The real-time PCR detection of Clostridium perfringens and Clostridium difficile in infant, child, and adult feces

Abstract

The toxigenic strains of C. perfringens and C. difficile can cause foodborne illnesses and antibiotic-associated diarrhea, including pseudomembranous colitis. The latter needs to be treated with the specific antibiotics, metronidazole or vancomycin, which are effective against C. difficile. Both C. difficile and C. perfringens are the anaerobic bacteria and difficult to cultivate. The most reliable method for the detection of these bacteria in the clinical samples is real-time PCR. We evaluated the frequency of C. perfringens and C. difficile PCR detection in feces from 225 outpatients (Colonoflor-16 kit, Alphalab, Russia). C. perfringens and C. difficile were detected in 36 (16.0%) and 17 (7.6%) samples, respectively. The results were stratified by age. There was statistically significant difference between age groups in the frequency of C. difficile detection and no statistically significant difference in frequency of C. perfringens detection. The amounts of C. difficile were significantly higher in children younger than 2 years in comparison with adults.Токсигенные штаммы C. perfringens и C. difficile могут вызывать развитие пищевых инфекций и антибиотико-ассоциированных диарей, включая псевдомембранозный колит. Для лечения последнего используют специальные антибиотики: клиндамицин и метранидазол, активные в отношении C. difficile. C. perfringens и C. difficile являются облигатно анаэробными микроорганизмами, что затрудняет проведение культурального исследования. Наиболее надежным методом для рутинного обнаружения данных клостридий в клинических образцах является ПЦР в реальном времени (ПЦР-РВ). Мы оценили частоту обнаружения C. perfringens и C. difficile методом ПЦР-РВ в кале у 225 амбулаторных больных (набор Колонофлор-16, Альфлаб, Россия). C. perfringens и C. difficile были идентифицированы в 36 (16.0%) и 17 (7.6%) образцах соответственно. Обнаружили статистически значимые различия по частоте обнаружения C. difficile в различных возрастных группах, тогда как C. perfringens обнаруживали с сопоставимой частотой у пациентов всех возрастов. Количество C. difficile было достоверно выше у детей младше 2 лет по сравнению с взрослыми