Introducción: La coordinación entre niveles asistenciales es una prioridad para los sistemas de salud. Esta representa un objetivo intermedio de Redes Integradas de Servicios de Salud (RISS) para alcanzar calidad y eficiencia de la atención. En Colombia ha sido poco estudiada. El objetivo es analizar la percepción de médicos con relación a la coordinación entre niveles de atención y sus factores asociados en dos RISS públicas de Bogotá. Métodos: Estudio transversal con aplicación del cuestionario COORDENA-CO a una muestra de 363 médicos de distintos niveles asistenciales pertenecientes a las redes estudiadas (Red-1=181; Red-2=182). Se realizaron análisis descriptivos y multivariados para analizar los factores asociados a la percepción de coordinación asistencial. Resultados: Se reconoce poca transferencia de información (Red-1=39.2%; Red-2=48.4%), bajo acuerdo en tratamientos prescritos entre distintos niveles (Red-1=40.9%; Red-2=44.5%), falta de recomendaciones a niveles primarios para el manejo de pacientes (Red-1=32.8%; Red-2=44.8%) y largos tiempos de espera para la atención especializada (Red-1=85.9%; Red-2=77.3%). Factores asociados a una buena percepción de coordinación fueron: ser mujer (95%CI=1.28-1.70), ser mayor de 50 años (95%CI=1.13-2.46), ser especialista (95%CI=1.31-2.70), tener experiencia en el centro inferior a un año (95%CI=1.10-4.30), trabajar menos de 20 horas (95%CI=2.43-2.86), ser de la Red-1 (95%CI=1.00-1.38), disponer de tiempo para la coordinación (95%CI=1.34-1.96), estar satisfecho con el trabajo (95%CI=1.97-3.35) y no identificar limitaciones impuestas por las aseguradoras (95%CI=1.09-2.67). Conclusiones: Se evidenciaron fallas sobre la coordinación entre niveles de atención. Se requieren intervenciones sobre condiciones de empleo, tiempos suficientes y control de límites que imponen aseguradoras, dada su influencia sobre la coordinación.Background: Coordination across healthcare levels is a priority for healthcare systems. It represents an intermediate aim for Integrated Healthcare Networks (IHNs) to find quality and efficiency in care provision. In Colombia, it has been little studied. The aim is to analyze the experience of doctors related to coordination across healthcare levels and its related factors in two public IHNs in Bogotá. Methods: A cross-sectional study was carried out applying the COORDENA-CO questionnaire to a sample of 363 primary and secondary care doctors who worked in the study networks (Network-1=181; Network-2=182). Descriptive and multivariate analyses were conducted to assess the relationship between factors and a perception of care coordination. Results: Doctors perceived a limited information’s transfer (Network-1=39.2%; Network-2=48.4%), a poor agreement in treatments prescribed across levels (Network-1=40.9%; Network-2=44.5%), a scarce specialists’ recommendations to primary care (network-1=32.8%; network-2=44.8%) and long waiting times to secondary care (Network-1=14.1%; Network-2=22.7%). Factors associated with a better general perception of coordination were: being a woman (95%CI=1.28-1.70), being older than 50 years old (95%CI=1.13-2.46), being a secondary care doctor (95%CI=1.31-2.70), having an experience lower than a year (95%CI=1.10-4.30), working lesser than 20 hours (95%CI=2.43-2.86), being of the Network-1 (95%CI=1.00-1.38), considering that there is enough time for coordination (95%CI=1.34-1.96), having job satisfaction (95%CI=1.97-3.35), and recognizing that insurers do not limit clinical practice (95%CI=1.09-2.67). Conclusion: There are fails over coordination across levels of care. It requires strategies oriented in aspects such as employment conditions, enough time and control of insurer’s barriers, due to their influence over care coordination