Para el diagnóstico temprano de enfermedades con cuadro clínico inespecífico como la leptospirosis, es necesario la confirmación laboratorial mediante pruebas específicas, con la finalidad de que el diagnóstico sea más acertado y rápido. Objetivo: Se realizó un estudio comparativo entre la prueba de microaglutinacion (MAT) y la prueba de ELISA indirecta estandarizada con un “pool” de antígenos de Leptospira interrogans, para la detección de anticuerpos IgM, en muestras de suero de fase aguda de leptospirosis humana. Materiales y métodos: 40 muestras de pacientes con sospecha clínica y con títulos de 1:100-1:12800 por la prueba de MAT, 80 muestras negativas de pacientes aparentemente sanos con enfermedades como Brucelosis, Sífilis, Tifus murino, Hepatitis B, Fiebre Amarilla, Dengue y Enfermedad de Carrión fueron evaluados por ELISA IgM. Resultados: Se obtuvo una sensibilidad de 97,5% y especificidad de 98,75%, no observándose reacción cruzada con otras enfermedades. Conclusión: ELISA IgM validado en el laboratorio es suficiente sensible, específico y de fácil aplicación para el uso como prueba de tamizaje en una infección por Leptospiras con la subsecuente confirmación por MAT