Antimicrobial resistance profiles in Enterococcus spp. isolates from fecal samples of wild and captive black capuchin monkeys (Sapajus nigritus) in South Brazil

The environment, human, and animals play an important role in the spread of antibioticresistant bacteria. Enterococci are members of the gastrointestinal tracts of humans and animals and represent important reservoirs of antibiotic resistance genes. Until today, few studies have examined antibiotic susceptibility in enterococci isolated from primates. Therefore, the present study investigated species distribution, antibiotic susceptibility, and resistance genes in enterococci isolated from wild and captive black capuchins monkeys (Sapajus nigritus) in Rio Grande do Sul, South Brazil. A total of 24 swabs/fecal samples were collected, including 19 from wild monkeys living in two forest fragments [São Sebastião do Caí (SSC) and Santa Cruz do Sul (SCS)], and five in captive [Parque Zoológico da Fundação Zoobotânica (ZOO)], between August 2016 and November 2017. Fifteen colonies were randomly selected from each sample. Enterococci were identified by MALDI-TOF, tested for susceptibility to 12 antibiotics; and screened for tet(S), tet(M), tet(L), msrC, and erm(B) genes by PCR. Two-hundred ninety-six enterococci were isolated (SSC n = 137; SCS n = 86; ZOO n = 73) and differences in Enterococcus species distribution were detected on three monkey groups, with low abundance in SCS (1 D = 0.2), followed by ZOO (1 D = 0.68), and SSC (1 D = 0.73). The enterococci frequently recovered include the following: Enterococcus faecalis (42.6%), E. hirae (29.1%), and E. faecium (15.9%). Antibioticnonsusceptible was observed in 202 (67.9%) strains. The rate of non-susceptibility to rifampicin, tetracycline, erythromycin, nitrofurantoin, chloramphenicol, and ampicillin was 46%, 26%, 22% and 19%, 13%, 0.3%, and 0.3%, respectively. All strains were susceptible to vancomycin, streptomycin, gentamycin, and linezolid. Forty-three (14.52%) isolates were identified as multidrug resistant (MDR), and the highest number of MDR enterococci were E. faecium recovered from wild monkeys living close to a hospital and water treatment plant. Elevated rates of antibiotic resistance genes msrC and tet(L) were isolates from ZOO. In conclusion, differences in the frequency of enterococci species, antibiotic-nonsusceptible and antibiotic resistance genes in all groups of monkeys were identified. These data suggest that anthropogenic activities could have an impact in the resistome of primate gut enterococci communities

Diversidade e perfil de susceptibilidade antimicrobiana de Enterococcus sp. isolados das águas do Arroio Dilúvio - Porto Alegre, RS, Brasil

