47 research outputs found

    Primer relevamiento de marcadores de resistencia a antibi贸ticos en Enterobacteriaceae en Cochabamba, Bolivia

    Get PDF
    Se llev贸 a cabo un relevamiento molecular de la resistencia a antibi贸ticos de importancia cl铆nica en aislamientos recuperados en Cochabamba, Bolivia. Se estudiaron los genes codificantes de 尾-lactamasas de espectro extendido y de resistencia a quinolonas de localizaci贸n plasm铆dica (PMQR) en un total de 101 aislamientos de enterobacterias resistentes a oximinocefalosporinas recuperados en distintos centros de salud, durante 4 meses (2012-2013). En todos ellos se detect贸 la presencia de cefotaximasas, las CTX-M grupo 1 fueron las m谩s prevalentes (88,1%). La presencia de blaOXA-1 se detect贸 en el 76,4% de estos aislamientos. Se observ贸 una elevada proporci贸n de aislamientos resistentes a quinolonas. El gen aac(6鈥)-Ib-cr fue el determinante PMQR m谩s frecuentemente identificado (83%). Adem谩s, 6 aislamientos resultaron ser portadores de qnrB. Por otro lado, cabe remarcar que 7 Escherichia coli presentaron qepA1 (6) y oqxAB (1); se documenta as铆 por primera vez la presencia de oqxAB en Bolivia. Este estudio constituye el primer relevamiento de marcadores de resistencia en aislamientos cl铆nicos de enterobacterias en Cochabamba, Bolivia; de este modo se contribuye al conocimiento regional de la situaci贸n epidemiol贸gica, la cual presenta un escenario similar al observado en el resto de Latinoam茅rica.A molecular survey was conducted in Cochabamba, Bolivia, to characterize the mechanism involved in the resistance to clinically relevant antibiotics. Extended Spectrum 尾-lactamase encoding genes and plasmid-mediated quinolone resistance (PMQR) markers were investigated in a total of 101 oxyimino-cephalosporin-resistant enterobacteria recovered from different health centers during four months (2012?2013). CTX-M enzymes were detected in all isolates, being the CTX-M-1 group the most prevalent (88.1%). The presence of blaOXA-1 was detected in 76.4% of these isolates. A high quinolone resistance rate was observed among the included isolates. The aac(6鈥)-Ib-cr gene was the most frequent PMQR identified (83.0%). Furthermore, 6 isolates harbored the qnrB gene. Interestingly, qepA1 (6) and oqxAB (1), were detected in 7 Escherichia coli, being the latter the first to be reported in Bolivia. This study constitutes the first molecular survey on resistance markers in clinical enterobacterial isolates in Cochabamba, Bolivia, contributing to the regional knowledge of the epidemiological situation. The molecular epidemiology observed herein resembles the scene reported in South America.Fil: Saba Villarroel, Paola M.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; ArgentinaFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; ArgentinaFil: Di Conza, Jos茅 Alejandro. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Universidad Nacional del Litoral. Facultad de Bioqu铆mica y Ciencias Biol贸gicas; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; ArgentinaFil: Radice, Marcela Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; Argentin

    In vitro antimicrobials activity against endemic Acinetobacter baumannii multiresistant clones

