Estimation of transmission parameters of a fluoroquinolone-resistant Escherichia coli strain between pigs in experimental conditions

Antimicrobial resistance is of primary importance regarding public and animal health issues. Persistence and spread of resistant strains within a population contribute to the maintenance of a reservoir and lead to treatment failure. An experimental trial was carried out to study the horizontal transmission of a fluoroquinolone-resistant Escherichia coli strain from inoculated to naïve pigs. All naïve contact pigs had positive counts of fluoroquinolone-resistant E. coli after only two days of contact. Moreover, re-infections of inoculated pigs caused by newly contaminated animals were suspected. A maximum likelihood method, based on a susceptible-infectious-susceptible (SIS) model, was used to determine the transmission parameters. Two transmission levels were identified depending on the quantity of bacteria shed by infected individuals: (i) low-shedders with bacterial counts of resistant E. coli in the faeces between 5*103 and 106 CFU/g (βL = 0.41 [0.27; 0.62]), (ii) high shedders with bacterial counts above 106 CFU/g (βH = 0.98 [0.59; 1.62]). Hence, transmission between animals could be pivotal in explaining the persistence of resistant bacteria within pig herds

Identification et caractérisation du danger d'un contaminant alimentaire, l'acrylamide, par l'étude de la génotoxicité, de l'hépatocancérogénicité et de la biodisponibilité orale chez le rat et le porc

La découverte d'acrylamide néoformé dans certains aliments a amené les autorités sanitaires à réévaluer le risque lié à l'exposition du consommateur. L'acrylamide est génotoxique et classé probablement cancérigène chez l'homme. Nous avons confirmé l'origine génotoxique (adduits et lésions de l'ADN) des tumeurs du cerveau et des testicules chez le rat. Bien que des adduits soient aussi observés dans le foie, l'acrylamide n'est pas hépatocancérigène chez le rat dans un test d'initiation/promotion de Solt et Farber. Une réparation efficace des dommages à l'ADN, une faible mutagénicité et/ou un taux trop faible d'adduits pourraient expliquer l'absence de cancérogenicité dans le foie. La toxicocinétique de l'acrylamide chez le rat et le porc a montré des différences interespèces dans le métabolisme de ce contaminant. La biodisponibilité orale modérée de l'acrylamide néoformé chez le rat devrait être prise en compte dans la caractérisation du danger et l'évaluation du risque chez l'homme.RENNES1-BU Sciences Philo (352382102) / SudocSudocFranceF

A global approach to method validation and measurement uncertainty

International audienceThe enforcement of legal limits for food safety raises the question of decision-making in the context of uncertain measurements. It also puts the question of demonstrating that measurement technique that is used is fit for the purpose of controlling legal limits. A recent European Commision (EC) decision gives some indications how to deal with this question. In the meantime, the implementation of quality systems in analytical laboratories is now a reality. While these requirements deeply modified the organization of the laboratories, it has also improved the quality of the results. The goal of this communication is to describe how two fundamental requirements of ISO 17025 standard, i.e. validation of the methods and estimation of the uncertainty of measurements, can give a way to check whether an analytical method is correctly fit for the purpose of controlling legal limits. Both these requirements are not independent and it will be shown how they can be combined. A recent approach based on the "accuracy profile" of a method was applied to the determination of acrylamide and illustrates how uncertainty can be simply derived from the data collected for validating the method. Moreover, by basing on the beta-expectation tolerance interval introduced by Mee [Technometrics (1984) 26(3): 251-253], it is possible to unambiguously demonstrate the fitness for purpose of a method. Remembering that the expression of uncertainty of the measurement is also a requirement for accredited laboratories, it is shown that the uncertainty can be easily related to the trueness and precision issuing from the data collected to build the method accuracy profile. The example presented here consists in validating a method for the determination of acrylamide in pig plasma by liquid chromatography-mass spectromery (LC-MS). Concentrations are expressed as mg/l and instrumental response is peak surface. The calibration experimental design included 5x5x2 measurements and namely consisted in preparing duplicate standard solutions at five concentration levels ranging from 10 to about 5000 mg/l. This was repeated for 5 days. The validation experimental design was similar

