Introdução: O SARS-CoV-2, causador da pandemia por Doença por Coronavirus 2019 (COVID-19) gerou desafios à saúde pública, principalmente pelo conhecimento escasso de sua patogênese, e de estratégias terapêuticas e preventivas eficazes. Diversas lacunas de conhecimento sobre a doença envolvem a contribuição de fatores de risco, as doenças concomitantes, os fatores genéticos e imunogenéticos, no direcionamento da resposta imune, bem como a hiperinflamação, a imunidade antiviral e os alelos dos antígenos leucocitários humanos (HLAs) dos pacientes, que estão relacionados ao desfecho da doença. Objetivo: Esta revisão integrativa objetivou aprofundar os conhecimentos sobre os mecanismos de imunidade relacionada aos fatores de risco, da hiperinflamação e da tempestade de citocinas decorrente da infecção por SARS-CoV-2, bem como os avanços de associação dos HLAs nos agravos da doença. Metodologia: A revisão integrativa foi realizada utilizando os descritores nas bases de dados PubMed, SCIELO, CINAHL, SCOPUS, Web of Science, MedNar, Portal periódicos CAPES e Open Journal System, sem limites de janela cronológica. Resultados: Os efeitos da pandemia e os esforços na busca do conhecimento sobre a patogênese da COVID-19 resultaram em avanço no combate da doença. Conseguiu-se relacionar fatores de risco como obesidade, hipertensão, diabetes, doenças renais crônicas, idade, gênero, e outras condições predisponentes ao agravo da doença. Sob o aspecto da patogênese, também houveram progressos no entendimento dos mecanismos celulares e humorais em resposta à doença, bem como conseguiu vincular a resposta da hiperinflamação e o perfil dos HLAs dos pacientes à evolução da doença ao óbito ou à convalescência. Conclusão: Os esforços científicos conjuntos e os avanços na compreensão dos mecanismos da doença conseguiram estabelecer estratégias de combate a COVID-19, resultando no fim da pandemia, porém ainda há avanços que devem ser alcançados para o combate das sequelas dos pacientes convalescentes e para minimização da COVID longa e seus prejuízos
