O estuário do rio Coreaú possui uma das margens tangenciando a área urbana de Camocim, enquanto a outra tangencia a APA das Dunas da Ilha da Testa Branca. Com o objetivo de verificar os efeitos das atividades antrópicas na margem urbanizada, este trabalho analisou parâmetros físico-químicos e microbiológicos em ambas as margens. Análises de pH, temperatura, turbidez, oxigênio dissolvido e DBO5 foram realizadas na água. Amostras do sedimento foram utilizadas para quantificação de matéria orgânica e de bactérias heterotróficas, enumeração de coliformes, quantificação de células procarióticas e de bactérias patogênicas. Não houve diferença significativa para os parâmetros físico-químicos, exceto para matéria orgânica no sedimento, maior na margem urbanizada. A densidade de bactérias heterotróficas e de células procarióticas é maior na margem urbanizada. Os resultados indicaram que coliformes termotolerantes ocorrem apenas na margem urbanizada. Todos os taxa bacterianos patogênicos são encontrados em maior densidade na margem urbanizada, onde a densidade de E. coli é quase cinco vezes maior. Nossos resultados indicam que o descarte de águas residuárias está relacionado com a maior densidade de bactérias patogênicas no sedimento da margem urbanizada o que pode resultar em um problema de saúde pública