Using of DNA polymorphism in regions of microsatellite sequences to identify the rye genotypes of different tolerance to nutritient deficiency in medium

Abstract

Celem badań było określenie różnic między genotypami roślin mieszańców F₂ tolerancyjnych i nietolerancyjnych na niedobory N i K w podłożu, pochodzących z potomstw dwóch kombinacji krzyżowań linii wsobnych różniących się omawianą właściwością (153/79-1-5 x Ot 1-3; Ot 0-6 x Ot 1-3). Badania przeprowadzono na 100 losowo wybranych ziarniakach każdego mieszańca. Różnice genotypowe otrzymanych dwóch grup siewek określono w oparciu o test BSA (bulked segregant analysis). W wyniku amplifikacji ISSR-PCR obserwowano od 2 do 14 produktów, produktów długości od ~230 do ~1600 pz. Spośród 30 analizowanych starterów, sześć pozwoliło zróżnicować genotypy tolerancyjne i nietolerancyjne na niedobory azotu i potasu w podłożu. Specyficznymi, spośród obserwowanych i zarazem różnicującymi genotypy żyta tolerancyjne od nietolerancyjnych, okazały się produkty długości: ~550, ~940, ~ 1164 i ~1420 pz.The aim of the experiment was to determine the differences between genotypes of plants tolerant and non tolerant to N and K deficiency in the medium, originating from the progeny of two hybrids of F₂ generation (153/79-1-5 x Ot 1- 3; Ot 0-6 x Ot 1-3) produced from crossing inbred lines of different tolerance. The investigations were conducted on 100 grains of each hybrid chosen at random. Genotype differences of both seedling groups, tolerant and non tolerant, were determined by means of BSA test (bulked segregant analysis). As a result of ISSR-PCR amplification 2 to 14 products of ~230 to ~1600 bp in length were observed. Six from among 30 analysed primers enabled to differentiate the genotypes tolerant and no tolerant to nitrogen and potassium deficiency in the medium. The products of ~550, ~940, ~1164, ~1420 bp in length turned out to be specific in nature and differentiating tolerant and non tolerant rye genotypes