Falahi, Fahimeh

English

In dit proefschrift wordt eerst beschreven welke epigenetische veranderingen er in borstkankercellen gevonden zijn. Vervolgens is een nieuwe techniek ontwikkeld die dergelijke epigenetische mutaties kan herstellen: Epigenetische Editing. Een Epigenetische Editor bestaat uit een DNA bindend domain gekoppeld aan een enzymatisch domain, welke epigenetische markeringen kan aanbrengen of verwijderen. Het DNA bindend domain wordt zo gemaakt dat het aan 18 baseparen in het DNA bindt, deze combinatie van 18 baseparen geeft een unieke adressering in het hele menselijke DNA.De genen die in dit proefschrift verder onderzocht worden zijn overactieve oncogenen (Her2/neu, estrogen receptor ESR1) en een epigenetisch geïnactiveerd tumor suppressor gene. Met behulp van Epigenetische Editing konden remmende epigenetische veranderingen worden aangebracht die inderdaad de genexpressie remden. Deze remming resulteerde voor zowel Her2/neu als ESR1 in een verminderde kankercelgroei. EPB41L3, het tumor suppressor gen, komt niet tot expressie in verschillende typen kanker. Wij konden EPB41L3 tot expressie brengen door middel van zogenaamde Artificiële Transcriptie Factoren (bestaande uit een DNA bindend domein gefuseerd aan een transcriptionele activator) in kankercellen en dit resulteerde inderdaad in celdood. In combinatie met andere epigenetische geneesmiddelen, kon de duur van de expressie van dit epigenetisch inactieve gen worden verlengd.Verstoorde epigenetische mechanismen zijn nu gevonden in veel ziekten, ook in kanker. Chemische remmers van epigenetische enzymen zijn goedgekeurd als behandeling voor kanker. Deze middelen werken echter op alle genen in het DNA, met mogelijke bijwerkingen. Epigenetische Editing is een innovatieve benadering om blijvend op specifieke genen effect te hebben.This thesis is about developing a targeted approach to write or erase epigenetic modifications onto a gene of interest (Epigenetic Editing) to modulate its expression. An Epigenetic Editing tool consists of a DNA binding domain (DBD) linked to a catalytic domain of epigenetic enzymes.Using the Epigenetic Editing, inactive epigenetic modifications were written on overexpressed genes in cancer, which were associated with their downregulation and cell growth inhibition.A tumor suppressor gene was upregulated using an artificial transcription factor (composed of a DBD fused to a transcription activator domain) in cancer cells and apoptosis was induced in the treated cells.Since aberrant epigenetic modifications are associated with cancer, the role of epigenetics in breast cancer and the potential epigenetic-therapies are intensively investigated; this is also reviewed in this thesis

Dissertations of the University of Groningen

Epigenetic editing as a novel approach to modulate expression of key genes in cancer

https://pure.rug.nl/ws/files/10432167/20140416_Falahi_Thesis.pdf

Epigenetic editing as a novel approach to modulate expression of key genes in cancer

Abstract

Similar works

Full text

Available Versions

Dissertations of the University of Groningen