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    Bases moleculares de la interacci贸n de la E3 ubiquitina ligasa TRIM7 con glucogenina-1 y su potencial relevancia en el contexto de la glucogenosis tipo XV

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    Tesis (Doctor en Ciencias Qu铆micas) - - Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas, 2021Resumen: La ubiquitinaci贸n es un tipo de modificaci贸n postraduccional caracter铆stico de organismos eucariotas, que requiere de la acci贸n conjunta de las enzimas E1 activadora, E2 conjugadora y E3 ligasa para mediar la transferencia de ubiquitina a una prote铆na sustrato. TRIM7 es una E3 ligasa que recientemente ha adquirido inter茅s por su rol en diversas patolog铆as, y pertenece a la familia de prote铆nas TRIM, caracterizadas por un motivo conservado tripartito (TRIM) N-terminal y una regi贸n C-terminal variable que puede mediar el reconocimiento de sustratos. Inicialmente, fue identificada como una prote铆na que interacciona a trav茅s de su dominio C-terminal B30.2 (TRIM7B30.2) con glucogenina-1 (GN1). Dicha prote铆na es responsable de la iniciaci贸n de la bios铆ntesis del gluc贸geno, por lo que las mutaciones que afectan al gen que la codifica se traducen en un trastorno extremadamente raro denominado glucogenosis tipo XV. El presente trabajo se centr贸 en caracterizar a TRIM7B30.2 por cristalograf铆a de rayos X, y describir detalles sobre las regiones relevantes para la interacci贸n con GN1. La estructura de TRIM7B30.2 revel贸 un plegamiento de tipo s谩ndwich-尾 formado por dos l谩minas 尾 antiparalelas caracter铆stico de este tipo de dominios, adem谩s de presentar una cavidad con carga positiva en la cara c贸ncava de dicho plegamiento. Adicionalmente, se logr贸 identificar a residuos clave que delimitan la zona involucrada en la interacci贸n con GN1, adem谩s de obtener indicios de que el extremo C-terminal de esta 煤ltima es necesario para su reconocimiento por TRIM7B30.2 y la prote铆na TRIM7 entera. Otra parte de este estudio se dedic贸 a conocer el impacto de la mutaci贸n patol贸gica Ala16Pro sobre GN1 de conejo, que presenta una alta homolog铆a con la prote铆na humana, mediante el uso de un amplio conjunto de t茅cnicas bioqu铆micas y biof铆sicas. El an谩lisis revel贸 un cambio estructural significativo que ocasion贸 una disminuci贸n de la afinidad por su sustrato y, en consecuencia, de la actividad de la prote铆na; adem谩s de una marcada p茅rdida de estabilidad. Por 煤ltimo, se busc贸 conocer si GN1 y sus mutantes patol贸gicas Ala16Pro y Thr83Met, son sustrato de su actividad E3 ligasa; y si esto podr铆a tener un rol relevante en la glucogenosis tipo XV. Los resultados de la reacci贸n in vitro mostraron que la transferencia de ubiquitina no ocurre bajo las condiciones empleadas, sin embargo, se encontr贸 que TRIM7 interacciona con la mutante patol贸gica GN1 Ala16Pro pese al cambio estructural de la prote铆na, lo que podr铆a implicar a TRIM7 en la v铆a de degradaci贸n de esta mutante, y por ello el estudio ser谩 continuado en cultivos celulares.Abstract : Ubiquitination is a common post translational modification in eukaryotes, which involves an E1 activating enzyme, an E2 conjugating enzyme, and an E3 ligase enzyme; in a process that mediates the transfer of ubiquitin to a substrate protein. TRIM7 is an E3 ligase member of the TRIM protein family, characterized by an N-terminal tripartite motif (TRIM) and a variable C-terminal region that can mediate substrate recognition, that has been recently linked to diverse pathological processes. TRIM7 was initially identified as a glycogenin-1 (GN1) interacting protein, and this interaction involves the C-terminal B30.2 domain of TRIM7 (TRIM7B30.2). GN1 is the protein that initiates glycogen biosynthesis, and mutations in the gene that encodes for this enzyme are involved in the onset of an extremely rare disease known as type XV glycogen storage disease. This work was mainly focused on the characterization of TRIM7B30.2, through the use of X-ray crystallography, and the details of the region involved in the interaction with GN1. The structure of TRIM7B30.2 revealed the characteristic B30.2 domain fold consisting of two 尾-sheets arranged as a distorted 尾-sandwich, and a positively charged cavity in the hypervariable region of this domain. Besides, key residues that define the zone of interaction with GN1 were identified, and evidence for the requirement of the latter鈥檚 C-terminal region in the binding was found. This study was also focused on the effect of the pathogenic Ala16Pro mutation on rabbit GN1, which displays a high sequence homology with the human protein; and to this end, a wide range of biophysical and biochemical techniques were applied. The analysis revealed a significant structural change which resulted in a decrease in substrate affinity and protein activity, besides a considerable loss of stability. Finally, the thesis was oriented towards analyzing the potential E3 ligase activity of TRIM7 on GN1 and the pathological mutants Ala16Pro and Thr83Met, and its possible functional role on type XV glycogen storage disease. The results have shown that in vitro, TRIM7 does not transfer ubiquitin to GN1 or the mutants in this experimental setup. However, it was found that despite the structural change caused by the mutation, TRIM7 still interacts with the Ala16Pro mutant of human GN1, which might implicate the intervention of TRIM7 in the degradation pathway of this mutant, and for this reason, this study will be continued in cell cultures.2023-08-30Fil: Mu帽oz Sosa, Christian Javier. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas; Argentina.Fil: Carrizo Garcia, Mar铆a Elena. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas. Departamento de Qu铆mica Biol贸gica; Argentina.Fil: Carrizo Garcia, Mar铆a Elena. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Centro de Investigaciones en Qu铆mica Biol贸gica de C贸rdoba; Argentina.Fil: Genti de Raimondi, Susana Del Valle. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas. Departamento de Bioqu铆mica Cl铆nica; Argentina.Fil: Genti de Raimondi, Susana del Valle. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Centro de Investigaciones en Bioqu铆mica Cl铆nica e Inmunolog铆a; Argentina.Fil: Carbonio, Raul Ernesto. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas. Departamento de Fisicoqu铆mica; Argentina.Fil: Carbonio, Raul Ernesto. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Instituto de Investigaciones en Fisicoqu铆mica de C贸rdoba; Argentina.Fil: Romero, Jorge Miguel. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Qu铆micas; Argentina.Fil: Erm谩cora, Mario Roberto. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Instituto Multidisciplinario de Biolog铆a Celular; Argentina

