A whole-genome sequence and transcriptome perspective on HER2-positive breast cancers

HER2-positive breast cancer has long proven to be a clinically distinct class of breast cancers for which several targeted therapies are now available. However, resistance to the treatment associated with specific gene expressions or mutations has been observed, revealing the underlying diversity of these cancers. Therefore, understanding the full extent of the HER2-positive disease heterogeneity still remains challenging. Here we carry out an in-depth genomic characterization of 64 HER2-positive breast tumour genomes that exhibit four subgroups, based on the expression data, with distinctive genomic features in terms of somatic mutations, copy-number changes or structural variations. The results suggest that, despite being clinically defined by a specific gene amplification, HER2-positive tumours melt into the whole luminal-basal breast cancer spectrum rather than standing apart. The results also lead to a refined ERBB2 amplicon of 106 kb and show that several cases of amplifications are compatible with a breakage-fusion-bridge mechanism

Les "projets de territoire", de nouveaux outils pour la gestion partenariale des enjeux environnementaux

L'action publique territoriale s'est profondément transformée en France au cours des trente dernières années. Comment les acteurs peuvent-ils néanmoins mener à bien une action collective, et sur quels outils peuvent-ils s'appuyer pour ce faire ? A partir de trois cas de protection du patrimoine naturel faune, flore, habitats relatifs à des territoires de grandes dimensions, nous souhaitons montrer que, dans ces situations, de nouveaux outils que nous appellerons « projets de territoire », combinant planification de l'action et consensus entre acteurs, peuvent accompagner l'action collective et contribuer à sa réalisation en partenariat

La gestion des biens environnementaux

National audienceManagement of environmental goods is carried out in particular conditions considering the specific patterns of these goods, for it requires a coordination between many players. This latter reveals to be a matter for a complex and long term action, which may take various forms, tailor-made elaborated in view with the characteristics of each situation. Studying these particular coordinations may be done according to a management sciences approach. This approach allows to understand the action logics of the players, the methods and instruments they use to coordinate each other, and the action devices they build collectively. The cases observed point out that consistent results may be obtained under certain conditions. They show also that the questions addressed bear not only on the action contents but also on the redefinition of the different players parts, and reflects an uncompleted transformation.La gestion des biens environnementaux s'exerce dans des conditions particulières compte tenu des spécificités de ces biens car elle appelle une coordination entre de nombreux acteurs. Celle-ci s'avère relever d'une action complexe et de longue haleine pouvant prendre des formes très variées, élaborées « sur mesure » au regard des caractéristiques de chaque situation. L'étude de ces coordinations particulières peut être réalisée selon une approche relevant des sciences de gestion. Celle-ci permet de comprendre les logiques d'action des parties en présence, les modalités et instruments auxquels ils recourent pour se coordonner, et les dispositifs d'action qu'ils construisent collectivement. Les expériences observées révèlent que des résultats conséquents peuvent être obtenus sous certaines conditions. Elles montrent aussi que les questions posées ne portent pas seulement sur le contenu de l'action à mener mais aussi sur la redéfinition des rôles des différents acteurs, et reflètent une mutation encore inachevée

Les aspects spatiaux et territoriaux de l'action collective dans le domaine de l'eau

La préservation de l'eau et des milieux aquatiques appelle une action spécifique de la part des acteurs intéressés par l'état du patrimoine lié à l'eau. Cette contribution se propose de montrer comment cette action est structurée du point de vue territorial. Trois cas contrastés, le Val d'Allier entre Moulins et Vichy (Allier), les marais du Cotentin (Manche) et la baie du Mont-Saint-Michel (Manche et Ille-et-Vilaine), servent de support à la démarche. La première partie précise ce que nous entendons par structuration de logiques d'action, par action collective, par espace et par territoire, puis présente la démarche d'étude retenue. La seconde partie caractérise les structures territoriales rencontrées relatives tout d'abord aux différentes actions réalisées, ensuite aux enjeux retenus, puis aux acteurs concernés ; enfin, elle en dégage les éléments territoriaux sur lesquels repose la structuration des logiques d'action dans leur ensemble

Maîtrise foncière et protection d'un captage d'eau potable : enseignements tirés d'une expérience originale

