Keuangan menjadi elemen pokok dalam pendekatan manajemen lembaga pendidikan. Pengelolaan keuangan dilaksanakan dengan dengan manajemen pembiayaan. Pandemi Covid-19 menjadi tantangan dalam pengelolaan keuangan pada lembaga pendidikan pesantren, dibutuhkan suatu manajemen pembiayaan yang tangguh untuk menjawab problem keuangan. Penelitian ini bertujuan untuk menganalisis dan mendeskripsikan manajemen pembiayaan dalam tata kelola pesantren pada masa Covid-19 di pesantren Daarul Ilmi Muhammadiyah Tarakan. Metode penelitian kualitatif deskriptif digunakan oleh peneliti untuk menjawab masalah penelitian. Teknik pengumpulan data, menggunakan teknik observasi, wawancara, dan dokumentasi. Informan dipilih dengan teknik purposive sampling. Analisis data dilakukan degan teknik analisis kualitatif melalui tahapan reduksi data, penyajian data, dan kesimpulan. Hasil penelitian menunjukkan kegiatan manajemen pembiayaan dilaksanakan dengan perencanaan pembiayaan, pelaksanaan pembiayaan, dan evaluasi pembiayaan. perencanaan pembiayaan dilakukan dengan menyusun anggaran berbasis kegiatan yang dilaksanakan selama masa pandemi Covid-19 dengan prinsip efisiensi mempertimbangkan masukan dari pemerintah, orang tua, unit bisnis pesantren dan lembaga donasi sosial. Pelaksanaan pembiayaan dilaksanakan dengan menyeimbangkan antara penerimaan dan pelaksanaan kegiatan berikut pengeluaran keuangannya. Hal tersebut dilakukan dengan kegiatan pembukuan keuangan yang juga diatur dalam standar operasional prosedur keuangan. Evaluasi keuangan dilaksanakan dengan evaluasi terhadap rencana dan implementasi pembiayaan program atau kegiatan yang pada pelaksanaanya dilakukan oleh tim monitoring dan evaluasi independen