    Get PDF
    BACKGROUND: Multidrug-resistant strains of Acinetobacter baumannii have been reported increasingly around the world. The administration of an association of antibiotics has been proposed to create an active combination and to prevent the emergence of resistance. METHODOLOGY: The activity of colistin, rifampicin, gentamicin, imipenem and their associations was evaluated by means of killing curves in fourteen isolates belonging to three endemic PFGE types, in a university hospital of Buenos Aires city. The 14 isolates were selected on the basis of different mechanisms responsible for resistance to carbapenems and different susceptibility to colistin. RESULTS: The mechanism responsible for the resistance to imipenem was the production of OXA-23 and OXA-58 carbapenemases. Heteroresistance to colistin was observed in six isolates. The associations colistin-rifampicin and colistin-imipenem were synergistic in heteroresistant isolates and prevented the development of colistin-resistant mutants. The association imipenem-gentamicin was bactericidal in gentamicin susceptible isolates, whereas the association imipenem-rifampicin was always indifferent. CONCLUSION: The antimicrobial activity and the presence of synergy are related to the antimicrobials' susceptibilities irrespective of the PFGE type or the OXA-carbapenemase produced.Fil: Rodr铆guez, Carlos Hern谩n. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Bioqu铆mica Cl铆nica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; ArgentinaFil: De Ambrosio, Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; ArgentinaFil: Bajuk, Milena. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; ArgentinaFil: Spinozzi, Mariela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; ArgentinaFil: Nastro, Marcela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Bioqu铆mica Cl铆nica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; ArgentinaFil: Bombicino, Karina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Bioqu铆mica Cl铆nica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; ArgentinaFil: Radice, Marcela Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; ArgentinaFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; ArgentinaFil: Vay, Carlos. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Bioqu铆mica Cl铆nica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; ArgentinaFil: Famiglietti, 脕ngela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Bioqu铆mica Cl铆nica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; Argentin

    Primera detecci贸n de CMY-2 en Salmonella Heidelberg en Sudam茅rica

    Get PDF
    Salmonella enterica serovar Heidelberg ranks among the most prevalent causes of human salmonellosis in the United States and Canada, although it has been infrequently reported in South American and European countries. Most Salmonella infections are self-limiting; however, some invasive infections require antimicrobial therapy. In this work we characterized an oxyimino-cephalosporin resistant S. Heidelberg isolate recovered from an inpatient in a Buenos Aires hospital. CMY-2 was responsible for the 脽-lactam resistance profile. S. Heidelberg contained a 97 kb plasmid belonging to the Inc N group harboring blaCMY-2. ISEcp1 was located upstream blaCMY-2 driving its expression and mobilization. The isolate belonged to sequence type 15 and virotyping revealed the presence of sopE gene. In this study we identified the first CMY-2 producing isolate of S. Heidelberg in Argentina and even in South America.Salmonella enterica serovar Heidelberg es uno de los principales agentes causantes de salmonelosis en humanos en Estados Unidos y Canad谩, sin embargo, resulta infrecuente en los pa铆ses de Sudam茅rica y Europa. En este trabajo se caracteriz贸 un aislamiento de S. Heidelberg resistente a oximino-cefalosporinas recuperado de un paciente internado en un hospital de la Ciudad de Buenos Aires. Se evidenci贸 la presencia de un pl谩smido de 97 kb perteneciente al grupo de incompatibilidad IncN, portador del gen blaCMY-2. ISEcp1 fue localizado corriente arriba de blaCMY-2, promoviendo su expresi贸n y movilizaci贸n. El aislamiento de S. Heidelberg correspondi贸 al secuenciotipo 15 y en la virotipificaci贸n se detect贸 el gen sopE. En este trabajo describimos por primera vez la producci贸n de CMY-2 en una cepa de S. Heidelberg en nuestro pa铆s y Am茅rica Latina.Fil: Cejas, Daniela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; ArgentinaFil: Vignoli, Rafael. Universidad de la Rep煤blica; UruguayFil: Quinteros, Mirta. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Infecciosas F. J. Mu帽iz; ArgentinaFil: Marino, Ricardo. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Infecciosas F. J. Mu帽iz; ArgentinaFil: Callejo, Raquel. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Infecciosas F. J. Mu帽iz; ArgentinaFil: Betancor, Laura. Universidad de la Rep煤blica; UruguayFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; ArgentinaFil: Radice, Marcela Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; Argentin

    Emergence of ceftazidime/avibactam resistance in KPC-8鈥損roducing Klebsiella pneumoniae in South America

