Genotypic and phenotypic characterization of colorectal carcinomas from the healthcare area of A Coruña and its relation with histopathological associated data
Traballo Fin de Grao en Medicina. Curso 2021-2022Introducción: El cáncer colorrectal es, en la actualidad, el segundo cáncer más frecuente tanto en hombres como en mujeres. La amplia variabilidad genotípica y fenotípica de estos tumores hace interesante su estudio debido a las distinciones que establece en cuanto a su tratamiento, evolución y pronóstico. Objetivo: Estudiar las mutaciones presentadas por los carcinomas colorrectales del área sanitaria de A Coruña diagnosticados entre 2019 y 2021, determinando sus características genotípicas y fenotípicas para estudiar su relación con otros datos histopatológicos. Material y métodos: Se seleccionaron 68 pacientes diagnosticados entre 2019 y 2021 con carcinoma colorrectal en diferentes estadios que fueron diagnosticados y tratados en el CHUAC. Se recogieron datos epidemiológicos de los pacientes. Las muestras utilizadas proceden del servicio de Anatomía Patológica del CHUAC, que fueron obtenidas gracias al Biobanco de A Coruña. Las mutaciones en los genes KRAS, BRAF y NRAS, así como las alteraciones en cuanto al estado de microsatélites, fueron detectadas mediante kits comerciales de Amoy Dx, COBAS e Idylla. La alteración en la expresión de proteínas reparadoras fue determinada mediante inmunohistoquímica. Se utilizó el modelo de correlación de Spearman para el cálculo de la fuerza de asociación entre variables y la dirección de la correlación con la significación estadística determinada a un límite α < 0,05. Resultados: Encontramos correlaciones estadísticamente significativas en nuestra cohorte entre el grado tumoral con el tipo histológico y el estadio, la pérdida de proteínas reparadoras de errores de emparejamiento con el estado MSI, así como la relación de estas dos últimas variables con la localización tumoral. También se encontró correlación entre el estado de expresión de proteínas reparadoras y las mutaciones en KRAS y BRAF. Conclusiones: La pérdida de expresión de proteínas reparadoras de errores de emparejamiento y la inestabilidad de microsatélites afectan aproximadamente a un tercio de los pacientes de nuestro grupo. Los tumores colorrectales con mayor gradación se correlacionan con el tipo histológico mucinoso y con un mayor estadio. La mutación en KRAS es la más frecuente entre nuestros pacientes y se relaciona con la expresión conservada de proteínas reparadoras de errores de emparejamiento. Por último, la mutación en BRAF se asocia con la pérdida de expresión de proteínas reparadoras e inestabilidad de microsatélites, variables asociadas con la localización tumoral derechaIntrodución: O cancro colorrectal é, na actualidade, o segundo cancro máis frecuente tanto en homes coma en mulleres. A extensa variabilidade xenotípica e fenotípica destes tumores fai interesante o seu estudo debido ás distincións que se establecen en canto ao seu tratamento, evolución e prognóstico. Obxectivo: Estudar as mutacións presentadas polos carcinomas colorrectais da área sanitaria de A Coruña diagnosticados entre 2019 e 2021, determinando as súas características xenotípicas e fenotípicas para estudar a súa con outros datos histopatolóxicos. Material e métodos: Seleccionáronse 68 doentes diagnosticados entre 2019 e 2021 con carcinoma colorrectal en diferentes estadios que foron diagnosticados e tratados no CHUAC. Recolléronse datos epidemiolóxicos dos doentes. As mostras utilizadas proceden do servizo de Anatomía Patolóxica do CHUAC, que foron obtidas a través do Biobanco de A Coruña. As mutacións nos xenes KRAS, BRAF e NRAS, así coma as alteracións en canto ao estado de microsatélites, foron detectadas mediante kits comerciais de Amoy Dx, COBAS e Idylla. A alteración na expresión de proteínas reparadoras foi determinada mediante inmunohistoquímica. Utilizouse o modelo de correlación de Spearman para o cálculo da forza de asociación entre variables e a dirección da correlación coa significación estatística a un límite α < 0,05. Resultados: Atopamos correlacións estatisticamente significativas na nosa cohorte entre o grado tumoral co tipo histolóxico e estadio, a perda de proteínas reparadoras de erros de emparellamento co estado MSI, así coma a relación destas dous últimas variables coa localización tumoral. Tamén se atopou correlación entre o estado de expresión das proteínas reparadoras do emparellamento e as mutacións en KRAS e BRAF. Conclusións: A perda de expresión de proteínas reparadoras de erros de emparellamento e a inestabilidade de microsatélites afectan aproximadamente a un terzo dos doentes do noso grupo. Os tumores colorrectais con maior gradación correlaciónanse co tipo histolóxico mucinoso e con maior estadio. A mutación en KRAS é a máis frecuente entre os nosos pacientes e relaciónase coa expresión conservada de proteínas reparadoras de erros de emparellamento. Por último, a mutación en BRAF asóciase coa perda da expresión de proteínas reparadoras e inestabilidade de microsatélites, variables asociadas coa localización tumoral dereitaIntroduction: Colorectal cancer is currently the second cancer most frequent between men and women. The great genotypic and phenotypic variability of these tumors makes its study interesting due to the distinctions that it stablishes with its treatment, evolution, and prognostic. Objective: To study the mutations that occurs in the colorectal carcinomas of the healthcare area of A Coruña diagnosed between 2019 and 2021, analyzing its genotypic and phenotypic characteristics in order to study its relation with histopathological data. Material and methods: 68 patients with colorectal carcinoma in different staging diagnosed and treated at the CHUAC between 2019 and 2021 were selected. Epidemiological data of the patients were collected. The samples were obtained from the Pathological Anatomy department of the CHUAC, through the Biobank of A Coruña. Mutations in KRAS, BRAF, NRAS, and the alterations in the microsatellite status, were detected using commercial kits form Amoy Dx, COBAS and Idylla. The alteration in mismatch repair proteins was determined by immunohistochemistry. The correlation model of Spearman was used to calculate the association strength between variables and its direction. Statistical significance was determined with a limit α< 0,05. Results: We found statistically significant correlations in our cohort between tumoral grade with the histological type and stage, the lack of expression of mismatch repair proteins with the MSI status, and a relation with this two last variables with the tumor location. We also found correlation between mismatch repair protein status and mutations in KRAS and BRAF. Conclusions: The lack of expression of mismatch repair proteins and microsatellite instability takes place in, approximately, one third of our group. Colorectal tumors with higher gradation are correlated with the mucinous histological type and higher stage. KRAS mutation is the most frequent among our patients and it is correlated with the maintenance of mismatch repair proteins expression. Lastly, the mutation in BRAF is associated with the lack of expression of mismatch repair proteins and microsatellite instability, variables which are associated with right-sided tumor
