Identificación de comunidades bacterianas y grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa (Solanum tuberosum). Var super chola en el piso altitudinal de 3100 msnm, Cuturivi, Cotopaxi 2022.

Abstract

This research aimed to identify bacterial communities and determine the functional groups associated with the rhizosphere of the potato in the “Super Chola” variety (solanum tuberosum) at 3100 masl to determine the different functional groups. The methodology of (Bernal, 2015) was used in the locality of Cuturivi, Cotopaxi Province, where culture media are used such as Nutrient Agar (Total Microbiota), Rose Bengal (Total Population of Fungi), Ramos Callao Agar (Phosphorus solubilizers), King's B (Pseudomonas), Soil Extract Agar (Cellulitic Bacteria), Watanabe (Nitrogen Fixers) and Casein Agar (Actinomycetes). Bacterial identification was performed by sequencing 16S rRNA in soil using third-generation sequencing with nanopores (Oxford Nanopore Technologies). Additionally, a physicochemical analysis was carried out at the INIAP laboratory to know the state of soil composition. From the data, it was obtained that in this altitudinal tier, the genre with the most significant presence is Arenimonas with 2,530 accumulated readings, followed by Lactobacillus with 860 readings. These genres are related to nitrogen fixation in the soil, which is consistent with the physical analysis where values of 150 ppm of nitrogen were obtained, considered high. Five repetitions were established in soil and root plus a blind control for each group, where the number of colonies *gr-1 and CFU *gr -1 was established. The functional group with the highest number of colonies was nitrogen-fixing bacteria with 1.18*108 colonies*gr-1 in the soil, and 1.06*108 colonies*gr-1 in the root, followed by phosphorus-solubilizing bacteria with 2, 08*1012 cfu*gr-1, in soil and root with total microbiota with 9.16*1011 cfu*gr-1 respectively. So, there is also the presence in soil and root of the other groups under study. There is a relationship between the bacterial communities present with the functional groups of greater presence and the results of the levels of elements that the potato rhizosphere has.La presente investigación se realizó en la localidad de Cuturivi, provincia de Cotopaxi teniendo como objetivo identificar comunidades bacterianas y determinar los grupos funcionales asociados a la rizosfera de la papa en la variedad de super chola (solanum tuberosum) a 3100 msnm, para la determinación de los diferentes grupos funcionales se utilizó la metodología de (Bernal, 2015), donde se utiliza los medios de cultivo como: Agar Nutritivo (Microbiota Total), Rosa de Bengala (Población total de Hongos), Agar Ramos Callao (Solubilizadores de fósforo), B de King (Pseudomonas), Agar Extracto de suelo (Bacterias Celulíticas), Watanabe (Fijadores de nitrógeno) y Agar Caseína (Actinomicetos). Para la identificación bacteriana se realizó mediante secuenciación del ARNr 16S en suelo, mediante la Secuenciación de tercera generación mediante nanoporos (Oxford Nanopore Technologies) y Adicional para conocer el estado de composición del suelo se realizó un análisis fisicoquímico en el laboratorio del INIAP. Con los datos se obtuvo que en este piso altitudinal los géneros con más presencia son las Arenimonas con 2,530 lecturas acumuladas, seguidas de Lactobacillus con 860 lecturas. Estos géneros están relacionados con la fijación de nitrógeno en el suelo, lo que concuerda con el análisis físico donde obtuvimos valores de 150 ppm de nitrógeno considerado alto. Por cada grupo se estableció cinco repeticiones en suelo y raíz más un testigo ciego, donde se estableció, número de colonias *gr-1 y UFC *gr -1. El grupo funcional con mayor número de colonias fue bacterias fijadoras de nitrógeno con 1,18*108 colonias*gr-1 en suelo, y en raíz 1,06*108 colonias *gr-1, seguido de bacterias solubilizadoras de fósforo con 2,08*1012 ufc*gr-1, en suelo y raíz con microbiota total con 9,16*1011 ufc*gr-1 respectivamente. Teniendo en cuenta que también hay la presencia en suelo y raíz de los demás grupos en estudio. Existe una relación entre las comunidades bacterianas presentes con los grupos funcionales de mayor presencia y los resultados de niveles de elementos que tiene la rizosfera de la papa