The aim of this study was to determine the frequency enterococci species from Dilúvio stream, in Porto Alegre RS, and the antimicrobial susceptibility profiles of the isolates to antibiotics of human and veterinary importance. From March to December 2009, water samples were collected from the stream into five distinct points. Three hundred and forty eight enterococci were isolated from water samples collected at five points along the course of the creek flood and identified to the species level through their phenotypic profiles and PCR. The most frequent specie was E. faecium (68.67%), followed by E. faecalis (16.09%), E. casseliflavus (12.07%), E. hirae (2.58%) and E.gallinarum (0.57%). Points 1 and 3 showed no significant differences between the species. The antimicrobial susceptibility tests revealed that isolateswereresistant to erythromycin (81.07%), nitrofurantoin(37.26%), norfloxacin (34.82%), ciprofloxacin (32.55%), chloramphenicol (4.73), tetracycline (2.23%) and vancomycin (0.28%). There was a significant differences in the prevalence of antibiotic- resistant enterococci in the Points 4 and 5 (P <0.05). All isolates were susceptible to ampicillin and gentamicin. Species multiresistant to antibiotics were observed. The results of this study demonstrate that the flood waters of the stream can be a source of spread and persistence of resistant enterococci and their antibiotic resistance genes to humans and the environment, representing risks to the population.O objetivo do presente trabalho foi determinar a frequência das espécies de enterococos das águas do arroio Dilúvio, em Porto Alegre, RS, bem como avaliar o perfil susceptibilidade frente a antimicrobianos de importância clínica e veterinária. No período de março a dezembro de 2009, foram coletadas amostras de águas do arroio em cinco pontos distintos, as quais foram submetidas à avaliação microbiológica. Trezentos e quarenta e oito enterococos foram isolados das amostras de água coletadas nos cinco pontos ao longo do curso do arroio Dilúvio e identificados em nível de espécie por provas bioquímicas e PCR. A espécie E. faecium (68,67%) foi a mais frequente, seguida de E. faecalis (16,09%), E. casseliflavus (12,07%), E. hirae (2,58%) e E.gallinarum (0,57%). Nos pontos 1 e 3 não houve diferença significativa entre as espécies Os resultados dos testes de susceptibilidade aos antimicrobianos pelo método de difusão em disco revelaram que a maioria das bactérias era resistente a eritromicina (81,07%), nitrofurantoína (37,26%), norfloxacina (34,82%), ciprofloxacina (32,55%), cloranfenicol (4,73), tetraciclina (2,23%) e vancomicina (0,28%). Foi observada uma diferença significativa nos Pontos 4 e 5 quanto ao número médio de enterococos resistentes aos antibióticos testados (P= 0,0174).Todos os isolados foram sensíveis a ampicilina e a gentamicina. Espécies multirresistentes aos antimicrobianos foram observadas. Os resultados do presente estudo demonstram que as águas do arroio Dilúvio podem ser uma fonte de disseminação e persistência de enterococos resistentes e de seus genes de resistência aos antimicrobianos para os seres humanos e meio ambiente, representando riscos à população

Antimicrobial susceptibility profile of Enterococcussp. isolatedfrom Dilúvio stream waters, Porto Alegre, RS, Brazil

O objetivo do presente trabalho foi determinar a frequência das espécies de enterococos das águas do arroio Dilúvio, em Porto Alegre, RS, bem como avaliar o perfil susceptibilidade frente a antimicrobianos de importância clínica e veterinária. No período de março a dezembro de 2009, foram coletadas amostras de águas do arroio em cinco pontos distintos, as quais foram submetidas à avaliação microbiológica. Trezentos e quarenta e oito enterococos foram isolados das amostras de água coletadas nos cinco pontos ao longo do curso do arroio Dilúvio e identificados em nível de espécie por provas bioquímicas e PCR. A espécie E. faecium (68,67%) foi a mais frequente, seguida de E. faecalis (16,09%), E. casseliflavus (12,07%), E. hirae (2,58%) e E.gallinarum (0,57%). Nos pontos 1 e 3 não houve diferença significativa entre as espécies. Os resultados dos testes de susceptibilidade aos antimicrobianos pelo método de difusão em disco revelaram que a maioria das bactérias era resistente a eritromicina (81,07%), nitrofurantoína (37,26%), norfloxacina (34,82%), ciprofloxacina (32,55%), cloranfenicol (4,73), tetraciclina (2,23%) e vancomicina (0,28%). Foi observada uma diferença significativa nos Pontos 4 e 5 quanto ao número médio de enterococos resistentes aos antibióticos testados (P= 0,0174).Todos os isolados foram sensíveis a ampicilina e a gentamicina. Espécies multirresistentes aos antimicrobianos foram observadas. Os resultados do presente estudo demonstram que as águas do arroio Dilúvio podem ser uma fonte de disseminação e persistência de enterococos resistentes e de seus genes de resistência aos antimicrobianos para os seres humanos e meio ambiente, representando riscos à população.The aim of this study was to determine the frequency enterococci species from Dilúvio stream, in Porto Alegre RS, and the antimicrobial susceptibility profiles of the isolates to antibiotics of human and veterinary importance. From March to December 2009, water samples were collected from the stream into five distinct points. Three hundred and forty eight enterococci were isolated from water samples collected at five points along the course of the creek flood and identified to the species level through their phenotypic profiles and PCR. The most frequent specie was E. faecium (68.67%), followed by E. faecalis (16.09%), E. casseliflavus (12.07%), E. hirae (2.58%) and E.gallinarum (0.57%). Points 1 and 3 showed no significant differences between the species. The antimicrobial susceptibility tests revealed that isolateswereresistant to erythromycin (81.07%), nitrofurantoin (37.26%), norfloxacin (34.82%), ciprofloxacin (32.55%), chloramphenicol (4.73), tetracycline (2.23%) and vancomycin (0.28%). There was a significant differences in the prevalence of antibiotic-resistant enterococci in the Points 4 and 5 (P <0.0174). All isolates were susceptible to ampicillin and gentamicin. Species multiresistant to antibiotics were observed. The results of this study demonstrate that the flood waters of the stream can be a source of spread and persistence of resistant enterococci and their antibiotic resistance genes to humans and the environment, representing risks to the population