    Get PDF
    Klebsiella pneumoniae is one of the so-called ESKAPE pathogens. These organisms are the main cause of nosocomial infections worldwide, causing life-threatening infections amongst critically ill and immunocompromised individuals. They are characterized by drug resistance mechanisms. Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing isolates display resistance to multiple antimicrobial agents, usually including last-resort alternative options, leading to an urgent need to develop new drugs or combinations. In Argentina sequence type (ST) 258 harbouring bla KPC-2 emerged in 2010 and remained prevalent until the last few years, when the emergence of different STs such as ST25, ST11 and ST307 appeared likely to change the local epidemiology.Fil: Garc铆a, J.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; ArgentinaFil: Nastro, Marcela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; ArgentinaFil: Cejas, Daniela. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquimica. Instituto de Investigaciones En Bacteriologia y Virologia Molecular; ArgentinaFil: Santana, G.. No especif铆ca;Fil: Mancino, M.B.. No especif铆ca;Fil: Hidalgo, M.. No especif铆ca;Fil: Maccallini, G.. No especif铆ca;Fil: Vay, C.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; ArgentinaFil: Radice, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioquimica. Instituto de Investigaciones En Bacteriologia y Virologia Molecular; ArgentinaFil: Dabos, L.. Universit茅 Paris Sud; FranciaFil: Famiglietti, Angela Mar铆a Rosa. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; ArgentinaFil: Rodr铆guez, H.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; Argentin

    Characterisation of OXA-258 enzymes and AxyABM efflux pump in Achromobacter ruhlandii

    Get PDF
    Objectives: The aim of this study was to characterise OXA-258 variants and other features that may contribute to carbapenem resistance in Achromobacter ruhlandii. Methods: Kinetic parameters for purified OXA-258a and OXA-258b were determined measuring the rate of hydrolysis of a representative group of antimicrobial agents. Whole-genome shotgun sequencing was performed on A. ruhlandii 38 (producing OXA-258a) and A. ruhlandii 319 (producing OXA-258b), and in silico analysis of antimicrobial resistance determinants was conducted. Substrates of the AxyABM efflux pump were investigated by inhibition assays using phenylalanine-arginine 尾-naphthylamide (PA尾N). Outer membrane protein profiles were resolved by 12% sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis (SDS-PAGE). Results: Kinetic measurements of purified OXA-258 variants displayed an overall weak catalytic efficiency toward 尾-lactams. A detectable hydrolysis of imipenem was observed. In silico genomic analysis confirmed the presence of 32 and 35 putative efflux pump-encoding genes in A. ruhlandii strains 38 and 319, respectively. Complete sequences for AxyABM and AxyXY efflux pumps, previously described in Achromobacter xylosoxidans, were detected. Decreases in the MICs for chloramphenicol, nalidixic acid and trimethoprim/sulfamethoxazole were observed in the presence of the inhibitor PA尾N, suggesting that these antibiotics are substrates of AxyABM. AxyXY-encoding genes of A. ruhlandii 38 and A. ruhlandii 319 displayed 99% identity. No differences were observed in the outer membrane protein profiles. Conclusions: The contribution of OXA-258 enzymes to the final 尾-lactam resistance profile may be secondary. Further studies on other putative resistance markers identified in the whole-genome analysis should be conducted to understand the carbapenem resistance observed in A. ruhlandii.Fil: Papalia, Mariana Andrea. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Traglia, German Matias. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Ruggiero, Melina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Almuzara, Marisa. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; ArgentinaFil: Vay, Carlos Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; ArgentinaFil: Ram铆rez, Mar铆a Soledad. California State University; Estados UnidosFil: Radice, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentin

    Changing Epidemiology of Extended-Spectrum 尾-Lactamases in Argentina: Emergence of CTX-M-15

