مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت گوسفند شین بش با استفاده از نشانگرهای مولکولی

Abstract

در این تحقیق جهت مطالعه ساختار ژنتیکی جمعیت گوسفند شین بش، تعداد 75 نمونه خون از محل پراکنش این حیوانات جمع­آوری شد. استخراج DNA با روش بهینه یافته Salting-Out انجام گرفت. تعداد 10 جایگاه ریزماهواره و یک ناحیه کنترلی D-Loop مربوط به DNA میتوکندریایی (mtDNA) مورد مطالعه قرار گرفت. برای تکثیر جایگاه­های ریزماهواره از یک PCR چندگانه استفاده شد. آغازگرهای انتخابی نشان­دار شده و  با استفاده از دستگاه Genetic Analyser تعیین ژنوتیپ افراد انجام گرفت. در مجموع، 84 آلل در جمعیت مورد مطالعه شناسایی شد، لذا متوسط تعداد آلل به ازای هر نشانگر برابر با 4/8 بود. میانگین هتروزیگوسیتی مورد انتظار و هتروزیگوسیتی مشاهده شده در این جمعیت به ترتیب برابر با 042/0±724/0 و 058/0±80/0 بود. مقدار FIS در این جمعیت برابر با  108/0-  بود که نشان­دهنده غیرهمخون بودن و وجود تنوع قابل توجه در این جمعیت است. نتایج حاصل از ناحیه کنترلی mtDNA نشان داد که میزان تنوع هاپلوتیپی و درصد جایگاه­های چندشکل در این جمعیت به ترتیب 039/0±938/0 و 59/4 است. از مجموع 24 نمونه تعیین توالی شده در ناحیه کنترلی mtDNA، تعداد 17 هاپلوتیپ در جمعیت مورد مطالعه مشخص شد. میزان تنوع نوکلئوتیدی در جمعیت شین بش، 0013/0±0131/0 به ازای هر جایگاه به­دست آمد. نتایج این تحقیق نشان داد که 50 درصد از افراد جمعیت شین بش دارای هاپلوگروه A، 2/29 درصد افراد دارای هاپلوگروه B و 8/20 درصد افراد دارای هاپلوگروه C هستند