Diversidade de espécies e determinantes de resistência de Enterococcus sp. isolados de amostras orais de macacos-prego da espécie Sapajus nigritus oriundos do município de Santa Cruz do Sul, Rio Grande do Sul, Brasil

Enterococcus são bactérias gram-positivas encontradas de forma comensal no trato gastrointestinal de humanos e animais, sendo considerados microrganismos sentinela quando encontrados fora destes. Devido à estreita relação entre os primatas e os humanos e à falta de estudos sobre a microbiota oral de macacos-pregos da espécie Sapajus nigritus (S. nigritus) viu-se a necessidade de avaliar a diversidade de espécies de enterococos, o perfil de suscetilibidade a antimicrobianos e a presença de genes de resistência. Foram coletados suabes orais de seis macacos-pregos selvagens no município de Santa Cruz do Sul, Rio Grande do Sul, Brasil. O gênero e as espécies foram identificados pela reação em cadeia de polimerase (PCR). A suscetibilidade a antimicrobianos foi determinada pelo método de disco difusão em ágar e presença dos genes de resistência aac(6')-aph(2”), erm(A), erm(B), erm(C), mrsC, gyrA, tetL, tetM, tetS, vanA, vanB e vanC foi avaliada pela PCR. Noventa e seis isolados foram selecionados, sendo 64 cepas de enterocococos, destas 48 (75%) foram identificadas como E. faecalis, 12 (19%) como E. casseliflavus e 4 (6%) como E. hirae. As propriedades de resistência foram detectadas para rifampicina (27%), eritromicina (19%), quinolonas (8%) e nitrofurantoína (2%) e 37 (57,8%) cepas foram sensíveis aos dez antimicrobianos testados. Das 12 cepas com resistência intermediária a eritromicina nenhuma foi positiva para os genes erm(A), erm(B), erm(C) e mrsC. Em conclusão, diferentes espécies de enterococos fazem parte da microbiota oral de macacos-pregos e a presença de elementos de resistência podem estar relacionadas a fatores antropogênicos ou ter origem no resistoma ambiental.Enterococcus are gram-positive bacteria found in commensal form in the gastrointestinal tract of humans and animals, being sent sentinel microorganisms when found for these. Due to the close relationship between primates and humans and the lack of studies on an oral microbiota of capuchin monkeys of the species Sapajus nigritus (S. nigritus), it was necessary to evaluate the diversity of enterococci species, the susceptibility profile antimicrobials and the presence of resistance genes. Oral swabs were collected from six wild capuchin monkeys in the municipality of Santa Cruz do Sul, Rio Grande do Sul, Brazil. The genus and species as identified by the polymerase chain reaction (PCR). Antimicrobial susceptibility was determined by the agar diffusion method and the presence of resistance genes aac (6') - aph (2'), erm (A), erm (B), erm (C), mrsC, gyrA, tetL, tetM, tetS, vanA, vanB and vanC was evaluated by PCR. Ninety-six isolates were selected, of these 64 strains were identified as enterococci, and 48 (75%) were identified as E. faecalis, 12 (19%) as E. casseliflavus and 4 (6%) as E. hirae. Resistance properties were detected for rifampicin (27%), erythromycin (19%), quinolones (8%) and nitrofurantoin (2%) and 37 (57.8%) strains were sensitive to the ten antimicrobials tested. Of the 12 strains intermediate resistance to erythromycin, none were positive for the erm (A), erm (B), erm (C) and mrsC genes. In conclusion, different species of enterococci are part of the oral microbiota of capuchin monkeys and the presences of resistance elements could be related to anthropogenic factors or originate from the environmental resistome

