Distribution of Hepatitis C virus (HCV) genotypes in seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil / Distribuição de genótipos do Vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos no Estado de Alagoas, Brasil

Abstract

Submitted by Ana Maria Fiscina Sampaio ([email protected]) on 2013-01-11T20:33:14Z No. of bitstreams: 1 Gonzaga, Rosa Maria S Distribution....pdf: 147559 bytes, checksum: db62cb9d398d805b2d1995c970eb86bb (MD5)Made available in DSpace on 2013-01-11T20:33:14Z (GMT). No. of bitstreams: 1 Gonzaga, Rosa Maria S Distribution....pdf: 147559 bytes, checksum: db62cb9d398d805b2d1995c970eb86bb (MD5) Previous issue date: 2008Universidade Federal de Alagoas. Laboratório de Genética Molecular, Genômica e Proteômica. Maceió, AL, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilFundação Oswaldo Cruz. Centro de Pesquisas Gonçalo Moniz. Salvador, BA, BrasilUniversidade Federal de Alagoas. Laboratório de Genética Molecular, Genômica e Proteômica. Maceió, AL, BrasilUniversidade Federal de Alagoas. Instituto de Ciências Biológicas e da Saúde. Maceió, AL, BrasilA frequência de genótipos do vírus da hepatite C (HCV) em pacientes soropositivos anti-HCV no estado de Alagoas, Brasil, foi determinada através da RT-PCR aninhada da região 5'NCR seguida pela análise do polimorfismo de comprimento dos fragmentos de restrição (RFLP). A RT-PCR aninhada utilizando primers genótipo-específicos da região core foi efetuada quando não foi possível determinar o genótipo pelo primeiro método. Níveis detectáveis de HCV-RNA estavam presentes em 115 (74,7 por cento) das 154 amostras de soro. O genótipo 1 foi o mais freqüente (77,4 por cento), contra 20,9 por cento do genótipo 3 e 0,8 por cento do genótipo 2. O subtipo 1b foi predominante (65,2 por cento), seguido pelos subtipos 1a (8,7 por cento) e 3a (6,1 por cento). Co-infecção (1a/3a) foi detectada em 0,8 por cento das amostras. Não foram encontradas diferenças significativas quanto à prevalência do genótipo 1 em relação ao que tem sido obtido de pacientes soropositivos anti-HCV de outras localidades do Brasil. Este é o primeiro relato da presença do genótipo 2 no estado.We determined the frequency of hepatitis C virus (HCV) genotypes in anti-HCV seropositive patients in the state of Alagoas, Brazil, by means of nested-reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-nested-PCR) followed by restriction fragment length polymorphism (RFLP) of amplified fragments of the 5ïNCR. The nested-PCR with genotype-specific primers from the core region was carried out when detection was not possible by the first approach. Detectable HCV-RNA was present in 115 (74.7 percent) of 154 serum samples. Genotype 1 was the most frequent (77.4 percent), against 20.9 percent of genotype 3 and 0.8 percent of genotype 2. Subtype 1b was predominant (65.2 percent), followed by subtypes 1a (8.7 percent), and 3a (6.1 percent). Coinfection (1a/3a) was detected in 0.8 percent of the samples. Indeed, there was no significant differences in the prevalence of genotype 1 compared to what has been obtained from anti-HCV seropositive patients from other locations in Brazil. Here we report for the first time the genotype 2 in the state of Alagoas