Conception de ligands protéiques par bioinformatique et modélisation moléculaire

L accroissement des connaissances, structurales et fonctionnelles, des protéines nous donne désormais une vision plus précise des phénomènes d interaction. Ce travail présente le développement d une nouvelle méthode de conception de ligands protéiques, laquelle repose sur le transfert d un groupe de résidus, appartenant à un ligand connu et contribuant de façon importante à la liaison avec une cible d intérêt, sur une protéine hôte, de moins de 100 résidus (mini-protéines). Ces protéines hôtes sont identifiées de manière systématique dans la Protein Data Bank . L approche a été appliquée pour le développement de ligands du canal Kv1.2. Trois ligands, possédant des constantes d inhibition micromolaires, ont été ainsi conçus.The increasing structural and functional knowledge of proteins gives us a clearer idea of how they interact. This work presents the development of a new method enabling the design of protein ligands based on the transfer of a set of aminoacids of a known ligand, contributing to the binding of a choosen target on an host protein, containing less than 100 residues (mini-proteins). These host proteins are identified from the Protein Data Bank in a systematic manner. This approach has been applied to the development of new ligands of the Kv1.2 channel. Three ligands have been designed with inhibition constants in the micromolar range.PARIS-Museum Hist.Naturelle (751052304) / SudocSudocFranceF