Diversidade de espécies e determinantes de resistência de Enterococcus sp. isolados de amostras orais de macacos-prego da espécie Sapajus nigritus oriundos do município de Santa Cruz do Sul, Rio Grande do Sul, Brasil

Enterococcus são bactérias gram-positivas encontradas de forma comensal no trato gastrointestinal de humanos e animais, sendo considerados microrganismos sentinela quando encontrados fora destes. Devido à estreita relação entre os primatas e os humanos e à falta de estudos sobre a microbiota oral de macacos-pregos da espécie Sapajus nigritus (S. nigritus) viu-se a necessidade de avaliar a diversidade de espécies de enterococos, o perfil de suscetilibidade a antimicrobianos e a presença de genes de resistência. Foram coletados suabes orais de seis macacos-pregos selvagens no município de Santa Cruz do Sul, Rio Grande do Sul, Brasil. O gênero e as espécies foram identificados pela reação em cadeia de polimerase (PCR). A suscetibilidade a antimicrobianos foi determinada pelo método de disco difusão em ágar e presença dos genes de resistência aac(6')-aph(2”), erm(A), erm(B), erm(C), mrsC, gyrA, tetL, tetM, tetS, vanA, vanB e vanC foi avaliada pela PCR. Noventa e seis isolados foram selecionados, sendo 64 cepas de enterocococos, destas 48 (75%) foram identificadas como E. faecalis, 12 (19%) como E. casseliflavus e 4 (6%) como E. hirae. As propriedades de resistência foram detectadas para rifampicina (27%), eritromicina (19%), quinolonas (8%) e nitrofurantoína (2%) e 37 (57,8%) cepas foram sensíveis aos dez antimicrobianos testados. Das 12 cepas com resistência intermediária a eritromicina nenhuma foi positiva para os genes erm(A), erm(B), erm(C) e mrsC. Em conclusão, diferentes espécies de enterococos fazem parte da microbiota oral de macacos-pregos e a presença de elementos de resistência podem estar relacionadas a fatores antropogênicos ou ter origem no resistoma ambiental.Enterococcus are gram-positive bacteria found in commensal form in the gastrointestinal tract of humans and animals, being sent sentinel microorganisms when found for these. Due to the close relationship between primates and humans and the lack of studies on an oral microbiota of capuchin monkeys of the species Sapajus nigritus (S. nigritus), it was necessary to evaluate the diversity of enterococci species, the susceptibility profile antimicrobials and the presence of resistance genes. Oral swabs were collected from six wild capuchin monkeys in the municipality of Santa Cruz do Sul, Rio Grande do Sul, Brazil. The genus and species as identified by the polymerase chain reaction (PCR). Antimicrobial susceptibility was determined by the agar diffusion method and the presence of resistance genes aac (6') - aph (2'), erm (A), erm (B), erm (C), mrsC, gyrA, tetL, tetM, tetS, vanA, vanB and vanC was evaluated by PCR. Ninety-six isolates were selected, of these 64 strains were identified as enterococci, and 48 (75%) were identified as E. faecalis, 12 (19%) as E. casseliflavus and 4 (6%) as E. hirae. Resistance properties were detected for rifampicin (27%), erythromycin (19%), quinolones (8%) and nitrofurantoin (2%) and 37 (57.8%) strains were sensitive to the ten antimicrobials tested. Of the 12 strains intermediate resistance to erythromycin, none were positive for the erm (A), erm (B), erm (C) and mrsC genes. In conclusion, different species of enterococci are part of the oral microbiota of capuchin monkeys and the presences of resistance elements could be related to anthropogenic factors or originate from the environmental resistome