Os testes de genotoxicidade são importantes na avaliação da ação do homem sobre os corpos d’água,complementando os critérios legalmente exigidos para verificar a qualidade de águas. Neste sentido, opotencial genotóxico de amostras de água superficial e sedimento da bacia do Lago Guaíba foi avaliadoutilizando o bivalve Limnoperna fortunei como organismo bioindicador. Foram coletadas amostras noParque Estadual de Itapuã, consideradas como ponto de referência, na foz do arroio Dilúvio e no lagoGuaíba próximo à foz do Dilúvio. Para avaliar a resposta genotóxica, foram utilizados o ensaio cometa ea freqüência de micronúcleos nas células da hemolinfa do molusco. As amostras de água e sedimentodesses três locais de coleta induziram aumento de danos ao DNA nas células avaliadas, detectado porambos os ensaios, quando comparadas com a amostra referência.Palavras-chave: genotoxicidade, biomonitoramento, contaminação ambiental, bacia do lago Guaíba,Limnoperna fortunei