Рассматривается задача об устойчивости вращающихся правильных вихревых N-угольников (томсоновских конфигурации) в конденсате Бозе-Эйнштейна в гармонической ловушке. Получена зависимость скорости вращения ω томсоновской конфигурации вокруг центра ловушки в зависимости от количества вихрей N и радиуса конфигурации R. Выполнен анализ устойчивости движения таких конфигураций в линейном приближении. Для N⩽6 построены области орбитальной устойчивости конфигураций в пространстве параметров. Показано, что вихревые N-угольники для N>6 при любых параметрах системы неустойчивы