Méthodes statistiques en épidémiologie animale

Abstract

International audienceThe main aim of veterinary epidemiology is to increase knowledge on both i) the dynamics and impact ofdiseases on animal production, health and welfare and on ii) the risk of animal-acquired (i.e. zoonoses) and food-bornediseases in humans. Because animals and animal products are the source of income for a large sector of society, theemphasis on economic aspects is much more important in veterinary epidemiology than in human epidemiology.Typical research questions deal with the identification of risk factors for a disease, the estimation of the impact of adisease on production, the evaluation of the efficacy of a treatment or the timely identification of disease occurrence. Forthese purposes, a wide range of statistical techniques are used and several types of data sources exist. One peculiarityin animal productions is the collection of large production related data such as daily milk productions, live weightsor reproduction data for example. These extremely large databases are both an asset and a challenge for statisticalmodelling. To illustrate the data sources and statistical methods used in veterinary epidemiology, we present part of thework conducted following the emergence of the bluetongue virus in cattle in 2006. First, we show how the impacts ofthe disease on milk production and reproduction were estimated. Then, in order to improve the timeliness of detectionof such emergences, the application of syndromic surveillance methods to the bluetongue emergence is presented.Finally, some knowledge gaps and directions for future work are presented.L’objectif principal de l’épidémiologie animale est de faire progresser les connaissances à la fois sur i) ladynamique et l’impact des maladies sur les productions, la santé et le bien-être des animaux ii) les risques pour lasanté humaine associés aux maladies animales transmissibles à l’homme (zoonoses) et aux toxi-infections alimentaires.Parce que les animaux et les produits animaux sont une source de revenus majeure pour une partie de la population, uneplace plus importante est accordée aux aspects économiques en épidémiologie animale qu’en épidémiologie humaine.Pour un trouble de santé, des questions de recherche classiques auront trait à l’identification de facteurs de risquede survenue du trouble, l’estimation de son impact sur la production, l’évaluation de l’efficacité d’un traitement ouencore la détection précoce de sa survenue. A ces fins, un large éventail de méthodes statistiques est utilisé et denombreuses sources de données existent. Une particularité des productions animales consiste en la collecte de grandsvolumes de données en lien avec la production tels que des productions laitières quotidiennes par vache, des poidsvifs ou des données de reproduction. Ces grands volumes de données disponibles représentent à la fois un avantageet une difficulté pour la modélisation statistique. Pour illustrer les sources de données et les méthodes utilisables enépidémiologie animale, nous présentons des travaux effectués suite à l’émergence de la fièvre catarrhale ovine en 2006.Dans un premier temps, nous montrons comment les impacts de la maladie sur la production laitière et la reproductionont été estimés. Puis, dans l’objectif d’améliorer la précocité de la détection de telles émergence, l’application desméthodes de surveillance syndromique est présentée. Enfin des besoins de connaissances et des perspectives pour defutures recherches sont présentés