    Get PDF
    A multicenter survey, carried out in 2010 in Argentina, showed an increased prevalence of extended-spectrum p-lactamase (ESBL)-producing enterobacteria, with some changes in the molecular epidemiology of circulating ESBLs. While enzymes of the CTX-M-2 group remain endemic, the emergence of CTX-M-15 and of enzymes of the CTX-M-8 and CTX-M-9 groups was observed. The CTX-M-15-positive isolates represented 40% of CTX-M producers and included representatives of Escherichia coli ST131 and Klebsiella pneumoniae ST11.Fil: Sennati, S.. Universit脿 degli Studi di Siena; ItaliaFil: Santella, G.. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; ArgentinaFil: Di Conza, Jos茅 Alejandro. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Pallecchi, L.. Universit脿 degli Studi di Siena; ItaliaFil: Pino, Maryl煤. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Ghiglione, Barbara. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Rossolini, G.M.. Universit脿 degli Studi di Siena; ItaliaFil: Radice, Marcela Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; Argentin

    Changing Epidemiology of KPC Producing Klebsiella pneumoniae in Argentina: Emergence of Hypermucoviscous ST25 and High Risk Clone ST307

    Get PDF
    Objectives: To assess the epidemiological features of 76 Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)-producing Klebsiella pneumoniae (KPC-Kp) isolates recovered from three hospitals in Buenos Aires, Argentina, during 2015鈥2017. Methods: Antimicrobial susceptibilities were determined according to CLSI Clinical and Laboratoy Standards guidelines. Molecular typing of KPC-Kp was performed by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE)-Xbal and multilocus sequence typing. Plasmid encoded genes involved in carbapenem, fosfomycin and colistin resistance were detected by polymerase chain reaction (PCR) and sequencing. Also, mgrB inactivation was investigated in those colistin-resistant isolates. Genetic platforms involved in horizontal spread of blaKPC were investigated by PCR mapping. Results: Besides 尾-lactams, high resistance rates were observed for gentamycin, quinolones and trimethoprim-sulfamethoxazole. KPC-Kp sequence type (ST)258 corresponded to 26% of the isolates, while 42% corresponded to ST25. The other isolates were distributed in a diversity of lineages such as ST11 (10.5%), ST392 (10.5%), ST307, ST13, ST101, ST15 and ST551. blaKPC-2 was detected in 75 of 76 isolates, and one ST307 isolate harboured blaKPC-3. Tn4401 was identified as the genetic platform for blaKPC in epidemic lineages such as ST258 and ST307. However, in ST25 and ST392, which are usually not related to blaKPC, a blaKPC-bearing non-Tn4401 element was identified. Alterations in mgrB were detected in seven of 11 colistin-resistant isolates. Conclusions: Despite previous reports in Argentina, ST258 is no longer the absolute clone among KPC-Kp isolates. In the present study, dissemination of more virulent lineages such as the hypermucoviscous ST25 was detected. The emergence of the high-risk clone ST307 and occurrence of blaKPC-3 was noticed for the first time in this region.Fil: Cejas, Daniela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Elena, Alan Xavier. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Nu帽ez, Daiana Guevara. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones M茅dicas; ArgentinaFil: Platero, Priscila Sevillano. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Universidad del Salvador; ArgentinaFil: De Paulis, Adriana. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones M茅dicas; ArgentinaFil: Magari帽os, Francisco. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Agudos "D. F. Santojanni"; ArgentinaFil: Alfonso, Claudia. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital de Agudos "D. F. Santojanni"; ArgentinaFil: Berger, Mar铆a Alejandra. Hospital Aleman; ArgentinaFil: Fern谩ndez Canigia, Liliana. Hospital Aleman; ArgentinaFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Radice, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentin

    MALDI-TOF MS based procedure to detect KPC-2 directly from positive blood culture bottles and colonies.

