Agriculture that employs soil conservation practices promotes ecosystem services such as the mitigation of greenhouse gases. The objective of this work was to evaluate the carbon sequestration from a Latossolo Vermelho Distroférrico (Haplustox) under a conservationist management system for flaxseed production over three years yield. The experiment was carried out for three years in a soil conservationist management system (no-tillage) for the production of three brown flaxseed varieties: Caburé, Aguará and UFSC cultivated in Latossolo Vermelho. Undesturbed and deformed soil samples were collected in two contrasting layers: 0-0.15 and 0.15-0.30 m depth. Soil bulk density, total organic carbon, stocks and CO2 sequestration -IPCC were determined. Data were submitted to variance analysis and Tukey's test (p<0.05). The soil management used contributed to the soil carbon stock, regardless of the variety used, on average 27 Mg C ha was stored in the 0-0.15m layer and 29.8 Mg C ha-1 at 0.15- 0.30 m in depth, in addition to mitigating an average of 10.48 Mg CO2eq ha-1 in just three years of cultivation, which makes this management system environmentally sustainable with yields equivalent to those obtained in South region of Brazil (0,71 Mg ha-1).La agricultura que emplea prácticas de conservación del suelo promueve los servicios ecosistémicos, como la mitigación de gases de efecto invernadero. El objetivo de este trabajo fue evaluar el secuestro de carbono de un Latosol Rojo Distrófico bajo sistema de manejo de conservación para la producción de cerda cerda durante tres años de cultivo. El experimento se llevó a cabo durante tres años en un sistema de conservación de manejo para la producción de tres variedades de linaza parda: Caburé, Aguará y UFSC cultivadas en latosol rojo distrófico caolinítico. Las muestras preservadas y deformadas se recogieron en dos capas constratantes: 0-0,15 y 0,15-0,30 m. Se determinó la densidad global del suelo, el carbono orgánico total, las reservas y el secuestro de CO2 -IPCC. Los datos fueron sometidos a análisis de varianza y prueba de Tukey (p<0,05). El manejo utilizado contribuyó al stock de carbono en el suelo, independientemente de la variedad utilizada, en promedio, se sembraron 27 Mg C ha-1 en la capa de 0-0.15m y 29.8 Mg C ha-1 a 0.15-0.30 m de profundidad, además de mitigar en promedio 10.48 Mg CO2 eq ha-1 en solo tres años de cultivo, lo que hace que este sistema de manejo sea ambientalmente sostenible con producciones equivalentes a las obtenidas en el sur de Brasil (0.71 Mg ha-1).A agricultura que emprega práticas de conservação do solo promove serviços ecossistêmicos como a mitigação dos gases de efeito estufa. O objetivo desse trabalho foi avaliar o sequestro de carbono de um Latossolo Vermelho Distroférrico sob sistema de manejo conservacionista para a produção de linhaça ao longo de três anos de cultivo. O experimento foi desenvolvido durante três anos em sistema conservacionista de manejo para produção de três variedades de linhaça marrom: Caburé, Aguará e UFSC cultivados em Latossolo Vermelho Distroférrico caulinítico. Foram coletadas amostras preservadas e deformadas em duas camadas constratantes: 0-0,15 e 0,15-0,30 m. Determinou-se a densidade global do solo, o carbono orgânico total, os estoques e o sequestro de CO2 -IPCC. Os dados foram submetidos a análise de variância e ao teste de Tukey (p<0,05). O manejo utilizado contribuiu com o estoque de carbono no solo, independente da variedade utilizada, em média, estocou-se 27 Mg C ha-1 na camada de 0-0,15m e 29,8 Mg C ha-1 a 0,15-0,30 m de profundidade, além de mitigar em média 10,48 Mg CO2 eq ha-1 em apenas três anos de cultivo, o que torna esse sistema de manejo ambientalmente sustentável com produções equivalente as obtidas no Sul do Brasil (0,71 Mg ha-1)