Vaihdevuosioireiden diagnosointi on yleensä helppoa, mutta vastaavia oireita esiintyy myös erilaisten sairauksien oireina. Tärkeimmät erotusdiagnostiikassa huomioitavat sairaudet ovat uniapnea ja kilpirauhasen toimintahäiriö. Jos oirekuvaan sisältyy vasomotorisia oireita, voidaan tyypillisessä vaihdevuosi-iässä esiintyviä vaihdevuosioireiksi sopivia oireita pitää ensisijaisesti vaihdevuosiin liittyvinä, eikä erotusdiagnostisia lisätutkimuksia tarvita. Mikäli potilaan ikä tai oirekuva ovat epätyypilliset, korostuu huolellisen anamneesin ja potilaan tutkimisen merkitys.</p