    Get PDF
    In this study, we identified specific carbapenemase-producing isolates applying an easy and rapid protocol for the detection of mature KPC-2 尾-lactamase by MALDI-TOF MS from colony and positive blood culture bottles. In addition, we evaluated the correlation of the ~11,109 Da signal as a biomarker associated with KPC-2 production. A collection of 126 well-characterized clinical isolates were evaluated (including 60 KPC-2-producing strains). Presence of KPC-2 was assessed by MALDI-TOF MS on protein extracts. Samples were prepared using the double layer sinapinic acid technique. In order to identify mature KPC-2, raw spectra were analyzed focusing on the range between m/z 25,000鈥30,000 Da. A single distinctive peak, at approximately m/z 28,544 Da was found in all clinical and control KPC-2-producing strains, and consistently absent in the control groups (ESBL producers and susceptible strains). This peak was detected in all species independently of where the gene bla KPC-2 was embedded. Statistical results showed 100% sensitivity, CI95%: [94.0%; 100%] and 100% specificity, CI95%: [94.6%; 100%], indicating a promising test with a high discriminative power. KPC-2 尾-lactamase could be directly detected from both colonies and blood culture bottles. On the other hand, the m/z 11,109 Da signal determinant was only associated with 32% of Klebsiella pneumoniae and Escherichia coli KPC positive isolates. This MALDI-TOF MS methodology has the potential to detect directly the widespread and clinically relevant carbapenemase, KPC-2, in Enterobacterales with a straightforward, low cost process, assuming MALDI-TOF MS is already adopted as the main identification tool, with clear clinical implications on antibiotic stewardship for early infection treatment.Fil: Figueroa Espinosa, Roque Arnulfo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Costa, Agustina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; ArgentinaFil: Cejas, Daniela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Barrios, Rub茅n. No especif铆ca;Fil: Vay, Carlos Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Bioqu铆mica Cl铆nica; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Hospital de Cl铆nicas General San Mart铆n; ArgentinaFil: Radice, Marcela Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Di Conza, Jos茅 Alejandro. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; Argentin

    OXA-258 from Achromobacter ruhlandii: a Species Specific Marker

    Get PDF
    A new blaOXA-258 gene is described as species specific taxonomic marker for Achromobacter ruhlandii isolates (all recovered from cystic fibrosis patients). Even if the OXA-258 differs from OXA-114 variants, isolates could be misidentified as A. xiloxosidans by the amplification of an inner fragment from the OXA coding gene. A robust Identification of A. ruhlandii can be achieved by sequencing this single OXA gene as well as a more laborious recently proposed MLST scheme.Fil: Papalia, Mariana Andrea. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; ArgentinaFil: Almuzara, Marisa. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Bioqu铆mica Cl铆nica; ArgentinaFil: Cejas, Daniela. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; ArgentinaFil: Traglia, German Matias. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiolog铆a y Parasitolog铆a M茅dica. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Medicina. Instituto de Investigaciones en Microbiolog铆a y Parasitolog铆a M茅dica; ArgentinaFil: Ramirez, Maria Soledad. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay. Instituto de Investigaciones en Microbiolog铆a y Parasitolog铆a M茅dica; ArgentinaFil: Galanternik, Laura. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hosptal General de Ni帽os;Fil: Vay, Carlos Alberto. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Bioqu铆mica Cl铆nica; ArgentinaFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; ArgentinaFil: Radice, Marcela Alejandra. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas; Argentina. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a; Argentin

    Caracterizaci贸n completa de pl谩smidos provenientes de aislamientos de Achromobacter ruhlandii recuperados de un 煤nico paciente con fibrosis qu铆stica