DEFINITIONS OF ANTIMICROBIAL RESISTANCE IN VETERINARY MEDICINE: EPIDEMIOLOGICAL OR PROGNOSTIC

The definition of antibiotic resistance in bacteria differs if it is seen from the viewpoint of the bacteriologist and the epidemiologist, or of the clinician and the pharmacologist. The standardization by the European Union Committee on antimicrobial susceptibility testing (EUCAST) led to more accurate definitions. This committee defined critical concentrations based on pharmacological approaches and clinical outcomes, and on the variability of exposure of the treated subjects. In France, the values used for veterinary antibiograms are based on epidemiological data. New funding is necessary to move to the next stage and use all available data to define clinical resistance in veterinary medicine.Les définitions de la résistance des bactéries aux antibiotiques dépendent des points de vue du bactériologiste et de l'épidémiologiste ou du clinicien et du pharmacologue. Les travaux de standardisation du comité de l'Union Européenne des tests de sensibilité aux antimicrobiens (EUCAST) les ont rendues plus précises. Aujourd'hui, ce comité définit des concentrations critiques pour les catégories cliniques de résistance, en intégrant les approches pharmacologiques et les résultats cliniques et en tenant compte de la variabilité de l'exposition des sujets traités. En France, la définition retenue pour les antibiogrammes vétérinaires est uniquement de nature épidémiologique. Une mobilisation de moyens est nécessaire pour passer au stade suivant et intégrer l'ensemble des informations dans la définition de la résistance clinique applicable à la médecine vétérinaire

La validation des méthodes de détection des agents pathogènes dans les plantes

National audienc

La validation des méthodes de détection des agents pathogènes dans les plantes

National audienc

Antibiotic residue survey contribution of mass analytical methods to identification of contaminants

La surveillance des résidus de médicaments vétérinaires est réglementée par une directive européenne dans laquelle sont définies les méthodes utilisables pour la détection et la confirmation des résidus. Les méthodes biologiques ( microbiologiques ou immunologiques) sont largement utilisées en routine pour effectuer un dépistage des antibiotiques dans les échantillons prélevés. La confirmation des échantillons positifs est effectuée au moyen de méthodes analytiques basées sur la chromatographic liquide haute performance associée à des détecteurs de masse (SM). Les avantages proposés par cette technologie sont nombreux. La préparation des échantillons est simplifiée, ce qui se traduit par des gains de temps d’analyse, mais également par une augmentation de la fiabilité des résultats. Un autre point majeur est l’identification sans discussion de la molécule trouvée. La réglementation européenne a défini pour cette technologie des critères simples et précis permettant une identification des molécules autorisées ou interdites. Cette technologie est applicable à tout type de matrice, quelles soient complexes (graisse, muscle, foie, miel, etc.) ou non. De même, cette technique peut être utilisée pour rechercher des résidus d’antiparasitaires, des hormones et bêta-agonistes, d’anti-inflammatoire non stéroïdien et de pesticides. En conclusion, la spectrométrie de masse est un outil majeur dans la surveillance des résidus. Elle permet de confirmer sans discussion la présence de résidus et de déterminer si leur concentration est supérieure à la LMR.Antibiotic residue surveys are defined by a European legislation where analytical methods for screening and confirmatory residue analyses are codified. For screening antibiotic residues, mainly biological methods such as microbiological (fourth plate method) or immunological (Biosensor method) methods are used. In terms of confirmation of residue samples, positive samples are confirmed by a method based on liquid chromatography with MS Mass spectrometry detection. These methods offer many advantages. One advantage is that extraction of residues from biological samples is simplified, reducing the cost of analysis and increasing the reliability of the results. Another advantage is the identification of the antibiotic compound which leads to residues. The European community has defined clear-cut criteria that allow identification of authorised and banned compounds. The methods can be used in any biological tissue or matrix ( fat, muscle, liver, honey). Residues of many different compounds can be detected and identified by these methods such as in the case of antiparasitic drugs, hormones, beta-agonists, NSAIDs or pesticides. In conclusion, we make the case that especially MS is a main tool in performing drug residue surveys. It can identify the presence of residue in positive samples and quantify if the level present is above the autorised MRL (maximum residue limit)

Evaluation non invasive des taux instantanes de secretions hormonales: application a l'etude des relations secretions endocrines et comportement

INIST T 77282 / INIST-CNRS - Institut de l'Information Scientifique et TechniqueSIGLEFRFranc

Cinetique d'absorption de l'astaxanthine et la canthaxanthine apres ingestion de doses individuelles par la truite arc-en-ciel Oncorhynchus mykiss

National audienc

Impact of Therapeutic Treatment with β-Lactam on Transfer of the blaCTX-M-9 Resistance Gene from Salmonella enterica Serovar Virchow to Escherichia coli in Gnotobiotic Rats▿

The conjugative transfer of the plasmid carrying the blaCTX-M-9 gene from Salmonella enterica serovar Virchow isolated from a chicken farm to a recipient Escherichia coli strain was evaluated in vitro and in axenic rats inoculated with both strains, with or without selective pressure due to therapeutic doses of cefixime. The transfer of the blaCTX-M-9 gene of S. enterica serovar Virchow to E. coli was confirmed in vitro, at a low frequency of 5.9 × 10−8 transconjugants/donors. This transfer rate was higher in gnotobiotic rats and reached ∼10−5 transconjugants/donors without selective pressure. This frequency was not affected by the addition of therapeutic doses of cefixime. Thus, estimates of in vitro transfer underestimated potential transfer in the digestive tract, and therapeutic doses of cefixime did not increase the selection for transconjugants