O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade genética em duas populações de Carapa guianensis Aubl. (andiroba), no Estado do Acre, e comparar os parâmetros de diversidade com os observados em outras populações da espécie (no Brasil: Flona Tapajós, PA, Porto Acre, AC; e na Costa Rica). Foram avaliados 77 indivíduos adultos com sete locos polimórficos de microssatélites. Observaram-se 51 alelos nas duas populações, em que o número efetivo de alelos por loco (Âe = 3,2) foi inferior ao número médio de alelos por loco ( = 7,3), o que indica elevado número de alelos com baixa freqüência. Os valores estimados de f^ não diferiram de zero, o que mostra que não ocorre endogamia nas populações. A taxa de cruzamento aparente foi alta (t^a = 1,11 na população Porto Acre, e t^a = 0,88 na de Rio Branco), resultado indicador de que a espécie se reproduz por alogamia. Foi observado, por meio das estimativas de  , Ĥe (diversidade gênica) e N^e (número efetivo populacional) que as populações de andiroba, comparadas neste trabalho, tiveram padrões de diversidade semelhantes, porém, proporções de alelos raros diferentes.The objective of this work was to evaluate the genetic diversity of two Carapa guianensis Aubl. (crabwood) populations, in the State of Acre, Brazil, and to compare the diversity estimations with those obtained in other populations of the species (in Brazil: Flona Tapajós, PA, Porto Acre, AC; and in Costa Rica). Seventy-seven individuals were assessed using seven polymorphic microsatellite loci. Fifty-one alleles were observed in the two populations, in which the effective number of alleles per locus (Âe = 3.2) was lower than the average number of alleles per locus ( = 7.3), which indicates a high number of low frequency alleles. The estimated f^ values did not differ from zero, showing that inbreeding does not occur in these populations. The apparent outcrossing rate was high for both populations (t^a = 1.11 in Porto Acre population, and t^a = 0.88 in Rio Branco), indicating that this species reproduces by outcrossing. Comparing the estimates of A^e, Ĥe (gene diversity) and N^e (effective population number), it was observed that the general patterns of genetic diversity were similar. However, the number of rare alleles differ between populations
