Prevalence and biological consequence of chromosomally integrated human herpesvirus 6 (HHV-6) in Czech population

Abstract

7 Abstrakt Šestý lidský herpesvirus (HHV-6) je komplexem dvou blízce příbuzných DNA virů: HHV- 6A a HHV-6B. Primoinfekce probíhá už v raném dětském věku ať již ve formě šesté exantémové nemoci, nebo asymptomaticky. Oba viry HHV-6 jsou schopny se rekombinačními mechanismy integrovat do lidského genomu. Tato vlastnost je vzhledem k ostatním lidským herpetickým virům jedinečná. Tato diplomová práce se věnuje studiu Ci-HHV-6 ve zdravé populaci a ve skupině s maligním onemocněním. Testovali jsme 812 pacientů s maligním onemocněním a 420 osob ze zdravé populace. Přítomnost HHV-6 DNA jsme určili pomocí real-time PCR, lokalizaci integrace viru jsme pak detekovali pomocí fluorescenční hybridizace in situ (FISH). Srovnávací studií jsme nezjistili statisticky významný rozdíl ve frekvenci Ci-HHV-6 u pacientů s maligním onemocněním (1,11%) a zdravé kontrolní skupiny (0,95%) (P=0,8). U potvrzených integrací jsme dále prokázali dědičnost tohoto fenoménu u rodinných příslušníků. Pomocí FISH jsme lokalizovali Ci-HHV-6 do telomerických oblastí chromozomů 2 a 18. Otestovali jsme také tvorbu virových proteinů u nosičů Ci-HHV-6 pomocí detekce mRNA. V rámci této práce jsme provedli první epidemiologickou studii výskytu Ci-HHV-6 v populaci zdravých dárců v České republice a zavedli jsme nové metody k lepší charakteristice tohoto...8 Abstract Human Herpes Virus 6 (HHV-6) consists of two closely related DNA viruses: HHV-6A and HHV-6B. The primoinfection proceeds at an early childhood usually as sixth exanthem disease or without any clinical symptoms. Both HHV-6 viruses are able to integrate to human genome using recombinant mechanisms which is unique compared to other human herpesviruses. The aim of the thesis is to study Ci-HHV-6 in a group of patients with malign disease and in the healthy population. We analysed 812 patients with malign disease and 420 healthy subjects from general population. The Ci-HHV-6 was assessed by real-time PCR, the specific localization of Ci-HHV-6 was determined using fluorescent in situ hybridization (FISH). Using comparative study, we did not identify significant difference between frequency of Ci-HHV-6 in patients with malign disease (1.11%) and healthy subjects (0.95%) (P-value 0.8). Consequently, we proved the heritability of Ci-HHV-6 in affected families. We determined the localization of Ci-HHV-6 to telomeric regions of chromosomes 2 and 18. We studied the production of viral proteins in the subjects with Ci-HHV-6. In this work, we conducted the first epidemiological study of Ci-HHV-6 in the Czech Republic. We also introduced novel methods which contribute to better characterization of this phenomenom.Department of Anthropology and Human GeneticsKatedra antropologie a genetiky člověkaFaculty of SciencePřírodovědecká fakult