Investigation of genetic diversity of the white grouper [Epinephelus aeneus (Geoffroy Saint-Hilaire, 1817) ] by using microsatellite markers

Abstract

This study aims to detect the genetic diversity of economically important white grouper, the fish that has been announced as near threatened in the Red List issues of the IUCN. The tissue samples, used in the study, have belonged to the individuals of Epinephelus aeneus, captured and sold around Antalya, Iskenderun, Fethiye, Izmir and Istanbul regions of Turkey by fishermen. The DNA samples, isolated from the tissues were multiplied by microsatellite markers, marked by FAM dye. After determining the allele sizes by Peak Scanner, the frequency analyses of these sizes were processed by Poptree, PHYLIP, Treeview and Arlequin programmes. Regarding the results, the genetic diversity of E. aeneus has well been detected to be considerably high and exposed no bottleneck effectBu tez çalışmasında, IUCN’in Kırmızı Listesine göre, soyu tehdide yakın olarak sınıflandırılan, yüksek ekonomik değere sahip beyaz lahoz balığının (Epinephelus aeneus) genetik çeşitliliğini tespit etmek hedeflenmiştir. Çalışmada kullanılan doku örnekleri; Antalya, Ġskenderun, Fethiye, Ġzmir ve Ġstanbul bölgelerindeki balık satıcılarından toplanan Epinephelus aeneus bireylerinden alınmıştır. Örnek dokulardan izole edilen DNA’lar, FAM boyası ile işaretlenmiş mikrosatelit markörler yardımıyla çoğaltılmıştır. Alel büyüklükleri, Peak Scanner programı kullanılarak belirlendikten sonra, bu büyüklüklerin frekans değerlerinin analizleri, Poptree, PHYLIP, Treeview ve Arlequin programları ile yapılmıştır. Elde edilen sonuçlar doğrultusunda, E. aeneus türünün genetik çeşitliliğinin oldukça yüksek olduğu tespit edilmiş ve dar boğaz etkisinde olmadığı görülmüştü

    Similar works