Studies approaching the temporal variation of fish community structure on coastal lagoons give us the opportunity to access its stability and persistence, besides of being important tools to monitor the quality of environment. However, few researches use a temporal approach to evaluate this kind of ecosystems. The present study aimed to compare the fish community structure of Caconde lagoon, north coast of RS, at two time periods (1992-1994 and 2009-2011). A Student’s t-test was used to compare the proportion of abundance and of biomass of each species between the two time periods. Additionally, we performed an ordination with the fish species compositions of the two periods. Five new species occurrences were registered for Caconde lagoon at the recent sample, three of which are allochthonous. Eight species found at the original sample were not found at the recent one. Results of t-test revealed significant differences on the abundances of four species as well as a temporal partition between the two temporal samples. Besides the presence of allochthonous species, we found differences in the stability of the community characterized by decreasing relative abundances of original dominant species. Notwithstanding the inability to clearly explain the causes of the observed changes, we infer they can be partly explained by the presence of allochthonous species as well as by land-use changes at lagoon surroundings.Estudos que avaliam comunidades de peixes em lagoas em intervalos distintos no tempo nos fornecem uma oportunidade para o exame de sua estabilidade e persistência, além de serem úteis como indicadores de qualidade ambiental. Porém são poucos os trabalhos feitos com o enfoque na avaliação temporal desses ecossistemas. Este trabalho objetivou comparar amostragens da ictiofauna da lagoa Caconde, litoral norte do RS, feitas em dois períodos distintos (1992-1994 e 2009-2011), visando avaliar possíveis mudanças na estrutura da comunidade de peixes deste sistema. Fez-se a comparação entre as amostragens do primeiro (1992-1994) e segundo (2009-2011) períodos, através de teste t, entre a abundância proporcional de espécies constantes, tanto em número de indivíduos quanto em biomassa. Além disso, foi feita uma análise de ordenação entre a composição de espécies da lagoa em cada período amostral. Registraram-se cinco novas ocorrências na lagoa Caconde, sendo que três delas foram de espécies alóctones. Oito espécies registradas no primeiro período não foram capturadas no segundo. O teste t realizado revelou diferenças significativas na abundância de quatro espécies, bem como uma partição temporal entre amostragens dos dois períodos. Além da presença de espécies alóctones, a maior diferença encontrada entre os dois períodos amostrais refere-se a alterações na estabilidade, através da mudança de espécies que, antes dominantes na comunidade, diminuíram suas abundâncias relativas. Apesar de não poder indicar claramente as causas das alterações registradas, é possível que estas mudanças sejam em decorrência da presença das espécies alóctones, além das mudanças do uso do solo do entorno da lagoa
