Introdução: Variações do número de cópias (CNV) no cromossoma X estão associadas a diversas doenças, nomeadamente perturbações no neurodesenvolvimento. Várias regiões suscetíveis de doença foram identificadas no cromossoma X, alguns já associados a síndromes genéticos conhecidos, outros carecem de identificação. Array comparative genomic hybridization (aCGH) é um método útil pra identificar CNVs patogénicos ou provavelmente patogénicos num grupo de doentes. O objetivo principal deste estudo é mostrar uma correlação entre o genótipo e o fenótipo em CNVs presentes no cromossoma X.
Métodos: O estudo utilizou a base de dados de aCGH do Departamento de Genética da Faculdade de Medicina e os registos clínicos de dois hospitais. Doentes com CNVs patogénicos ou provavelmente patogénicos no cromossoma X foram incluídos no estudo. Bases de dados e literatura relacionada foram usados para uma melhor compreensão da corrleção genótipo-fenótipo.
Resultados: De 2852 doentes estudados com recurso à técnica de aCGH, em 42 foram identificados CNVs clinicamente relevantes no cromossoma X: 47,62% foram classificados como provavelmente patogénico e 52,38% como patogénicos. Os 20 pacientes classificados como provavelmente patogénicos: 5% são referentes a material prenatal, enquanto 95% foi realizado no contexto pós-natal. Relativamente aos 22 CNVs patogénicos, 41% são relativos a casos pré-natais enquanto 59% são pós-natais. As regiões cromossómicas Xp22.31, Xp22.32 e Xq28 são as que mais frequentemente apresentam CNVs. As regiões Xp11.22, Xp11.3 e Xq11.2 também mostraram diversos CNVs relevantes.
Conclusões: Com este estudo, contribuímos para uma melhor compreensão dos CNVs associados a patologia no cromossoma X, especialmente aqueles relacionados com perturbações do neurodesenvolvimento, permitindo um diagnóstico mais preciso, melhorando o aconselhamento genético, especialmente no diagnóstico pré-natal.Introduction: Copy number variants (CNVs) on X chromosome are associated with several
human diseases, especially impairment of the neurodevelopment. Several disease susceptibility
regions have been identified on X chromosome, some already associated with known genetic
syndromes, nonetheless others remain to be clarified. Array comparative genomic
hybridization (aCGH) is a useful method to access pathogenic or likely-pathogenic CNVs in a
clinical population. The main goal of this study was to provide a genotype-phenotype
correlation focused on CNVs present on the X chromosome.
Methods: A cross-sectional study was performed using the aCGH database of the Genetic
Department of the Faculty of Medicine and clinical records from hospitals database. Patients
with pathogenic or likely pathogenic CNVs on chromosome X were included in the study.
Databases and related literature were used for a better understanding of the genotypephenotype correlation.
Results: From 2852 patients studied using aCGH, 42 presented clinically relevant CNVs on X
chromosome: 47,62% were classified as likely pathogenic and 52,38% as pathogenic. Among
the 20 likely pathogenic CNVs, 5% were identified in the prenatal context, while 95% were
postnatal. Concerning to the 22 pathogenic CNVs, 41% were prenatal cases and 59% were
postnatal cases. Chromosomal regions Xp22.31, Xp22.32 and Xq28 exhibited a higher
incidence of CNVs. Frequently Xp11.22, Xp11.3 and Xq11.2 regions showed clinically
relevant CNVs.
Conclusions: We contributed for a better understanding of the disease-associated CNVs on the
X chromosome, especially those related with neurodevelopment disorders, allowing a more
accurate diagnosis, improving genetic counseling namely in prenatal diagnosis setting
