Στην παρούσα διπλωματική εργασία αναπτύσσονται κυτταρικά μοντέλα προσομοίωσης, με σκοπό την μελέτη βιολογικών φαινομένων όπως η κυτταρική επικοινωνία (μέσω ανταλλαγής χημικών ουσιών), η επίτευξη ανοσίας σε ένα σύστημα που εμπεριέχει κύτταρα με ανοσοποιητική δράση, η εμφάνιση ανοσολογικής απόκρισης και η συμπεριφορά της έναντι διαφορετικών νοσογόνων παραγόντων όπως τοξικές ουσίες, ενδοκυττάρια παράσιτα και εξωκυττάρια παράσιτα. Εξετάζεται επίσης η εμφάνιση πιο πολύπλοκων συμπεριφορών στο σύστημα όπως η ανοσολογική μνήμη και η αυτο-άνοση αντίδραση. Η σχεδίαση όλων των μοντέλων έγινε με βάση τις αρχές των εξατομικευμένων μοντέλων προσομοίωσης (Agent Based Models) και η γλώσσα προγραμματισμού που χρησιμοποιήθηκε για την υλοποίηση τους ήταν η JAVA.In the context of this thesis, cellular simulation models are developed, in order to study biological phenomena such as cellular communication (through exchange of chemical substances between cells), the occurrence of immunity inside a system that contains immune cells, the emergence of an immunological response and its behavior against various disease agents such as toxic substances, intracellular parasites and extracellular parasites. In addition, the emergence of more complex system behaviors is studied, like immunological memory and an autoimmune response. The creation of all the models was based on the principles of Agent Based Model design and the programming language that was used for the implementation of the models was JAVA
