Phenotypic characterization of antimicrobial resistance of B-lactamase AmpC-producing Escherichia coli and Klebsiella pneumoniae isolates with decreased susceptibility to Cefoxitin in a national hospital during 2019, Lima-Peru

Abstract

Introducción: La resistencia antimicrobiana (RAM) es un problema de salud pública que afecta a nivel global, y que se asocia a elevados costos médicos, mayor número de atenciones médicas, mayor estancia hospitalaria y aumento de mortalidad. La caracterización de bacterias genera información epidemiológica útil para el control de la RAM a nivel comunitario y nosocomial. Objetivo: Caracterizar fenotípicamente la resistencia antimicrobiana de aislamientos de E. coli y K. pneumoniae con sensibilidad disminuida a cefoxitina en un hospital nacional durante el periodo 2019, Lima-Perú. Explorar diferencias de la resistencia de acuerdo con características de los pacientes, servicio de referencia y el periodo de aislamiento. Material y método: Durante el 2019, se identificaron un total de 136 E. coli y 57 K. pneumoniae con sensibilidad disminuida a Cefoxitina. La caracterización de AmpC será realizada mediante el método de Hodge tridimensional, método de potenciación de AmpC, método de Ácido Fenil Borónico, y método fenotípico simple para diferenciar entre AmpC cromosómico y plasmídico. La caracterización de la RAM será realizada mediante un método automatizado que determinará la concentración mínima inhibitoria para antimicrobianos usados en la práctica clínica. Se explorará asociación bivariadas previa evaluación de supuestos. Se reportará intervalos de confianza al 95% y se considerará un valor de p<0.05 como estadísticamente significativo.Antimicrobial resistance (AMR) is a global public health problem associated with high medical costs, increased medical care, longer hospital stays and increased mortality. Bacterial characterisation generates epidemiological information useful for the control of AMR at community and nosocomial levels. Objective: To characterise phenotypically the antimicrobial resistance of E. coli and K. pneumoniae isolates with decreased sensitivity to cefoxitin in a national hospital during the period 2019, Lima-Peru. To explore differences in resistance according to patient characteristics, referral service and isolation period. Methods: During 2019, a total of 136 E. coli and 57 K. pneumoniae with decreased sensitivity to Cefoxitin were identified. AmpC characterisation will be performed using the three-dimensional Hodge method, AmpC potentiation method, Phenyl Boronic Acid method, and simple phenotypic method to differentiate between chromosomal and plasmid AmpC. AMR characterisation will be performed using an automated method that will determine the minimum inhibitory concentration for antimicrobials used in clinical practice. Bivariate associations will be explored after assessment of assumptions. 95% confidence intervals will be reported and a value of p<0.05 will be considered statistically significant