Effects of wheat bran replacement with pomegranate seed pulp on rumen fermentation, gas production, methanogen and protozoa populations of camel and goat rumen using competitive PCR technique: An in vitro study

BackgroundMicrobial populations in the rumen play an essential role in the degradation of Cellulosic dietary components and in providing nutrients to the host animal.ObjectiveThis study aims to detect the effect of pomegranate seed pulp (PSP) on rumen fermentation, digestibility and methanogens and the protozoa population (by competitive polymerase chain reaction [PCR]) of the camel and goat rumen fluid.Materials and methodsPSP was added to the experimental treatments and replaced by wheat bran (0%, 5% and 10%). Rumen fluid was collected from three goats and two camels according to the similarity of sex, breed, origin and time and used for three gas production studies. DNA extraction was performed by the RBB + c method, the ImageJ programme calculated band intensities (target and competing DNA), and line gradients were plotted based on the number of copies and intensity.ResultsOur result showed that diets did not significantly affect the methanogen and protozoa population. Animal species affected microbial populations so that both populations in camels were less than goats. The production of gas and volatile fatty acids was not affected by diets. These two parameters and NH3 concentration and methane production in goats were higher than in camel. The pH of digested dry matter and microbial protein in camels was higher than in goats.ConclusionsTherefore, the competitive PCR technique is an effective method for enumerating rumen microbiota. This supplementation can be considered a strategy to achieve performance and environmental benefits.The competitive PCR technique is an effective method for the enumeration of rumen microbiota.This supplementation can be considered a strategy to achieve performance and environmental benefits.imag

Etude de l’organisation des gènes des protéines du lait au sein du noyau et attachement de ces gènes à la matrice nucléaire

Diplôme : Dr. d'UniversitéMilk protein gene expression is induced during pregnancy and peaks during lactation under the influence of lactogenic hormones. WAP is a major protein in the milk of some species, in which WAP gene expression is specific to the mammary gland and related to variations in the chromatin structure surrounding the gene. In the human, mouse and pig, the WAP gene is localized between the ubiquitously expressed Tbrg4 and Ramp3. Our results reveal a differential DNA methylation profile, not only between mammary gland and liver, but also throughout the WAP locus. These variations in the methylation profile have been linked to the presence of several matrix attachment regions (MARs) which were predicted around the mouse and rabbit WAP gene in silico. Our studies have now shown that one of these MARs, located at +13 kb downstream of the WAP gene, was associated to the nuclear matrix through its interaction with Topoisomerase II. Four other MARs located at -14.5, -11, -2.2, and +8.5 kb from the transcription start point of the WAP gene were identified in HC11 cells using macroarrays, specific to the mouse WAP locus. A fifth MAR, located at +3 kb downstream of the WAP gene, was only detected in non-induced HC11. These MARs may contribute to organization of the chromatin surrounding the WAP gene in several loops. The loop containing the WAP gene was larger in induced cells (11.7 kb) than that in non-induced cells (5.7 kb) and could explain the differential expression profile of the WAP gene. Two other MARs predicted in silico and located at -16 and -7.4 kb may bind to SATB1. They may anchor the chromatin to the nuclear matrix in cells expressing this protein such as lymphoma or aggressive mammary tumor cells, and contribute to repressing expression of the WAP gene.L’expression des gènes des protéines du lait est induite au cours de la gestation. Elle est maximale en lactation. Cette expression est régulée par les hormones lactogènes. La WAP est une protéine majeure dans le lait de certaines espèces. Chez ces espèces, l’expression du gène WAP est spécifiquement mammaire et associée à des variations de structure chromatinienne. Chez l’homme, la souris et le porc, le gène WAP est situé entre deux autres gènes, Ramp3 et Tbrg4, dont l’expression est ubiquitaire. Ce travail de thèse, nous a permis de décrire le profil de méthylation de l’ADN qui varie tout au long de la séquence du locus entourant le gène WAP chez la lapine et qui est différent entre la glande mammaire et le foie. Ces variations de profils de méthylation ont pu être associées à l’existence de plusieurs régions d’attachement à la matrice nucléaire (MAR) décrites dans un premier temps par une étude in silico chez la lapine et la souris. Dans un deuxième temps, nous avons montré qu’une de ces MARs, située à +13 kb en aval du gène WAP, est associée à la matrice par la Topoisomérase II dans les cellules épithéliales mammaires de souris (HC11), que ces cellules soient stimulées ou non par les hormones lactogènes. Parmi les autres MARs, quatre MARs, situées à -14,5, -11, -2,2, et +8,5 kb sont également en interaction avec la matrice nucléaire dans les cellules HC11 et ont été mises en évidence grâce à l’utilisation de macro-réseaux spécifiques du locus WAP de souris. En plus de ces MARs observées quelles que soient les conditions de culture des cellules, une cinquième est retrouvée dans les cellules HC11 non stimulées par les hormones lactogènes (situées à +3 kb). Ces régions permettent d’organiser la chromatine qui entoure le gène WAP en différentes boucles. Une boucle plus grande entourerait le gène WAP dans les cellules stimulées (11,7 kb versus 5,2 kb dans les cellules non stimulées). Cette organisation pourrait favoriser l’expression du gène WAP. Deux MARs supplémentaires, qui pourraient interagir avec la protéines SATB1, sont présentes à -16 et -7,4 kb en amont du gène WAP. Elles pourraient ancrer la chromatine à la matrice nucléaire dans les cellules qui expriment cette protéine en abondance comme les lymphomes ou les cellules mammaires tumorales agressives et participer à une répression de l’expression du gène

