Bancos de dados de seqüências expressas representam uma fonte potencialmente valorosa
para o desenvolvimento de marcadores moleculares. Neste trabalho, estudos foram realizados
para o desenvolvimento de marcadores para aplicação no melhoramento de feijão-caupi,
feijão-comum e soja. Foram analisadas 10.880 ESTs de feijão-comum e 116.965 ESTs de
soja. Um total de 331 e 4553 SSRs foram identificados nas seqüências de feijão-comum e
soja, respectivamente. Trinucleotídeos (45,62 %) foram as mais abundantes em feijãocomum,
enquanto que os dinucletídeos (49,67 %), em soja. A densidade média variou de um
SSR a cada 22 Kb (feijão-comum) a um SSR a cada 14,68 Kb (soja). Repetições diméricas
AG/GA / TC/CT e triméricas AAG/AGA/GAA / TTC/TCT/CTT foram as mais abundantes
em ambas espécies. Um total de 153 e 1928 pares de primers EST-SSRs foram propostos para
feijão-comum e para soja, respectivamente. Desses, sinteizaram-se 20 para soja, dos quais
apenas nove amplificaram (sendo quatro de tamanho esperado e, desses, dois polimórficos) e
dois foram transferíveis. Para feijão-comum sintetizaram-se 22, dos quais 15 amplificaram,
sendo que 11 apresentaram tamanho esperado e 10 desses foram polimórficos (PIC médio de
0,50); 11 dos funcionais foram transferidos para feijão-caupi, sendo oito de tamanho esperado
e cinco desses, polimórficos (PIC médio de 0,36). Análises detalhadas dos amplicons
seqüenciados determinaram que as extensões dos motivos de SSRs foram variáveis e que as
regiões flanqueadoras dessas repetições foram geralmente bem conservadas, confirmando o
sucesso da transferibilidade entre feijão-comum e feijão-caup