23 research outputs found
A Urbanização Compromete a Qualidade da Água da Bacia Hidrográfica dos Rios Vacacaí e Vacacaí-mirim em SantaMaria, RS
http://dx.doi.org/10.5902/2179460X17395The hydrographic basin of the rivers Vacacaí and Vacacaí-Mirim, in Santa Maria, RS, Brazil, is subjected to strong anthropic influence, and the study here described aimed at evaluating water quality in these rivers using physical and chemical analyses. Water samples were collected in six sampling stations, monthly for 12 months (June 2011 to June 2012). Biochemical oxygen demand (BOD), chemical oxygen demand (COD), pH, suspended solids (SS), conductivity, turbidity and dissolved oxygen were measured. The results were compared to the classes of water use given by the National Environment Council in the Resolution 357/2005. A principal components analysis (PCA) was performed in order to identify the interaction among the abiotic variables. A spatial association of the variables was visible, rather than grouping by sampling date, indicating effects of urbanization on water quality.A bacia hidrográfica do rio Vacacaí no município de Santa Maria possui em alguns pontos grande influência antrópica, com isso esse trabalho foi conduzido com o objetivo de avaliar a qualidade das águas nessa bacia hidrográfica por meio de variáveis físicas e químicas da água. As amostras foram coletadas em seis pontos e a avaliação foi feita através da determinação de parâmetros físicos e químicos durante um período de doze meses (junho de 2011 a junho de 2012). Efetuou-se análises de demanda bioquímica de oxigênio (DBO5), demanda química de oxigênio (DQO), pH, sólidos suspensos (SS), condutividade, turbidez e oxigênio dissolvido. Os parâmetros foram comparados com as classes de uso da água prevista na resolução do Conselho Nacional de Meio Ambiente (CONAMA 357/2005). Foi realizada uma análise de componentes principais (PCA) utilizando o programa PC-ORD, visando identificar o efeito das variáveis abióticas. Pode-se observar uma associação espacial dos parâmetros em relação às amostragens, evidenciando os efeitos da urbanização na qualidade da água
A Urbanização Compromete a Qualidade da Água da Bacia Hidrográfica dos Rios Vacacaí e Vacacaí-mirim em SantaMaria, RS
http://dx.doi.org/10.5902/2179460X17395The hydrographic basin of the rivers Vacacaí and Vacacaí-Mirim, in Santa Maria, RS, Brazil, is subjected to strong anthropic influence, and the study here described aimed at evaluating water quality in these rivers using physical and chemical analyses. Water samples were collected in six sampling stations, monthly for 12 months (June 2011 to June 2012). Biochemical oxygen demand (BOD), chemical oxygen demand (COD), pH, suspended solids (SS), conductivity, turbidity and dissolved oxygen were measured. The results were compared to the classes of water use given by the National Environment Council in the Resolution 357/2005. A principal components analysis (PCA) was performed in order to identify the interaction among the abiotic variables. A spatial association of the variables was visible, rather than grouping by sampling date, indicating effects of urbanization on water quality.A bacia hidrográfica do rio Vacacaí no município de Santa Maria possui em alguns pontos grande influência antrópica, com isso esse trabalho foi conduzido com o objetivo de avaliar a qualidade das águas nessa bacia hidrográfica por meio de variáveis físicas e químicas da água. As amostras foram coletadas em seis pontos e a avaliação foi feita através da determinação de parâmetros físicos e químicos durante um período de doze meses (junho de 2011 a junho de 2012). Efetuou-se análises de demanda bioquímica de oxigênio (DBO5), demanda química de oxigênio (DQO), pH, sólidos suspensos (SS), condutividade, turbidez e oxigênio dissolvido. Os parâmetros foram comparados com as classes de uso da água prevista na resolução do Conselho Nacional de Meio Ambiente (CONAMA 357/2005). Foi realizada uma análise de componentes principais (PCA) utilizando o programa PC-ORD, visando identificar o efeito das variáveis abióticas. Pode-se observar uma associação espacial dos parâmetros em relação às amostragens, evidenciando os efeitos da urbanização na qualidade da água
Hepatic endotheliitis in Golden Syrian hamsters (Mesocricetus auratus) experimentally infected with SARS-CoV-2
