The main aim of this PhD was to study long homozygote segments present in the genome in Norwegian Red, and find genomic options to measure inbreeding more accurately than from a pedigree database. Prior to the study, runs of homozygosity (ROH) was indicated to be a measure utilizing chromosomal regions identical by descent, thus a good genomic substitute to pedigree. Two dataset were exploited: (1) 384 bulls genotyped with the Illumina HD-panel containing 777K SNP-markers, and (2) 3,289 bulls genotyped with a 54K Illumina BeadChip and/or 25K Affymetrix, with imputations both ways if needed. The pedigree of these two datasets extended as far back as 1875.Hovedformålet med denne doktorgraden var å studere lange homozygote segmenter i genomet hos NRF, og å finne genomiske metoder som kan måle innavl mer nøyaktig enn ved bruk av slektskapsdatabase. I utgangspunktet var «runs of homozygosity» (ROH) valgt som en egnet og interessant metode for denne studien, fordi den var antatt å oppnå nøyaktige anslag. ROH ble angitt for å være et mål som på lik linje med slektskapsdatabaser utnyttet homosygositet nedarvet fra samme opphav, og dermed en god genomisk erstatning for slektskapsdatabasen. To datasett ble gransket: (1) 384 okser genotypet med Illumina HD-panelet som inneholder 777K SNP-markører, og (2) 3,289 okser genotypet med en 54K Illumina BeadChip og/eller en 25K Affymetrix, med imputering begge veier ved behov. Slektskapsdatabasen til disse to datasettene strakk seg så langt tilbake som til 1875