L'acquisition de la propriété foncière est une solution intéressante pour assurer la maîtrise de la qualité de l'eau d'un captage, lorsque l'usage productif de certains espaces doit être fortement restreint. Mais de tels projets d'acquisition peuvent se heurter à un marché foncier bloqué par des propriétaires en position de monopole. En se basant sur une opération réelle, cet article détaille la nature des problèmes fonciers en cause et les caractéristiques du dispositif technique retenu ayant permis de les surmonter. Afin de faciliter l'extension de ce mode d'intervention à d'autres captages d'eau potable, il propose que de telles acquisitions foncières puissent être reconnues d'utilité publique, de manière à faciliter le recours éventuel à des instruments d'intervention foncière efficaces. / Land property ownership purchase becomes a solution worth studying to control the quality of the water of a drinking water collection area when the productive use of certain areas needs to be restricted. However such purchase projects may come up against a land market that is blocked by owners in a monopolistic position. Based on a real-life operation, this article sets out the nature of land problems in question and the characteristics of the technical system that enabled these problems to be resolved. In order to facilitate the extension of this mode of intervention to other drinking water collection areas, we propose that such land property ownership purchases be state-approved. This will in turn facilitate any future use of efficient land intervention tools

Politiques de développement rural et niveaux de décision : une approche organisationnelle

National audienceDue to their own complexity, related with the stakes' and actors' variety and interdependency, rural development concerns account for more and more sophisticated action settings, which contents is defined not only beforehand but also all along the implementation stage. This paper puts an analysis grid which accounts for the multi level organization of these action settings. This grid is then used to show the construction at different levels of the European Agricultural Fund for Rural Development (EAFRD) setting. Prospects are finally suggested about the conception of action settings in this field.De par leur complexité propre, liée à la diversité et à l'interdépendance des enjeux et des acteurs concernés, les questions de développement rural motivent la conception de dispositifs d'action publique de plus en plus élaborés, dont le contenu n'est pas défini seulement à l'amont mais aussi tout au long de la phase de mise en ½uvre. Cet article propose une grille de lecture permettant de rendre compte de l'organisation à différentes échelles de ces dispositifs d'action. Cette grille est ensuite utilisée pour présenter la construction du dispositif relatif au Fonds européen agricole de développement rural (FEADER). Des perspectives sont suggérées concernant la conception des dispositifs d'action dans ce domaine

Acquisition foncière et environnement : le cas de la protection d'un captage d'eau potable

Egalement paru dans : Ingénieries EAT, 21, pp 3-14, 2000 Note de rechercheNational audienceLe recours à l'acquisition foncière dans un objectif de protection de l'environnement constitue un mode d'intervention des pouvoirs publics de plus en plus utilisé. Pourtant cette solution n'est pas sans poser problème, tant dans son principe que dans sa mise en oeuvre. En s'appuyant sur une typologie des instruments d'action sur le foncier, les auteurs proposent une analyse du cas de la protection d'un important captage d'eau potable. L'accent est mis sur les incertitudes en présence et leur prise en compte lors du choix des dispositifs d'intervention publique, ainsi que sur les conditions de transférabilité de la solution retenue

Coordinations locales et action collective pour une agriculture multifonctionnelle

La mondialisation de l'économie et la diversification des attentes des sociétés obligent à une redéfinition des politiques agricoles. L'idée que la promotion de la multifonctionnalité de l'agriculture puisse les fonder de façon légitime est aujourd'hui en débat, en Europe et dans le monde. Cette orientation politique nouvelle peut transformer le cadre d'action des disciplines scientifiques ouvrant dans cadre des trois instituts. C'est pourquoi l'INRA, le Cemagref et le CIRAD ont décidé de la mise en place d'un dispositif commun visant à fédérer et à appuyer les travaux de recherche et d'expertise ayant trait à la multifonctionnalité de l'agriculture

Quels instruments de coordination locale en faveur de la gestion de l'espace ? Une expérience originale de maîtrise foncière en situation de fort enjeu environnemental

Extrait de documentThis communication analyses a posteriori a real case of struggle against water pollution. The studied case corresponds to the protection of an important drinking water harnessing in the West of France, threatened by a strong pollution. Without any direct juridical way to overcome this situation, a local community has purchased the land property ownership of a signifiant part of the harnessing's catchment, after having transferred on the land property market its initially non market demand. The authors suggest a typology of public actions tools for land property to highlight the selected mechanism. Economical and juridical characteristics of land property purchase are discussed in face with other solutions, in particular contracts.Ce papier analyse a posteriori un exemple concret de lutte contre la pollution de l'eau. Le cas étudié correspond à la protection d'un important captage d'eau potable de l'Ouest de la France, menacé par une forte pollution. En l'absence de moyen juridique direct lui permettant de surmonter cette situation, une collectivité publique a acquis en pleine propriété une surface significative du bassin versant donnant sur le captage, à la suite d'un transfert sur le marché foncier de sa demande initialement non marchande. Les auteurs proposent une typologie des instruments d'action publique sur le foncier pour mettre en perspective le dispositif retenu. Les caractéristiques économiques et juridiques de l'acquisition foncière sont ensuite discutées au regard d'autres solutions, notamment contractuelles