Collecting Genetic Materials and Isolating DNAs of Grapevine (Vitis vinifera L.) in Natural Flora of Ganos Mountains

Abstract

Ganos Dağları Trakya’nın güneyinde 40° 35’ ve 40° 52’ K ile 26° 58’ ve 27° 27’ D arasında yer almaktadır. Kuzeydoğu - Güneybatı yönünde uzanmaktadır. Tekir Dağları’nın 945m rakım ile en yüksek yeridir. 2014 yılı vejetasyon periyodunda yürütülen araştırmada örnekleme üç farklı yöntem izlenerek yapılmıştır. Arkeolojik kazılar sonucunda eski yerleşimlerin olduğu bilinen alanlar ve yakınlarında; köylerde yaşayan kişilerin bilip tespit ettiği asmalardan ve asma bulunması olasılığı olan bölge ve dere yataklarının aranması şeklinde yapılmıştır. Örnekler 40° 53’ K ile 27° 26’ D ve 40° 35’ K ile 27° 00’ D koordinatları arasından toplanmıştır. “Second Edition of the OIV Descriptor List for Grape Varieties and Vitis Species” listesinde yer alan 29 tanımlama karakteri kullanılarak irdelenmiştir. Alınan yaprak ve sürgün ucu örnekleri fotoğraflanmış ve incelenen özellikler açısından değerlendirilmiştir. Örneklerin DNA’ları “Doyle&Doyle DNA Ekstrasyon Protokolü” kullanılarak izole edilmiştir. Elde edilen DNA’lar buzdolabında muhafaza altına alınmıştır. Sonuç olarak Ganos Dağları’nın kuzey yamaçlarında ~600m, güney yamaçlarında ise 700-750m rakımlardan sonra Vitis vinifera ssp. silvestris ve Vitis vinifera ssp. sativa örneklerine rastlanmamıştır. Köy ile yerleşim yerlerine uzak ve yoğun ormanlık alanlarda (aşırı gölge) bulunan bazı derelerde de örnek bulunmadığı; genellikle su bulunan nemli alanlarda, etrafı açık, kayalık derelerde yetiştiği görülmüştür. Bu asmaların arasından gelecekte ıslah çalışmalarında kullanılmak üzere yeni bireylerin eldesi ihtimali olduğundan vejetatif materyal alınarak in-vivo’da saklanmasının uygun olacağı ön görülmüştür.Ganos Mountains, lied on north-east and south-west direction are located in the south of Trakya region in 40° 35’ and 40° 52’ N ile 26° 58’ ve 27° 27’ E coordinates. Ganos Mountains are highest point of Tekir Mountains with 945m altitude. Research was conducted in the vegetation period in 2014; sampling survey carried out using three different methods. Searching grapevines in the well known oldest settlement areas which were about archaeological excavation areas; also asking the villagers, and some disricts and river beds. Grapevine samples are collected between 40° 53' N and 27° 26' E and 40° 35' N 27° 00' D coordinates. Samples were examined on 29 identification characters according to the “Second Edition of the OIV’s Descriptor List for Grape Varieties and Vitis Species” list. Grapevine leaves and shoot apex samples were photographed and evaluated. Samples DNAs content were isolated using the "Doyle & Doyle DNA Extraction Protocol". DNAs were preserved in refrigerator. As a result, in the northern slopes of the Ganos mountains about 600m altitude, while the southern slopes above 700-750m altitude; neither Vitis vinifera ssp. silvestris nor Vitis vinifera ssp. sativa grapevine samples were found. Far from the villages and settlements also densely forested areas (excessive shade) and streams there was no samples found; while moist areas with water, open areas and rocky creek was have samples. It is foreseen that; in order to used in the future breeding programs these vegetative materials are kept in-vivo conditions

    Similar works