The remains of the Hellenistic-Roman harbour-town of Lasaia are situated in southeastern Crete on a headland at the NE end of the bay of Kaloi Limenes, while at a short distance from the shore lies the island of Traphos. The application of a geoarchaeological method allowed us to reconstruct the palaeogeography of the coast and track the evolution of the ancient harbour of Lasaia from the Minoan palatial period to Hellenistic-Roman times to the 17th century AD.The palaeogeography of the seafront of ancient Lasaia followed the relative sea level changes that occurred during the last 4,000 years along the coast of central and eastern Crete: from a tied island connected to the mainland by a strip of land when the sea level was at 4.15 ± 0.30 m between ca. 1900 BC and ca. 1600 BC, and 2.50 ± 0.20 m bmsl between ca. 1600 BC and ca. 1200 BC, to a low promontory jutting out into the sea within a short distance from the coast of Traphos when the sea level was at 1.20 ± 0.10 m bmsl between ca. 1200 BC and AD 1604, and finally to a narrow shore opposite the island, when the sea level rose to 0.55 ± 0.05 m bmsl during the AD 1604 earthquake, which remained there for a significant period of time within the last 400 years.During the Minoan palatial period, an artificial outer breakwater at the SW end of Traphos Island appears to have formed a protected harbour basin. In Hellenistic-Roman times, the outer breakwater had been submerged and an inner breakwater was constructed, leaving a channel between it and the island that allowed mariners to pass from the western to the eastern basin depending on the weather. In the early 17th c., the island was isolated from the mainland and provided shelter for Cretan refugees.Les vestiges de la ville portuaire antique de Lasaia sont situés dans le sud-est de la Crète sur un promontoire à l'extrémité nord-est de la baie de Kaloi Limenes, à proximité de l'île de Traphos. Nous avons pu reconstruire la paléogéographie de la côte et reconstituer l'évolution de l'ancien port de Lasaia de la période minoenne jusqu'au 17e siècle après J.-C. La paléogéographie du front de mer a suivi les changements relatifs du niveau de la mer qui se sont produits au cours des 4 000 dernières années. Le niveau de la mer était à -4,15 ± 0,30 m vers 1900-1600 avant J.-C., -2,50 ± 0,20 m vers 1600-1200 ans avant J.-C., -1,20 ± 0,10 m entre vers 1200 av. J.-C. et 1604 après J.-C., et enfin vers -0,55 ± 0,05 m lors du tremblement de terre de 1604 après J.-C. Pendant la période minoenne, un brise-lames à l'extrémité sud-ouest de l'île Traphos semble avoir protégé un bassin portuaire. À l'époque hellénistique et romaine, le brise-lames a été submergé et un deuxième brise-lames intérieur a été construit, permettant la circulation des navires du bassin ouest au bassin oriental en fonction de la météorologie marine. Au début du xviie siècle, l'île était finalement séparée du continent, offrant un abri à des réfugiés crétois