    Pol铆ticas y estrategias de comunicaci贸n. Caso FCEFyN

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    Trabajo Final para optar al grado acad茅mico de Licenciatura en Comunicaci贸n Social, Universidad Nacional de C贸rdoba (in茅dita) Calificaci贸n: 10 (diez) Orientaci贸n InstitucionalLa comunicaci贸n es el soporte fundamental para la construcci贸n colectiva de los imaginarios en cada 茅poca y sociedad y, adem谩s, es una herramienta sumamente importante a la hora de comprender y analizar las relaciones y v铆nculos humanos. La tarea que tienen hoy las organizaciones, referentes sociales y profesionales independientes, es entender la manera en que las personas se relacionan: reconocer esos v铆nculos y diagnosticarlos, sistematizar sus caracter铆sticas para establecer fortalezas y debilidades. Con esa informaci贸n podr谩n planificar acciones comunicacionales que se dirijan a la concreci贸n de los objetivos y las necesidades de la organizaci贸n. A trav茅s de la optimizaci贸n de los procesos de comunicaci贸n, su sistematizaci贸n, planificaci贸n e implementaci贸n, se podr谩n garantizar resultados en todos sus niveles institucionales, potenciando los v铆nculos tanto internos como externos. As铆, la comunicaci贸n se vuelve un veh铆culo y un elemento fundamental y estrat茅gico a la hora de gestionar de las organizaciones.Fil: Rasano, Valentina. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias de la Comunicaci贸n; Argentina.Fil: Vankeirsbilck, Debora Florencia. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias de la Comunicaci贸n; Argentina

    Contra escenario: m煤sica, identidades culturales y narrativas audiovisuales

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    Trabajo Final para optar al grado acad茅mico de Licenciatura en Comunicaci贸n Social, Universidad Nacional de C贸rdoba (in茅dita). Calificaci贸n: 8 (ocho) Orientaci贸n AudiovisualEl presente Trabajo Final para la obtenci贸n de la Licenciatura en Comunicaci贸n Social se inscribe bajo la modalidad de producto, y consiste en el desarrollo de una serie audiovisual de cuatro cap铆tulos, llamada 鈥淐ontra Escenario鈥, a emitirse de forma online a trav茅s de un canal de YouTube. En el mismo se relatan las experiencias, proyectos y visiones de las bandas que forman parte del circuito de La Nueva Generaci贸n en la provincia de C贸rdoba. La Nueva Generaci贸n tiene caracter铆sticas identitarias propias que no s贸lo nos ayudan a entender a este fen贸meno como un colectivo, sino tambi茅n como una identidad cultural nacida dentro de lo que denominamos 鈥渃ultura digital鈥, atravesada en lo pol铆tico, est茅tico, musical y social, por el uso de las multipantallas. Para la realizaci贸n del presente trabajo final de grado se realiz贸 un recorrido hist贸rico del pop/rock nacional desde la d茅cada del 80 hasta la actualidad, para buscar las bandas que sirvieron de gu铆a a los artistas de hoy, describiendo c贸mo fueron atravesados en su transitar por cuestiones pol铆ticas, sociales y culturales, influenciando a帽os m谩s tarde a lo que denominamos hoy como La Nueva Generaci贸n.Fil: Cambas, Juan Alfonso. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias de la Comunicaci贸n; Argentina