Etude de l'organisation des gènes des protéines du lait au sein du noyau et attachement de ces gènes à la matrice nucléaire

L expression des gènes des protéines du lait est induite au cours de la gestation. Elle est maximale en lactation. Cette expression est régulée par les hormones lactogènes. La WAP est une protéine majeure dans le lait de certaines espèces. Chez ces espèces, l expression du gène WAP est spécifiquement mammaire et associée à des variations de structure chromatinienne. Chez l homme, la souris et le porc, le gène WAP est situé entre deux autres gènes, Ramp3 et Tbrg4, dont l expression est ubiquitaire. Ce travail de thèse, nous a permis de décrire le profil de méthylation de l ADN qui varie tout au long de la séquence du locus entourant le gène WAP chez la lapine et qui est différent entre la glande mammaire et le foie. Ces variations de profils de méthylation ont pu être associées à l existence de plusieurs régions d attachement à la matrice nucléaire (MAR) décrites dans un premier temps par une étude in silico chez la lapine et la souris. Dans un deuxième temps, nous avons montré qu une de ces MARs, située à +13 kb en aval du gène WAP, est associée à la matrice par la Topoisomérase II dans les cellules épithéliales mammaires de souris (HC11), que ces cellules soient stimulées ou non par les hormones lactogènes. Parmi les autres MARs, quatre MARs, situées à -14,5, -11, -2,2, et +8,5 kb sont également en interaction avec la matrice nucléaire dans les cellules HC11 et ont été mises en évidence grâce à l utilisation de macro-réseaux spécifiques du locus WAP de souris. En plus de ces MARs observées quelles que soient les conditions de culture des cellules, une cinquième est retrouvée dans les cellules HC11 non stimulées par les hormones lactogènes (situées à +3 kb). Ces régions permettent d organiser la chromatine qui entoure le gène WAP en différentes boucles. Une boucle plus grande entourerait le gène WAP dans les cellules stimulées (10,7 kb versus 5,2 kb dans les cellules non stimulées). Cette organisation pourrait favoriser l expression du gène WAP. Deux MARs supplémentaires, qui pourraient interagir avec la protéines SATB1, sont présentes à -16 et -7,4 kb en amont du gène WAP. Elles pourraient ancrer la chromatine à la matrice nucléaire dans les cellules qui expriment cette protéine en abondance comme les lymphomes ou les cellules mammaires tumorales agressives et participer à une répression de l expression du gène.Milk protein gene expression is induced during pregnancy and peaks during lactation under the influence of lactogenic hormones. WAP is a major protein in the milk of some species, in which WAP gene expression is specific to the mammary gland and related to variations in the chromatin structure surrounding the gene. In the human, mouse and pig, the WAP gene is localized between the ubiquitously expressed Tbrg4 and Ramp3. Our results reveal a differential DNA methylation profile, not only between mammary gland and liver, but also throughout the WAP locus. These variations in the methylation profile have been linked to the presence of several matrix attachment regions (MARs) which were predicted around the mouse and rabbit WAP gene in silico. Our studies have now shown that one of these MARs, located at +13 kb downstream of the WAP gene, was associated to the nuclear matrix through its interaction with Topoisomerase II. Four other MARs located at -14.5, -11, - 2.2, and +8.5 kb from the transcription start point of the WAP gene were identified in HC11 cells using macroarrays, specific to the mouse WAP locus. A fifth MAR, located at +3 kb downstream of the WAP gene, was only detected in non-induced HC11. These MARs may contribute to organization of the chromatin surrounding the WAP gene in several loops. The loop containing the WAP gene was larger in induced cells (10.7 kb) than that in non-induced cells (5.2 kb) and could explain the differential expression profile of the WAP gene. Two other MARs predicted in silico and located at - 16 and -7.4 kb may bind to SATB1. They may anchor the chromatin to the nuclear matrix in cells expressing this protein such as lymphoma or aggressive mammary tumor cells, and contribute to repressing expression of the WAP gene.VERSAILLES-BU Sciences et IUT (786462101) / SudocSudocFranceF