    Get PDF
    Durante la 煤ltima d茅cada, Achromobacter spp. han sido asociadas con la colonizaci贸n cr贸nica en pacientes con fibrosis qu铆stica. Si bien Achromobacter xylosoxidans es la especie m谩s frecuentemente recuperada, otras especies como Achromobacter ruhlandii tambi茅n fueron reportadas en nuestra regi贸n. Sin embargo, pocos reportes se han centrado en la descripci贸n de elementos m贸viles, y ninguno de ellos los documenta en A. ruhlandii. El objetivo de este estudio fue reportar la caracterizaci贸n completa de un pl谩smido conservado en 4 aislamientos clonalmente relacionados de A. ruhlandii. Se recuperaron 9 aislamientos de A. ruhlandii entre 2013 y 2015 de un 煤nico paciente con fibrosis qu铆stica proveniente de un hospital pedi谩trico de Buenos Aires, Argentina. Se realiz贸 la secuenciaci贸n completa del genoma de los 4 aislamientos seleccionados seg煤n el perfil de resistencia antibi贸tica en un equipo Illumina MiSeq. Estos fueron anotados mediante RAST y curados manualmente. Se detect贸 la presencia de un solo pl谩smido de 34.096 pb y 50 CDS en los 4 aislamientos, observ谩ndose 煤nicamente un cambio nucleot铆dico traducido en un cambio aminoac铆dico en un aislamiento. Los pl谩smidos ensamblados se caracterizaron por presentar un integr贸n de clase 1 que conten铆a el gen aac- (6 )-Ib, un oper贸n de resistencia a mercurio y el sistema de toxina-antitoxina relE/stbE. Cabe destacar que estos pl谩smidos poseen un 79% de similitud y un 99% de identidad con el pl谩smido pmatvim-7 de Pseudomonas aeruginosa. Esta es la primera descripci贸n y caracterizaci贸n completa de un pl谩smido proveniente de A. ruhlandii.In the last decade Achromobacter spp. has been associated with chronic colonization in patients with cystic fibrosis (CF). Although Achromobacter xylosoxidans is the most frequent species recovered within this genus, other species such as A. ruhlandii have also been reported in these patients. Descriptions of mobile elements are scarce in Achromobacter and none of them have been originated in A. ruhlandii. The aim of this study was to report the full characterization of a plasmid which was maintained in four clonally related A. ruhlandii isolates. Between 2013 and 2015, nine A. ruhlandii isolates were recovered from a pediatric patient with CF at a hospital in Buenos Aires. Four selected clonally related isolates were sequenced by Illumina MiSeq, annotated using RAST and manually curated. The presence of a unique plasmid of 34096-bp and 50 CDS was observed in the four isolates, displaying only 1 nucleotide substitution translated into one amino acid change among them. These plasmids have a class 1 integron containing the aac-(6 )-Ib gene, a mercury resistance operon region and the relE/stbE toxin/antitoxin system. Plasmids showed 79% similarity and 99% identity with pmatvim-7 from Pseudomonas aeruginosa. This is the first full description and characterization of a plasmid from A. ruhlandii which was maintained over time.Fil: Steffanowski, Carla Giselle. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; ArgentinaFil: Papalia, Mariana Andrea. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Iriarte, Jorge Andr茅s. Universidad de la Rep煤blica; UruguayFil: Langleib, Mauricio. Universidad de la Rep煤blica; UruguayFil: Galanternik, Laura Irene. Gobierno de la Ciudad de Buenos Aires. Hospital General de Ni帽os "Ricardo Guti茅rrez"; ArgentinaFil: Gutkind, Gabriel Osvaldo. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Virolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; ArgentinaFil: Cooper, Vaughn. University of Pittsburgh; Estados UnidosFil: Ram铆rez, Mar铆a Soledad. California State University; Estados UnidosFil: Radice, Marcela Alejandra. Universidad de Buenos Aires. Facultad de Farmacia y Bioqu铆mica. Departamento de Microbiolog铆a, Inmunolog铆a y Biotecnolog铆a. C谩tedra de Microbiolog铆a; Argentina. Consejo Nacional de Investigaciones Cient铆ficas y T茅cnicas. Oficina de Coordinaci贸n Administrativa Houssay; Argentin
    corecore