    Desarrollo de papeles biocativos por injerto de mol茅culas espec铆ficas en celulosa

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    Tesis (DCI)--FCEFN-UNC, 2019En la presente tesis se presenta el desarrollo de papeles bioactivos con potencial aplicaci贸n en el envasado activo de alimentos. Para tal fin, se propuso el injerto de eugenol, un compuesto de origen natural con propiedades antimicrobiana, antioxidante y repelente de insectos, en celulosa, utilizando 谩cido policarbox铆lico como agente ligante. Con el objetivo de evaluar la escalabilidad del proceso propuesto, se estudiaron distintas tecnolog铆as de curado, tales como calentamiento por convecci贸n, infrarrojo, microondas y conducci贸n. En todos los casos, se analizaron la influencia de las variables operativas sobre el avance de la reacci贸n y propiedades finales del papel preparado, utilizando un dise帽o de experimentos Doehlert para elegir las experiencias a realizar, y analizando los resultados mediante metodolog铆a de superficie de respuesta y an谩lisis estad铆stico ANOVA. Se pudo comprobar que la reacci贸n de injerto de eugenol en papel comercial se produjo con 茅xito en todas las tecnolog铆as estudiadas. Asimismo, se encontraron las condiciones 贸ptimas de reacci贸n para cada una de las tecnolog铆as, para lo cual se busc贸 un compromiso entre el avance de la reacci贸n y las propiedades finales del material (mec谩nicas y color). A partir de estas condiciones, se prepararon papeles y se realiz贸 una caracterizaci贸n m谩s espec铆fica para su aplicaci贸n como envase de alimentos comparando los papeles modificados con el papel virgen. Se analizaron las propiedades mec谩nicas por ensayo de tracci贸n, rasgado y punzonado y se midi贸 la absorci贸n de agua y la capacidad de degradaci贸n. Por otro lado, las propiedades bioactivas analizadas fueron la actividad antioxidante, antimicrobiana, repelente e insecticida de gorgojos (T. castaneum y R. dominica). Una vez probado que el papel modificado presenta buenas caracter铆sticas f铆sicas y bioactivas para su posible aplicaci贸n en el envasado de alimentos, se realizaron prototipos de envasado para harina, como alimento representativo de alimentos derivados de cereales, susceptibles al ataque de plagas. En este estudio se analiz贸 la migraci贸n de reactivos, propiedades organol茅pticas y conservaci贸n del alimento, arrojando resultados promisorios para la industria de envases de alimentos. Finalmente, se realiz贸 una comparaci贸n de las tecnolog铆as de curado ensayadas, analizando diferentes aspectos como avance de reacci贸n, propiedades finales, apariencia, tiempo de reacci贸n, consumo de energ铆a, entre otros, como as铆 tambi茅n disponibilidad y uso de estas tecnolog铆as a escala industrial, seleccionando la tecnolog铆a de conducci贸n como la m谩s adecuada para una propuesta de escalado industrial.Fil: Muratore, Florencia. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias Exactas, F铆sicas y Naturales; Argentina.Fil: Muratore, Florencia. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Instituto de Investigaci贸n y Desarrollo en Ingenier铆a de Procesos y Qu铆mica Aplicada; Argentina

    Application of lactic acid bacteria for the biopreservation of meat products: A systematic review

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    .The increasing concern of consumers about food quality and safety and their rejection of chemical additives has promoted the breakthrough of the biopreservation field and the development of studies on the use of beneficial bacteria and their metabolites as potential natural antimicrobials for shelf life extension and enhanced food safety. Control of foodborne pathogens in meat and meat products represents a serious challenge for the food industry which can be addressed through the intelligent use of bio-compounds or biopreservatives. This article aims to systematically review the available knowledge about biological strategies based on the use of lactic acid bacteria to control the proliferation of undesirable microorganisms in different meat products. The outcome of the literature search evidenced the potential of several strains of lactic acid bacteria and their purified or semi-purified antimicrobial metabolites as biopreservatives in meat products for achieving longer shelf life or inhibiting spoilage and pathogenic bacteria, especially when combined with other technologies to achieve a synergistic effect.S

