kan onder-
verdeeld worden in een aantal soorten activiteiten: voorbe-
reidende activiteiten (zoals verwerking of ‘processing’ van 
te onderzoeken monsters), daadwerkelijke experimenten 
(bijvoorbeeld metingen, observaties, gedragsstudies, enzo-
voort), analyse van de experimentele data, en rapportage 
(zoals technische rapporten, conclusies, publicaties, enzo-
voort). In deze activiteiten zit een natuurlijke progressie: 
voorbereidende activiteiten vinden plaats vooraleer de expe-
rimenten worden uitgevoerd, de uitkomsten van een expe-
riment leiden tot een analyse, en rapportage van resultaten 
vindt aan het eind plaats. Het model biedt echter de flexibi-
liteit om de activiteiten op complexere wijze te laten inter-
acteren: zo kan de uitkomst van een experiment aanleiding 
zijn voor een nieuw experiment of zelfs een nieuwe onder-
zoeksvraag, en kunnen activiteiten parallel of in sequentie 
plaatsvinden of in bepaalde gevallen zelfs compleet overge-
slagen worden.
Het procesmodel wordt gereflecteerd in de Tiffany webappli-
catie (zie Figuur 2). Deze applicatie biedt de gebruiker een 
interface waarbij het startpunt een hiërarchie van onder-
zoeksvragen is. Onderzoekers die hun lopende onderzoek 
documenteren starten door een onderzoeksvraag te formu-
leren en deze een positie in de hiërarchie toe te kennen. 
Vervolgens kan de onderzoeker aan deze onderzoeksvraag 
activiteiten, producten, methoden en protocollen en andere 
voor zijn onderzoek relevante informatie koppelen.
Vertrouwelijkheid
Het uitgangspunt van Tiffany is dat onderzoe-
kers gedetailleerde informatie over hun onder-
zoek kunnen uitwisselen en hergebruiken. 
Hierbij dient in aanmerking genomen te worden 
dat veel van deze informatie in meer of mindere 
mate vertrouwelijk is: sommige gegevens zal een 
onderzoeker (nog) met niemand willen delen, 
andere gegevens zijn alleen bestemd voor het 
eigen onderzoeksteam, weer andere zijn min 
of meer publiek. Tiffany biedt vergaande onder-
steuning voor deze verschillende niveaus van 
vertrouwelijkheid: elk informatie-item kan een 
status toegekend worden: draft items zijn alleen 
zichtbaar voor de onderzoeker zelf, shared items 
tiFFany: research management in  
Voedingsonderzoek
Jeen Broekstra, Remko van Brakel, Mariëlle Timmer, Ilse Polet en Jan Top
Wageningen UR – Information Management
http:///www.afsg.nl/InformationManagement
Figuur	1:	Het	Tiffany	procesmodel
WageningenUR– AFSG
foradvancedknowledgebasedsolutions
Neemvoormeerinformatieofeenvrijblijvendgesprekcontactmetonsop.
GreenVision
Rick.vandeZedde@wur.nl
0317480156
www.greenvision.wur.nl
InformationManagement
Jan.Top@wur.nl
0317480212
www.afsg.nl/IM
Wie zijn wij?
WageningenUR– AFSGisdeonderzoeksorganisatievoorkennisontwikkelingenkennisoverdrachtophetgebiedvanduurzame
toepassingen van agrogrondstoffen. We richten ons hierbij op veilige en gezonde food & nonfood producten. Information
ManagementenGreenVisionzijntweeonderdelendiezichbezighoudenmetICTvraagstukkenopditterrein.
Weontwerpenenimplementerengeavanceerdeoplossingenvoorkennisdelingenprocesautomatiseringbinnenuwbedrijf.Onze
achtergrondisdivers:informatiekunde,artificialintelligence, elektrotechniek,softwareengineering,agrotechnologie.Daarnaast
hebbenwesectorspecifiekekennisinhuis.Ukuntbijonsterechtmetnieuwe,complexevraagstukken.Wegaanvooruenmetu
op zoek naar een creatieve en innovatieve oplossing voor uw probleem. We zijn er trots op dat we concrete en
gebruiksvriendelijkeapplicatiesontwikkelen;voormultinationals,maarookvoorkleineenmiddelgrotebedrijvenindeagrifood
sector.Dusvooru!
Information Management
We hebben een passend antwoord op uw vragen rondom
innovatie en verbetering van uw bedrijfsprocessen.
Information Management kent drie pijlers: kennisdelen,
kennismodelleren en webapplicaties. Hoe voorkomt u
datdeknowhowverlorengaatvaniemanddieuworganisatie
verruiltvooreenandere?Hoezorgtudatuworganisatieleert
vanervaringen?Hoeboektuhetbestezoekresultaatalshet
gaatomkennisopgeslagenbinnenuworganisatieofophet
internet?Omditsoortvragen tebeantwoorden,combineren
wegeavanceerdekennisoverSemanticWebtechnologie
met ruime ervaring binnen uw sector. Zo helpen we u uw
processenteverbeterenenteoptimaliseren.
GreenVision
Bij GreenVision, het expertisecentrum voor beeldverwerking,
draait het allemaal om beeld. We ontwerpen en ontwikkelen
inlineinspectiesystemendiemeteenzeerhogesnelheidhun
werk doen.Driedimensionale enmultispectrale beeldver
werkingzijn hierbij speerpunten.We zetten deze vormen van
beeldverwerking in bij de beoordeling, kwalificatie en selectie
van allerlei natuurlijke producten. Potplanten, tomaten
kiemplanten,eierenenfrietzijneengreepuitdeveleproducten
