A novel pathogenic MLH1 missense mutation, c.112A > C, p.Asn38His, in six families with Lynch syndrome

<p>Abstract</p> <p>Background</p> <p>An unclassified variant (UV) in exon 1 of the <it>MLH1 </it>gene, c.112A > C, p.Asn38His, was found in six families who meet diagnostic criteria for Lynch syndrome. The pathogenicity of this variant was unknown. We aim to elucidate the pathogenicity of this <it>MLH1 </it>variant in order to counsel these families adequately and to enable predictive testing in healthy at-risk relatives.</p> <p>Methods</p> <p>We studied clinical data, microsatellite instability and immunohistochemical staining of MMR proteins, and performed genealogy, haplotype analysis and DNA testing of control samples.</p> <p>Results</p> <p>The UV showed co-segregation with the disease in all families. All investigated tumors showed a microsatellite instable pattern. Immunohistochemical data were variable among tested tumors. Three families had a common ancestor and all families originated from the same geographical area in The Netherlands. Haplotype analysis showed a common haplotype in all six families.</p> <p>Conclusions</p> <p>We conclude that the <it>MLH1 </it>variant is a pathogenic mutation and genealogy and haplotype analysis results strongly suggest that it is a Dutch founder mutation. Our findings imply that predictive testing can be offered to healthy family members. The immunohistochemical data of MMR protein expression show that interpreting these results in case of a missense mutation should be done with caution.</p

Verkenning naar de samenhang van de Vogel- en Habitatrichtlijn en de Kaderrichtlijn Water : een analyse voor het vergroten van de synergie tussen de richtlijnen

This report explores the degree of coherence between the Birds and Habitats Directives and the Water Framework Directive. Based on the objectives, instruments, measures and evaluation methodologies of the European directives, this report describes where there is synergy, complementarity or incompatibility between the directives in Dutch policy practice. This analysis is based on a literature review, interviews and a workshop with stakeholders. Based on the results, the report identifies research questions relevant to the Netherlands Environmental Assessment Agency for further research to support their policy evaluations

Het bodemvoedselweb in het Markermeer : Over de rol van zwavelbacteriën – wormen - brasem

Deze literatuurstudie was niet allesomvattend. Daarvoor is er te veel literatuur beschikbaar om in korte tijd door te nemen. Wel is een beter beeld verkregen van de rol en onderlinge interacties van draadvormende zwavelbacteriën, wormen en vissen in het benthische deel van zoetwatermeren, in het bijzonder het Markermeer. Draadvormende, meercellige, kleurloze zwavelbacteriën vormen kolonies die in het sediment leven en zich manifesteren als uitgebreide matten en die de zuurstofloze zwavelhoudende dieper gelegen bodemlaag verbinden met de bovenliggende zuurstofhoudende laag. Elke cel van deze bacterie bevat een grote vloeistofvacuole die wordt gebruikt als opslag voor nitraat en zwavel. Het nitraat wordt gebruikt als een elektronenacceptor voor sulfide-oxidatie waarbij energie beschikbaar komt om organisch materiaal om te zetten in groei. De draadvormende zwavelbacterie is lang en sommige soorten vormen een schede waarbinnen de bacteriën tot diep in het sediment kunnen glijden en zich daarmee verplaatsen tussen de zuurstofhoudende (aerobe en nitraatbevattende) en de zuurstofloze (anaerobe en zwavelrijke) bodemlaag. In en op deze schede kunnen ook andere (zwavel)bacteriën voorkomen

De samenhang tussen de Kaderrichtlijn Water en de Vogel- en Habitatrichtlijn : een landelijke analyse en een verdiepende studie in zes deelgebieden

Based on a nationwide GIS analysis and research in six case study areas, this report investigates the policy coherence between the Water Framework Directive (WFD) and the Birds and Habitats Directives (BHD). Important factors that enable synergy between these directives are a mutual implementation deficit at site level and a good match between the abiotic requirements of BHD habitat types and species and the WFD water quality standards for the water types present in the site. The existence of an area-based planning process, good personal contacts between the individuals responsible for implementation at site level and regular consultation between them also determine whether synergy between these two policies is realised. Based on the findings, an indication is given of what evaluations and outlook studies should take into account in order to assess the synergy between these directives during their implementation