    Absurdos digitales: una serie de podcast sobre redes sociales y cultura pol铆tica contempor谩nea

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    Trabajo Final para optar al grado acad茅mico de Licenciatura en Comunicaci贸n Social, Universidad Nacional de C贸rdoba (in茅dita). Calificaci贸n: 10 (diez) Orientaci贸n radiof贸nica鈥淎bsurdos Digitales: Un podcast sobre redes sociales y cultura pol铆tica contempor谩nea鈥 es un producto sonoro presentado en formato podcast como propuesta de trabajo final para la Licenciatura en Comunicaci贸n Social. Este trabajo tiene como objetivo generar una reflexi贸n en torno a los nuevos repertorios de acci贸n pol铆tica en redes sociales y a las modalidades que adopta el debate p煤blico en el espacio digital. Para ello, nos centramos en el an谩lisis de dos fen贸menos de la cultura digital que canalizan discursos pol铆ticos en redes sociales: los memes y las fake news. La producci贸n cuenta con dos piezas sonoras que corresponden a los primeros episodios de la serie y abordan respectivamente el uso pol铆tico de los memes y el empleo estrat茅gico de las fake news como elementos constitutivos de la comunicaci贸n pol铆tica. El an谩lisis toma como referencia los principales discursos y eventos que conciernen a la pol铆tica nacional e internacional de la 煤ltima d茅cada (2010-2020), a los fines de ejemplificar lo expuesto con una realidad actual. Esta propuesta parte de una premisa en torno a la consolidaci贸n de las redes sociales como espacio p煤blico de encuentro y debate ciudadano y de la inquietud por abordar los desaf铆os que transitamos como sujetos pol铆ticos frente al desarrollo de las tecnolog铆as de comunicaci贸n e informaci贸n. El producto es el resultado de una instancia de relevamiento te贸rico, un trabajo de recolecci贸n de informaci贸n mediante entrevistas y un proceso de producci贸n y dise帽o sonoro. Es una iniciativa que propone aportar a la comprensi贸n de nuestras pr谩cticas digitales cotidianas como actos pol铆ticos transformadores, a los fines de construir herramientas para mejorar nuestra experiencia como usuarios de redes sociales y enriquecer nuestra participaci贸n en espacio p煤blico digital. Por 煤ltimo, nos proponemos utilizar la diversidad de recursos sonoros y radiales existentes y atender a la potencialidad expresiva de lo sonoro para generar un producto atractivo y entretenido a la escucha, capaz de interpelar a una audiencia usuaria de redes sociales.Fil: Hern谩ndez Mazzola, Diego Ernesto. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias de la Comunicaci贸n; Argentina.Fil: Stejman, Debora. Universidad Nacional de C贸rdoba. Facultad de Ciencias de la Comunicaci贸n; Argentina

    What is the importance of sperm subpopulations?

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    .The study of sperm subpopulations spans three decades. The origin, meaning, and practical significance, however, are less clear. Current technology for assessing sperm morphology (CASA-Morph) and motility (CASA-Mot) has enabled the accurate evaluation of these features, and there are many options for data classification. Subpopulations could occur as a result of the stage of development of each spermatozoon in the subpopulation. Spermatogenesis might contribute to the production of these subpopulations. Insights from evolutionary biology and recent molecular research are indicative of the diversity among male gametes that could occur from unequal sharing of transcripts and other elements through cytoplasmic bridges between spermatids. Sperm cohorts exiting the gonads would contain different RNA and protein contents, affecting the spermatozoon physiology and associations with the surrounding environmental milieu. Subsequently, these differences could affect how spermatozoa interact with the environmental milieu (maturation, mixing with seminal plasma, and interacting with the environmental milieu, or female genital tract and female gamete). The emergence of sperm subpopulations as an outcome of evolution, related to the reproductive strategies of the species, genital tract structures, and copulatory and fertilization processes. This kind of approach in determining the importance of sperm subpopulations in fertilization capacity should have a practical impact for conducting reproductive technologies, inspiring and enabling new ways for the more efficient use of spermatozoa in the medical, animal breeding, and conservation fields. This manuscript is a contribution to the Special Issue in memory of Dr. Duane GarnerS

    A new index of resilience applicable to external pulse-disturbances that considers the recovery of communities in the short term