Hepatoprotective effect of Crocus sativus (saffron) petals extract against acetaminophen toxicity in male Wistar rats

Objectives: Acetaminophen (APAP) toxicity is known to be common and potentially fatal. This study aims to investigate the protective effects of hydroalcoholic extract, remaining from Crocus sativus petals (CSP) against APAP-induced hepatotoxicity by measuring the blood parameters and studying the histopathology of liver in male rats. Materials and Methods: Wister rats (24) were randomly assigned into four groups including: I) healthy, receiving normal saline; II) Intoxicated, receiving only APAP (600 mg/kg); III) pre-treated with low dose of CSP (10 mg /kg) and receiving APAP (600 mg/kg); IV) pre-treated with high dose of CSP (20 mg/kg) and receiving APAP (600 mg/kg). Results: The APAP treatment resulted in higher levels of alanine aminotransferase (ALT), aspartate aminotransferase (AST), and bilirubin, along with lower total protein and albumin concentration than the control group. The administration of CSP with a dose of 20 mg/kg was found to result in lower levels of AST, ALT and bilirubin, with a significant higher concentration of total protein and albumin. The histopathological results regarding liver pathology, revealed sever conditions including cell swelling, severe inflammation and necrosis in APAP-exposed rats, which was quiet contrasting compared to the control group. The pre-treated rats with low doses of ‍CSP showed hydropic degeneration with mild necrosis in centrilobular areas of the liver, while the same subjects with high doses of ‍CSP appeared to have only mild hepatocyte degeneration. Conclusions: Doses of 20 mg/kg of CSP ameliorates APAP–induced acute liver injury in rats. It was concluded that the antioxidant property of CSP resulted in reducing the oxidative stress complications of toxic levels of APAP in intoxicated rats

WAP expression is related to chromatin conformation, chromatin loop attachment to nuclear structures and nuclear localization of the gene

International audienceIntroduction: Whey Acidic Protein (WAP) and casein (CSN) gene expression is specific to the mammary gland (MG) and regulated by lactogenic hormones to peak during lactation. The mouse WAP gene is located between two genes constitutively expressed located 13 and 20 kb apart, whereas the five CSN genes are clustered within a 260 kb region. We have shown that the chromatin structure around the WAP gene plays a key role in the regulation of the mammary specific expression. We are now studying the role played by the nuclear localization of the gene in the regulation of gene expression in two different models (rabbit and mouse). Conclusion and perspectives: Mammary specific epigenetic modifications are established at early stages in the development. The factors involved in these modifications are currently being studied, with particular focus on hormonal and nutrition factors which may affect the development of the MG at puberty and thus have a long term effect on lactatio

WAP expression is related to chromatin conformation, chromatin loop attachment to nuclear structures and nuclear localization of the gene

International audienceIntroduction: Whey Acidic Protein (WAP) and casein (CSN) gene expression is specific to the mammary gland (MG) and regulated by lactogenic hormones to peak during lactation. The mouse WAP gene is located between two genes constitutively expressed located 13 and 20 kb apart, whereas the five CSN genes are clustered within a 260 kb region. We have shown that the chromatin structure around the WAP gene plays a key role in the regulation of the mammary specific expression. We are now studying the role played by the nuclear localization of the gene in the regulation of gene expression in two different models (rabbit and mouse). Conclusion and perspectives: Mammary specific epigenetic modifications are established at early stages in the development. The factors involved in these modifications are currently being studied, with particular focus on hormonal and nutrition factors which may affect the development of the MG at puberty and thus have a long term effect on lactatio

Organisation nucléaire et expression des gènes des protéines du lait

L'expression des gènes codant les protéines du lait varie au cours de la gestation/lactation. Elle est notamment régulée par les hormones lactogènes qui induisent une activation de nombreux facteurs de transcription. Outre l'activité de ces facteurs, modulant leurs capacités de liaison à leurs séquences cibles, l'interaction de ces facteurs avec l'ADN est régie par des variations de la structure chromatinienne. Dans le noyau des cellules épithéliales mammaires, l'organisation tridimensionnelle des boucles de chromatine, structures limitées par des régions d'attachement à la matrice nucléaire, est en cours d'analyse. Les principaux composants du lait sont organisés en structures supramoléculaires. Les globules gras sont constitués d'un noyau de triglycérides enveloppé par une membrane tripartite dérivant de différents compartiments cellulaires. Les caséines, protéines majoritaires du lait, forment un agrégat: la micelle de caséines. Leur agrégation progressive dans la voie de sécrétion débute dès le réticulum endoplasmique. Les mésostructures du globule gras et de la micelle restent à préciser. Notre objectif est de progresser dans la connaissance des mécanismes moléculaires et cellulaires qui président à l'élaboration de ces produits du lait