waarbij we dat doen.De uitkomsten diewij bieden blijven niet
binnen de grenzen. De eiersorteermachine bijvoorbeeld die
GreenVisionsamenmeteenmachinebouwerontwikkelde,wordt
wereldwijdverkocht.
4 @gro-Informatica december 2008
zijn voor de onderzoeker en zijn projectteam toegankelijk, 
approved items zijn voor alle onderzoekers binnen het insti-
tuut toegankelijk, en public items zijn ook voor de partneror-
ganisaties van het instituut beschikbaar.
de architectuur van tiffany
Zoals geïllustreerd in de voorgaande secties is Tiffany een web-
gebaseerde applicatie. Tiffany is ontwikkeld in ASP/.Net. De 
applicatie kent een meerlaagse architectuur (zie Figuur 3).
De backend van Tiffany is het Sesame RDF framework. 
Door semantische technologie zoals RDF/OWL2 te gebruiken 
wordt de flexibiliteit van het systeem drastisch vergroot: het 
procesmodel is uitgedrukt als een OWL ontologie en gebruik 
van Sesame stelt ons in staat dit semantisch model direct te 
gebruiken als model voor opslag en retrieval van informa-
tie. Daarnaast biedt deze aanpak de mogelijkheid om andere 
thesauri, vocabulaire-definities en ontologieën toe te voegen 
aan het systeem, om op die manier annotatie en intelligent 
zoeken mogelijk te maken.
De Tiffany applicatie communiceert met Sesame via een 
REST protocol over HTTP, waarbij gebruik wordt gemaakt 
van de querytaal SPARQL3 om informatie uit de Sesame data-
base op te halen. In de applicatie kunnen drie lagen onder-
scheiden worden: de grover security layer is een component 
dat op basis van rollen en toegekende permissies bepaalt of 
query- en manipulatie-operaties op de database zijn toege-
staan. De Grover business object wrapper is een abstractielaag 
die het mogelijk maakt om data in het graafmodel van RDF 
direct te interpreteren als Business Objecten: door gebruik 
van deze abstractielaag hoeft de ontwikkelaar niet meer zelf 
SPARQL queries te schrijven, maar is het mogelijk om van-
uit de user interface met de backend te communiceren in 
Object-Oriented termen: de wrapper biedt bijvoorbeeld een 
1	 	Zie	http://www.openrdf.org/
	 	Zie	o.a.	http://www.w.org/001/sw/
	 	Zie	http://www.w.org/TR/rdf-sparql-query/
klasse ‘Experiment’ 
(met properties als 
‘name’, ‘descripti-
on’, enzovoort). De 
user interface kan 
instanties van deze 
klasse aanmaken, 
ophalen, verande-
ren en opslaan zon-
der dat gedetailleer-
de kennis van het 
onderliggende RDF/
OWL model of van 
de SPARQL query-
taal noodzakelijk is.
Uitrol en toe-
komstplannen
Momenteel is uitrol 
van de eerste versie 
van het Tiffany systeem in volle gang binnen TI Food and 
Nutrition. Naast de technische aspecten van het systeem zelf 
ligt de nadruk hierbij op bekijken en aanpassen van bedrijfs-
processen. Om het project te laten slagen is meer nodig dan 
een slim stukje software: een belangrijk punt van aandacht 
is dan ook voorlichting van de onderzoekers die ermee moe-
ten gaan werken en hen bewust te maken van de noodzaak 
van het borgen van informatie ten bate van kennisuitwisse-
ling en -preservatie.
Daarnaast worden de onderzoekers ook direct betrokken bij 
verdere ontwikkeling van het systeem. Een groep van user 
representatives komt maandelijks bijeen om te overleggen 
met het ontwikkelteam, suggesties voor verbeteringen en 
wensen neer te leggen, en om feedback te geven op nieuwe 
mogelijkheden die door het ontwikkelteam worden voorge-
steld. 
Momenteel ligt de nadruk bij verdere ontwikkeling van het 
systeem op uitbreiding van de zoekmogelijkheden. Hierbij 
zal uitgebreid gebruik worden gemaakt van het semantisch 
karakter van de dataopslag: dit stelt ons in staat om zoek- of 
navigatiemogelijkheden aan te bieden die allerlei aspecten 
(of ‘facetten’) van de data vrijelijk combineren en de gebrui-
ker te begeleiden.
conclusie
Tiffany is een research management systeem dat ontwor-
pen is om elk stadium van wetenschappelijk onderzoek 
in detail te kunnen documenteren en ontsluiten. Het 
gebruik van semantische technologie als RDF en OWL 
stelt ons in staat om zeer flexibel om te gaan met veran-
deringen in processen, om simpel bestaande vocabulai-
res te integreren en om geavanceerde exploratieve navi-
gatie op de informatie te bieden. Naast ontwikkeling van 
het systeem op zich wordt veel aandacht besteed aan het 
inbedden van het systeem in de bedrijfsprocessen bij TI 
Food and Nutrition. 
Figuur	:	Tiffany	screenshot
Data Storage
Metadata Storage
Sesame RDF Framework
Grover Business Object Wrapper
Tiffany Web Application
Grover Security Layer
Figuur	:	Tiffany	architectuur


Tiffany : research management in voedingsonderzoek

Abstract

Similar works

Full text

Available Versions

NARCIS

Wageningen Yield