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    .Resilience is a key concept in the study of the recovery of ecosystems affected by disturbances. Currently, there are numerous indices to measure resilience, but many of them do not show the accuracy of the resilience value or the behaviour of ecological parameters in the face of disturbances. New approaches and technologies enable large amounts of information to be obtained, facilitating the proposal of new resilience indices that work consistently and intuitively for a wide variety of ecological response variables under different scenarios after pulse-disturbances. In this study, we propose and verify a new resilience index, comparing its performance with others previously published. We validated the performance of the new index using real data based on field measurements of changes in soil bacterial OTUs diversity and abundance after a wildfire. The new resilience index provided an automatic and robust functional classification of the behaviour of ecosystems after disturbances, supported by a bootstrap analysis. We identified 5 scenarios of ecosystem resilience performance according to their behaviour after a pulse-disturbance: resilient, non-resilient, recovering, rebound, and continuing.S

    Identification of Hindbrain Neural Substrates for Motor Initiation in the hatchling Xenopus laevis Tadpole

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    Animal survival profoundly depends on the ability to detect stimuli in the environment, process them and respond accordingly. In this respect, motor responses to a sensory stimulation evolved into a variety of coordinated movements, which involve the control of brain centres over spinal locomotor circuits. The hatchling Xenopus tadpole, even in its embryonic stage, is able to detect external sensory information and to swim away if the stimulus is considered noxious. To do so, the tadpole relies on well-known ascending sensory pathway, which carries the sensory information to the brain. When the stimulus is strong enough, descending interneurons are activated, leading to the excitation of spinal CPG neurons, which causes the undulatory movement of swimming. However, the activation of descending interneurons that marks the initiation of motor response appears after a long delay from the sensory stimulation. Furthermore, the long-latency response is variable in time, as observed in the slow-summating excitation measured in descending interneurons. These two features, i.e. long-latency and variability, cannot be explained by the firing time and pattern of the ascending sensory pathway of the Xenopus tadpole. Therefore, a novel neuronal population has been proposed to lie in the hindbrain of the tadpole, and being able to 'hold' the sensory information, thus accounting for the long and variable delay of swim initiation. In this work, the role of the hindbrain in the maintenance of the long and variable response to trunk skin stimulation is investigated in the Xenopustadpole at developmental stage 37/38. A multifaceted approach has been used to unravel the neuronal mechanisms underlying the delayed motor response, including behavioural experiments, electrophysiology analysis of fictive swimming, hindbrain extracellular recordings and imaging experiments. Two novel neuronal populations have been identified in the tadpole's hindbrain, which exhibit activation patterns compatible with the role of delaying the excitation of the spinal locomotor circuit. Future work on cellular properties and synaptic connections of these newly discovered populations might shed light on the mechanism of descending control active at embryonic stage. Identifying supraspinal neuronal populations in an embryonic organism could aid in understanding mechanisms of descending motor control in more complex vertebrates

    Balancing the urban stomach: public health, food selling and consumption in London, c. 1558-1640

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    Until recently, public health histories have been predominantly shaped by medical and scientific perspectives, to the neglect of their wider social, economic and political contexts. These medically-minded studies have tended to present broad, sweeping narratives of health policy's explicit successes or failures, often focusing on extraordinary periods of epidemic disease viewed from a national context. This approach is problematic, particularly in studies of public health practice prior to 1800. Before the rise of modern scientific medicine, public health policies were more often influenced by shared social, cultural, economic and religious values which favoured maintaining hierarchy, stability and concern for 'the common good'. These values have frequently been overlooked by modern researchers. This has yielded pessimistic assessments of contemporary sanitation, implying that local authorities did not care about or prioritise the health of populations. Overly medicalised perspectives have further restricted historians' investigation and use of source material, their interpretation of multifaceted and sometimes contested cultural practices such as fasting, and their examination of habitual - and not just extraordinary - health actions. These perspectives have encouraged a focus on reactive - rather than preventative - measures. This thesis contributes to a growing body of research that expands our restrictive understandings of pre-modern public health. It focuses on how public health practices were regulated, monitored and expanded in later Tudor and early Stuart London, with a particular focus on consumption and food-selling. Acknowledging the fundamental public health value of maintaining urban foodways, it investigates how contemporaries sought to manage consumption, food production waste, and vending practices in the early modern City's wards and parishes. It delineates the practical and political distinctions between food and medicine, broadly investigates the activities, reputations of and correlations between London's guild and itinerant food vendors and licensed and irregular medical practitioners, traces the directions in which different kinds of public health policy filtered up or down, and explores how policies were enacted at a national and local level. Finally, it compares and contrasts habitual and extraordinary public health regulations, with a particular focus on how perceptions of and actual food shortages, paired with the omnipresent threat of disease, impacted broader aspects of civic life
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