Spatio-temporal analysis of malaria epidemiological data in Togo

Abstract

Le paludisme demeure un problème majeur de santé publique au Togo. Les enfants âgés de moins de 5 moins sont les plus endeuillés et les ses conséquences pèsent sur les ménages et sur le système de santé. La mission du Programme National de Lutte contre le Paludisme (PNLP) est de libérer les communautés et les familles togolaises du fardeau du paludisme d’ici 2030 pour contribuer au développement du pays. Pour relever ce défi, le PNLP au cours de cette dernière décennie, à intensifier la couverture de des interventions et collecter énormément d’informations sur les activités qu’il met en œuvre. Malgré leur disponibilité, ces données n’ont jamais été analysées conjointement pour dresser une image précise du paludisme au Togo. Les objectifs de cette thèse étaient 1 - Réaliser une analyse-spatio-temporelle du paludisme au Togo afin de mieux comprendre les déterminant de la dynamique du paludisme , 2 - Evaluer l’impact d’une intervention prioritaire mise en place dans le passé et, 3 - Analyser les données du projet pilote sites sentinelles pour la surveillance du paludisme. Pour répondre aux objectifs, nous avons exploité les données de routines du PNLP et, qui incluaient les données de 2 ans de collecte des sites sentinelles. Concernant l’Objectif 1, nous avons décrit les tendances de morbidité et de mortalité du paludisme sur les 10 dernières années et nous avons trouvé que: globalement le nombre de cas de paludisme recensés augmentait d’année en année alors que le nombre de décès baissait, traduisant ainsi, une bonne détection du système de santé. Pour l’Objectif 2, nous avons nous avons évalué l’impact de la chimioprévention du paludisme saisonnier chez les enfants âgés de 3 à 59 mois. Nous avons mis en évidence, l’efficacité de cette intervention au Togo. En effet, la CPS a permis de réduire considérablement les cas de paludisme chez les enfants, les couvertures administratives atteignant généralement les 98 %, et avec des d'effets indésirables associés mineurs. Enfin, concernant l’Objectif 3, nous avons trouvé que les sites sentinelles étaient fonctionnels, rapportaient des données complètes et que globalement, la gestion des intrants antipaludiques, ainsi que les soins offerts sur les sites étaient conformes aux directives de prise en charge en vigueur au Togo. Par ailleurs, ces sites sentinelles permettent au PNLP de suivre l'évolution des tendances en temps réel pour une riposte rapide. Les résultats de ce travail vont permettre de mieux comprendre la dynamique du paludisme au Togo et aider à améliorer la prévention et le contrôle de la transmission. Cette thèse par ailleurs, a permis de rendre visible les activités du PNLP à travers des publications, pour la première fois, dans des revues internationales.Malaria remains a major public health problem in Togo. Children under the age of 5 are the most bereaved and the consequences weigh on households and the health system. The mission of the National Malaria Control Program (PNLP) is to free Togolese communities and families from the burden of malaria by 2030 to contribute to the country's development. To meet this challenge, the PNLP over the last decade has intensified the coverage of interventions and collected a lot of information on the activities it implements. Despite their availability, these data have never been analyzed together to draw a precise picture of malaria in Togo. The objectives of this thesis were 1 - Carry out a spatio-temporal analysis of malaria in Togo in order to better understand the determinants of the dynamics of malaria, 2 - Evaluate the impact of a priority intervention implemented in the past and, 3 - Analyze the data from the pilot sentinel sites for malaria surveillance. To meet the objectives, we used routine data from the PNLP and, which included data from 2 years of collection from sentinel sites. Regarding Objective 1, we described the trends in morbidity and mortality of malaria over the last 10 years and we found that: overall the number of recorded malaria cases increased from year to year while the number of deaths decreased , thus translating into a good detection of the health system. For Goal 2, we assessed the impact of seasonal malaria chemoprevention in children aged 3 to 59 months. We have demonstrated the effectiveness of this intervention in Togo. In fact, SMC has significantly reduced cases of malaria in children, with administrative coverage generally reaching 98%, and with associated minor adverse effects. Finally, regarding Objective 3, we found that the sentinel sites were functional, reported complete data and that overall, the management of antimalarial inputs, as well as the care offered at the sites, complied with the management guidelines in force in Togo. In addition, these sentinel sites allow the PNLP to follow the evolution of trends in real time for a rapid response. The results of this work will provide a better understanding of the dynamics of malaria in Togo and help improve prevention and control of transmission. This thesis also made it possible to make the activities of the PNLP visible through publications, for the first time, in international journals