Makrozoobentos merupakan organisme yang hidup melata, menempel, memendam baik didasar perairan maupun di permukaan dasar perairan.Penelitian ini bertujuan untukmenganalisis tingkat keanekaragaman makrozoobentos pada ekosistem mangrove di Desa Kukupang Kecamatan Kepulauan Joronga, Kabupaten Halmahera Selatan.Pelaksanaan penelitian pada bulan Oktober sampai dengan bulan Juli sampai Agustus Lokasi penelitian bertempat di kawasan ekosistem mangrove Desa Kukupang Kecamatan Kepulauan Joronga.Penelitian ini dilakukan dengan metode transek kuadrat dan penentuan stasiun dilakukan dengan metode acak terstratifikasi, Pengambilan data makrozoobenthos menggunakan transek berukuran 5m x 5m dengan menggunakan plot ukuran plot 1m x 1m, dimana penentuan stasiun untuk sampling dibagi menjadi 3 stasiun. Hasil pengamtan dilapangan terdapat 23 jenis makrozoobenthos dengan nilai Indeks keanekaragaman tertinggi ditemukan distasiun 1 sebesar 2.15, sedangkan untuk stasiun 2 nilai indeks keanekaragaman sebesar 1.91 kemudian nilai keanekaragaman terendah berada pada stasiun 3 sebesar 1.46 spesies yang lebih dominan ditemukan pada lokasi penelitian jenis Littirina scabra dibandingkan dengan spesies lainnya.Kata Kunci: Makrozoobenthos, Ekosistem Mangrove, Desa Kukupan
