DNA-Barcoding e aprendizado de máquina no alinhamento e localização de Primers para o reconhecimento de cianobactérias / DNA-Barcoding and machine learning in the alignment and localization of Primers for the recognition of cyanobacteria

Abstract

A Bioinformática é uma área que vem ganhando visibilidade para a previsão de doenças através do DNA (Ácido desoxirribonucleico). Esta área sempre esteve diretamente associada à biologia molecular, campo da biologia responsável por estudar a estrutura e as funções do material genético, bem como as proteínas, que são os resultados obtidos em uma síntese de DNA. A área da Genômica é um ramo da bioquímica que estuda o genoma completo de um organismo. Com a evolução das tecnologias de informação, torna-se possível a manipulação de um grande volume de dados e isso tem permitido que os estudiosos da área obtenham cada vez mais rapidamente seus resultados. A genômica e suas derivadas são áreas de investigação alicerçadas na geração de um grande volume dados que tem aumentado exponencialmente ao longo dos anos. As técnicas de DNA-Barcoding e Aprendizado de Máquina tendem a auxiliar ainda mais os pesquisadores da área, buscando soluções rápidas e inteligentes. Assim, este trabalho uniu as técnicas de DNA-Barcoding e Aprendizado de Máquina, com a técnica de agrupamento, cujo aprendizado é não supervisionado, para o sequenciamento e identificação de Cianobactérias. A metodologia incluiu bibliometria quantitativa e qualitativa para busca e análise de trabalhos relacionados; modelagem e desenvolvimento do sistema de sequenciamento e reconhecimento de cianobactérias; implementação do BLAST (que realiza o alinhamentos de sequência de DNA), do sequenciamento pelo DNA-Barcoding, da identificação das regiões de primers e do agrupamento das sequências; realização de testes e ajustes no sistema. A partir dos resultados obtidos, destaca-se a velocidade de execução de todo o processo, desde o BLAST inicial até o BLAST final, bem como a busca pelos Primers e o agrupamento