Low prevalence of HIV-1 integrase resistance among antiretroviral-naive patients newly diagnosed with HIV-1 from Belém, Pará, Amazon region of Brazil

Abstract

Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Programa de Pós-graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Programa de Pós-graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Programa de Pós-graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Programa de Pós-graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Programa de Pós-graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brazil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Programa de Pós-graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brazil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Laboratório de Bioinformática. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Laboratório de Bioinformática. Ananindeua, PA, Brasil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Laboratório de Bioinformática. Ananindeua, PA, Brasil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Exatas e Naturais. Laboratório de Bioinformática e Computação de Alto Desempenho. Belém, PA, Brazil.Ministério da Saúde. Secretaria de Vigilância em Saúde. Instituto Evandro Chagas. Ananindeua, PA, Brasil.Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Programa de Pós-graduação em Biologia de Agentes Infecciosos e Parasitários. Belém, PA, Brazil / Universidade Federal do Pará. Instituto de Ciências Biológicas. Laboratório de Virologia. Belém, PA, Brazil.We described the HIV-1 subtypes and the frequency of resistance mutations in HIV-1 integrase region among antiretroviral-naive patients with HIV/AIDS from Belém, Pará, Amazon region of Brazil. The partial integrase gene sequence of 59 antiretroviral-naive HIV-1 infected patients was amplified and sequenced. Genotypic analyses revealed the absence of major resistance-associated mutations to integrase but minor polymorphic mutations were present in 44.1% of patients and M50I polymorphism was the more prevalent