O bioma pantanal abriga grande biodiversidade de espécies de peixes, que além da sua relevância ecológica também são de grande importância para a alimentação e renda de famílias e empresas ligadas ao turismo pesqueiro, como é o caso da piraputanga (Brycon microlepis), distribuída pela bacia do Paraguai e Pantanal. Este trabalho objetivou buscar novas informações que possibilitem uma melhor compreensão da diversidade genética da piraputanga através de uma investigação citogenética e molecular. O número diplóide encontrado foi de 2n= 50 cromossomos. Foi realizada a técnica de banda C e as NORs foram evidenciadas pela coloração de nitrato de prata. Foram coletadas amostras em diversos municípios do estado de Mato Grosso, como: Cuiabá, Barão de Melgaço, Santo Antônio de Leverger, Barra do Bugres e Cáceres. Um banco de DNA foi montado com estas amostras. Os primers de microssatélites utilizados foram descritos para outra espécie (Brycon opalinus). Os resultados podem futuramente possibilitar uma melhor compreensão da variabilidade genética e do mecanismo ecológico da espécie
