Design and synthesis of a fluorescent probe based on amonabactin siderophore from the pathogenic bacterium "Aeromonas salmonicida" subsp. "salmonicida"
[Resumen]: La industria acuícola está siendo enormemente afectada por la aparición y propagación
de enfermedades infecciosas en los peces y la elevada resistencia de las bacterias que las
provocan a los antibióticos actuales. Por tanto, surge la necesidad de profundizar en el
estudio de esas enfermedades infecciosas con el fin de desarrollar nuevos fármacos más
efectivos. En este trabajo se propuso la síntesis de una sonda fluorescente (conjugado
sideróforo-fluoróforo) para el posterior estudio de su internalización dentro de la bacteria
y la monitorización de la forunculosis provocada por Aeromonas salmonicida subsp.
salmonicida. El sideróforo seleccionado como vector de entrada en la bacteria es un
análogo de amonabactinas responsable de la captación de Fe(III) de la bacteria patógena
A. salmonicida, siendo el fluoróforo la sulforodamina B. El espaciador utilizado para
conectar el sideróforo y el fluoróforo fue PEG2, distinto al empleado en estudios previos.
El trabajo realizado permitió la obtención de un conjugado entre el sideróforo
convenientemente protegido y el fluoróforo, la sulforodamina B, que fue caracterizado
tanto por RMN como por espectrometría de masas. La eliminación de los grupos
protectores del conjugado obtenido permitirá obtener la sonda fluorescente deseada.[Resumo]: A industria acuícola está sendo enormemente afectada pola aparición e propagación de
enfermidades infecciosas nos peixes e a elevada resistencia das bacterias que as provocan
aos antibióticos actuais. Por tanto, surxe a necesidade de profundizar no estudo desas
enfermidades infecciosas co fin de desenvolver novos fármacos máis efectivos. Neste
traballo propúxose a síntese dunha sonda fluorescente (conxugado sideróforo-fluoróforo)
para o posterior estudo da súa internalización dentro da bacteria e a monitorización da
forunculosis provocada por Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida. O sideróforo
seleccionado como vector de entrada na bacteria é un análogo de amonabactinas
responsable da captación de Fe(III) da bacteria patóxena A. salmonicida, sendo o
fluoróforo a sulforodamina B. O espaciador utilizado para conectar o sideróforo e o
fluoróforo foi PEG2, distinto ao empregado en estudos previos.
O traballo realizado permitiu a obtención dun conxugado entre o sideróforo
convenientemente protexido e o fluoróforo, a sulfordamina B, que foi caracterizado tanto
por RMN coma por espectrometría de masas. A eliminación dos grupos protectores do
conxugado obtido permitirá obter a sonda fluorescente desexada.[Abstract]: The aquaculture industry is being severely affected by the emergence and spread of
infectious diseases in fish and the high resistance of bacteria that cause them to current
antibiotics. Therefore, there is a need to deepen the study of these infectious diseases in
order to develop new and more effective drugs. In this work, the synthesis of a fluorescent
probe (siderophore-fluorophore conjugate) was proposed for the subsequent study of its
internalization within the bacterium and the monitoring of forunculosis caused by
Aeromonas salmonicida subsp. salmonicida. The siderophore selected as an input vector
in the bacterium is an analog of the amonabactins, which are involved in the uptake of
Fe(III) by the pathogenic bacterium A. salmonicida and the fluorophore is sulforodamine
B. The spacer used to connect the siderophore and the fluorophore was PEG2, different
from the one used in previous studies.
This work allowed to obtain a conjugate between the suitably protected siderophore and
fluorophore, the sulforhodamine B, which was characterized by both NMR and mass
spectrometry. The elimination of the protecting groups of the obtained conjugate will
allow obtaining the desired fluorescent probe.Traballo fin de grao (UDC.CIE). Química. Curso 2021/202