Hepatic injuries in COVID-19 are not yet fully understood and indirect pathways (without viral replication in the liver) have been associated with the activation of vascular mechanisms of liver injury in humans infected with SARS-CoV-2. Golden Syrian hamsters are an effective model for experimental reproduction of moderate and self-limiting lung disease during SARS-CoV-2 infection. As observed in humans, this experimental model reproduces lesions of bronchointerstitial pneumonia and pulmonary vascular lesions, including endotheliitis (attachment of lymphoid cells to the luminal surface of endothelium). Extrapulmonary vascular lesions are well documented in COVID-19, but such extrapulmonary vascular lesions have not yet been described in the Golden Syrian hamster model of SARS-CoV-2 infection. The study aimed to evaluate microscopic liver lesions in Golden Syrian hamsters experimentally infected with SARS-CoV-2. In total, 38 conventional Golden Syrian hamsters, divided into infected group (n=24) and mock-infected group (n=14), were euthanized at 2-, 3-, 4-, 5-, 7-, 14-, and 15-days post infection with SARS-CoV-2. Liver fragments were evaluated by histopathology and immunohistochemical detection of SARS-CoV-2 Spike S2 antigens. The frequencies of portal vein endotheliitis, lobular activity, hepatocellular degeneration, and lobular vascular changes were higher among SARS-CoV-2-infected animals. Spike S2 antigen was not detected in liver. The main results indicate that SARS-CoV-2 infection exacerbated vascular and inflammatory lesions in the liver of hamsters with pre-existing hepatitis of unknown origin. A potential application of this animal model in studies of the pathogenesis and evolution of liver lesions associated with SARS-CoV-2 infection still needs further evaluation
Calpeptin is a potent cathepsin inhibitor and drug candidate for SARS-CoV-2 infections
Several drug screening campaigns identified Calpeptin as a drug candidate against SARS-CoV-2. Initially reported to target the viral main protease (Mpro), its moderate activity in Mpro inhibition assays hints at a second target. Indeed, we show that Calpeptin is an extremely potent cysteine cathepsin inhibitor, a finding additionally supported by X-ray crystallography. Cell infection assays proved Calpeptin’s efficacy against SARS-CoV-2. Treatment of SARS-CoV-2-infected Golden Syrian hamsters with sulfonated Calpeptin at a dose of 1 mg/kg body weight reduces the viral load in the trachea. Despite a higher risk of side effects, an intrinsic advantage in targeting host proteins is their mutational stability in contrast to highly mutable viral targets. Here we show that the inhibition of cathepsins, a protein family of the host organism, by calpeptin is a promising approach for the treatment of SARS-CoV-2 and potentially other viral infections
DIVERSIDADE CLONAL DE CUTIBACTERIUM ACNES EM AMOSTRAS DE TECIDO PROFUNDO DE PACIENTES SUBMETIDOS A CIRURGIAS PRIMÁRIAS NÃO INFECTADAS DE OMBRO
Introdução/Objetivo: A diversidade genômica e filogenética de Cutibacterium acnes tem sido identificada como potenciais marcadores de patogenicidade. Analisamos os isolados de C. acnes obtidos de amostras clínicas, para investigar suas características genéticas e filotípicas. Métodos: No total, 11 cepas de C. acnes foram identificados em amostras de tecidos profundos (bursa, osso e sinóvia) de pacientes submetidos a cirurgias limpas primárias de ombro que foram acompanhados prospectivamente por 2 anos. Os isolados foram submetidos a técnica de sequenciamento genômico completo (WGS) para identificar marcadores genômicos relevantes (genes de biofilme, resistência e patogenicidade). O DNA bacteriano foi purificado usando o kit ZymoBIOMICS DNA Miniprep e a concentração foi medida fluorímetro Qubit® 2.0. O sequenciamento foi realizado com o Ion torrent v2.0 da Thermo Fisher e todas as reações de sequenciamento seguiram as recomendações do fabricante. As sequências geradas foram então montadas, anotadas e analisadas de acordo por ferramentas de bioinformática. Resultados: O genoma completo dos isolados de C. acnes (todos multissensíveis) pertencem a quatro tipos diferentes de filotipo (IA1, IA2, IB and II) e quatro subtipos diferentes de SLST (H1, F1, A1 e K1), sendo que o H1 (tipo IB ST5 CC5) foi predominante em 72,7% (8/11). Em um paciente, foram identificadas duas cepas com filotipos diferentes, o tipo II (K1) e outro ao tipo IA2 (F1), sugerindo policlonalidade. Os seguintes genes marcadores de patogenicidade foram identificados, a lipoproteína LpqB, a chaperonina GroEL, os fatores de elongamento EF-Tu, EF-G e o fator CAMP, associados à produção de biofilme. Interessantemente, não foram detectados genes de fatores putativos de virulência, como tly e hyl, genes de resistência bacteriana e tampouco a presença de plasmídeos. Nenhuma infecção foi detectada no seguimento dos pacientes. Conclusão: Nossos resultados preliminares permitem concluir que os isolados de C. acnes são policlonais e possuem poucos marcadores de patogenicidade, além de genes formadores de biofilme. Mesmo prevalecendo os filotipos mais associados às infecções em implantes ortopédicos (IB e II), estes achados reforçam a possibilidade destas cepas serem provenientes da pele ao redor do campo operatório e terem sido inoculados durante o ato operatório. Sugerimos que a decisão de tratamento antibiótico nesta situação deve ser baseada em conjunto com a presença de sinais e sintomas de infecção