In 2004 is er door het voormalige ministerie van LNV veel inspanning gedaan om natuur mee te laten nemen in maatschappelijke kosten-batenanalyses (MKBA). Hierdoor is de leidraad voor kosten-batenanalyses aangevuld met een nadere beschrijving hoe de effecten voor natuur kunnen worden meegenomen. Het blijkt dat in MKBA's natuur vaak als p.m. post wordt meegenomen. Een reden is dat de onderzoeker vindt dat natuur niet gewaardeerd kan worden. De natuurpuntenmethodiek wordt gepresenteerd als een methode om met 'zwakke waarden' zoals de effecten van wegaanleg of stadsuitbreiding op natuur, in MKBA's om te gaan. De natuurpuntenmethodiek zou een oplossing moeten bieden om natuur beter op te nemen in een MKBA